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基于microRNA表达谱初步构建PLS-DA体液识别模型
引用本文:钱水,张晶晶,王致远,梁桑华.基于microRNA表达谱初步构建PLS-DA体液识别模型[J].刑事技术,2023(2):146-152.
作者姓名:钱水  张晶晶  王致远  梁桑华
作者单位:1. 佛山市公安局;2. 佛山市中医院
摘    要:针对外周血、唾液、精液、月经血、阴道分泌物这五种法医学常见的体液样本,采用二代测序(NGS)平台检测获得microRNA(miRNA)表达谱,使用偏最小二乘判别分析(PLS-DA)建立基于这五种体液的识别模型,并探讨PLS-DA在法医体液溯源中的应用价值。经优化小分子RNA文库制备过程,采用Ion Torrent S5 XL测序系统对前述法医学五种体液样本(每种10例)进行小RNA测序,以PLS-DA构建体液识别模型,评估不同数量miRNA标记组合下预测的准确性。本研究获得法医学常见五种体液样本的miRNA表达谱,外周血与月经血中表达量前10名的miRNAs有6个重叠;唾液和阴道分泌物中表达量前10名的miRNAs有4个重叠。基于全数据集、107个和11个miRNAs构建的体液来源识别模型的准确率分别为0.95、0.94、0.89。本研究通过NGS测序分析获得了五种体液样本的miRNA组(miRNome),利用PLS-DA初步构建了体液识别模型,对于应用miRNome进行体液识别的相关研究具有参考价值。

关 键 词:法医遗传学  体液溯源  RNA测序(RNA-seq)  最小二乘判别分析(PLS-DA)  微小RNA(microRNA)
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