叶尔羌河流域鲁道夫对盲囊线虫的分子鉴定及遗传多样性分析

为评估叶尔羌河流域塔里木裂腹鱼体内寄生的鲁道夫对盲囊线虫（Contracaecum rudolphii）群体遗传多样性水平，本研究采用PCR方法测定叶尔羌河、塔什库尔干河、下坂地水库3个地区52条对盲囊线虫的ITS-1和COⅠ基因序列，对其基因序列及遗传结构进行鉴别分析。结果显示，基于ITS-1序列叶尔羌河流域塔里木裂腹鱼体内对盲囊线虫被鉴定为鲁道夫对盲囊线虫B种（C. rudolphii B），利用COⅠ序列共检测出30个单倍型，其中共享单倍型1种。多样性分析显示，3个群体的整体单倍型多样性（Hd）和核苷酸多样性（Pi）分别为0.931和0.009 67。系统进化树和单倍型网络结构表明，3个群体间单倍型随机地聚集在一起，没有形成明显的空间地理格局。群体遗传结构和分子方差分析表明，3个群体间遗传距离较小且呈弱分化水平，鲁道夫对盲囊线虫B种的分化主要来自于群体内部。研究结果表明，叶尔羌河流域3个不同地理群体的鲁道夫对盲囊线虫B种均属高遗传多样性群体，各群体间基因交流频繁，没有形成特定的地理遗传结构，正处于稳定扩增状态，本研究旨在为保护其宿主塔里木裂腹鱼种质资源提供理论依据。