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二重微滴式数字PCR定量检测禽呼肠孤病毒和鸡滑液囊支原体方法的建立
作者姓名:谢志勤  谢芝勋  张艳芳  李小凤  范晴  谢丽基  万丽军  罗思思  李孟  张民秀  曾婷婷  黄娇玲  王盛  李丹  韦悠  任红玉  阮志华
作者单位:广西壮族自治区兽医研究所 广西兽医生物技术重点实验室 农业农村部中国-东盟(广西)跨境动物疫病防控重点实验室
基金项目:国家自然科学基金项目(31660715);;广西重点研发专项项目(桂科AB16380003);
摘    要:为绝对定量检测禽呼肠孤病毒(avian reovirus,ARV)和鸡滑液囊支原体(Mycoplasma synoviae,MS),本研究建立了二重微滴式数字PCR(ddPCR)。根据已发表的ARV S1基因和MS的VlhA基因序列保守序列,分别设计了针对S1和VlhA基因的特异引物和探针,通过优化引物和探针的浓度及反应条件后,建立了二重ddPCR定量检测ARV和MS方法,并对建立方法的特异性、敏感性和重复性进行测试。结果显示,优化后最佳的引物和探针浓度分别为1.2和0.35μmol/L,最佳退火温度为55℃。特异性检测结果只检出ARV和MS,没有检出其他对照的禽病病原。敏感性检测结果显示,该方法检测ARV及MS重组质粒DNA的检出限分别为微滴数6.3和5.4 copies/μL,检测方法的检出限与单重ddPCR最低检出限相同,敏感性比荧光定量PCR方法高10倍。对3个连续稀释的ARV和MS重组质粒DNA检测结果的变异系数均小于5%,重复性好。对92份病鸡关节囊、喉拭子及肺样品进行检测,二重ddPCR方法检出12份样品呈ARV阳性,9份样品呈MS阳性,其中2份样品呈ARV和MS阳性,A...

关 键 词:二重微滴式数字PCR  定量检测  禽呼肠孤病毒  鸡滑液囊支原体
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