| 猪繁殖与呼吸综合征病毒Myanmar株全基因序列的测定与遗传变异分析 |
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| 引用本文： | 岳晓娟,胡冬梅,张倩,周智,遇秀玲,杨仕标,翟新验,胡永浩,田克恭. 猪繁殖与呼吸综合征病毒Myanmar株全基因序列的测定与遗传变异分析[J]. 中国兽医科学, 2012, 0(8): 802-808 |
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| 作者姓名： | 岳晓娟 胡冬梅 张倩 周智 遇秀玲 杨仕标 翟新验 胡永浩 田克恭 |
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| 作者单位： | 甘肃农业大学动物医学院;中国动物疫病预防控制中心兽医诊断室;云南省畜牧兽医科学研究院 |
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| 基金项目： | 国家科技基础性工作专项(2008FY130100-2);国家科技支撑计划项目(2009BADB4B05-3);现代农业产业技术体系北京市创新团队建设项目(GW2J-2009-05) |
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| 摘 要： | 2010年首次从缅甸某发病猪场采集的疑似猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and re-spiratory syndrome,PRRS)病料中分离到一株PRRSV,命名为PRRSV Myanmar株。应用RT-PCR方法分段扩增出Myanmar株的各基因片段,并将扩增产物分别连接到pEASY-T3载体并进行测序。序列测定结果表明,Myanmar株基因组全长15 411bp(不包括PolyA尾),包含10个开放阅读框,5′UTR长189nt,3′UTR长151nt。全基因序列与经典PRRSV VR2332株核苷酸序列的一致性为99.3%,与高致病性PRRSV NVDC-JXA1株核苷酸序列的一致性为89.5%。在非结构蛋白Nsp2区域并未出现特征性的30个氨基酸的缺失,而与欧洲型标准毒株(LV)核苷酸序列的一致性为54.6%。上述结果说明Myanmar株在基因型上属于经典美洲型。同时,遗传进化树分析显示,Myanmar株与PRRSV 01NP1.2株、RespMLV株、BJ-4株及PL97-1株的亲缘关系最近。
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| 关 键 词： | 猪繁殖与呼吸综合征病毒 Myanmar毒株 全基因组 序列测定 遗传进化树 |
Sequencing and genetic variation analysis of whole genome of porcine reproductive and respiratory syndrome virus Myanmar strain |
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| YUE Xiao-juan,HU Dong-mei,ZHANG Qian,ZHOU Zhi,YU Xiu-ling,YANG Shi-biao,ZHAI Xin-yan,HU Yong-hao,TIAN Ke-gong. Sequencing and genetic variation analysis of whole genome of porcine reproductive and respiratory syndrome virus Myanmar strain[J]. Chinese Veterinary Science, 2012, 0(8): 802-808 |
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| Authors: | YUE Xiao-juan HU Dong-mei ZHANG Qian ZHOU Zhi YU Xiu-ling YANG Shi-biao ZHAI Xin-yan HU Yong-hao TIAN Ke-gong |
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| Affiliation: | 1.College of Veterinary Medicine,Gansu Agricultural University,Lanzhou 730070,China;2.National Veterinary Diagnostic Center,China Animal Disease Control Center,Beijing 100094,China;3.Yunnan Province Academy of Animal Science and Veterinary Medicine,Kunming 650224,China) |
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