mtDNA高变区测序结果的比对和统计

为了更方便高效地进行线粒体DNA高变区测序结果的分析统计 ,利用Internet上的共享资源 ,建立了两种普通PC机上可以实现的分析途径 :一种是利用bioedit软件对测序文件进行读取、校正 ,然后转换为文本文件导入MicrosoftExcel与Anderson标准序列进行比对并进行相应突变位置、变异碱基筛选、单倍型频率和基因多样性等的统计。另一种是利用Chromas、Seqvert er、Clustalx和Genedoc软件对线粒体DNA与标准序列进行比对 ,确定突变的位置和数目。两种途径所用的软件界面简单明了 ,结果直观明确 ,对线粒体DNA的分析统计有很强的实用意义。