婴儿猝死综合征与婴儿感染性猝死共同相关基因的筛选及其调控网络的生物信息学分析

目的 应用生物信息学方法筛选出经尸体检验确诊的婴儿猝死综合征（sudden infant death syndrome,SIDS）和婴儿感染性猝死（infectious sudden death in infancy,ISDI）死者脑、心脏和肝组织中共有的差异表达mRNA，探讨SIDS与ISDI的共有分子标记和发生机制。方法下载GSE70422、GSE136992数据集，用R软件limma包筛选SIDS和ISDI死者不同组织样本中差异表达的mRNA，进行重叠分析，并用R软件clusterProfiler包进行基因本体论（gene ontology,GO）和京都基因和基因组数据库（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）富集分析，使用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（protein-protein interaction,PPI）网络，基于cytoHubba插件筛选hub基因。结果与数据集中的对照组相比，SIDS和ISDI死者组织样本中有19个显著的共同差异基因，其中心脏组织中16个、肝组织中3个，心脏组织星形肌动蛋白1(as...