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艾草可燃性特征的转录组学研究
作者姓名:刘苗苗  吴家文  吴生兵  周美启
作者单位:安徽中医药大学研究生院,安徽合肥,230012;安徽中医药大学新安医学教育部重点实验室,安徽合肥230038;安徽道地中药材品质提升协同创新中心,安徽合肥230012;安徽中医药大学新安医学教育部重点实验室,安徽合肥230038;安徽中医药大学针灸经络研究所,安徽合肥 230038
基金项目:安徽高校科研创新平台团队建设项目(2015TD033);安徽省自然科学基金项目(1608085MH177);安徽省高校优秀中青年骨干人才国内外访学研修重点项目(gxfxZD2016115)
摘    要:目的 探讨艾草可燃性特征的转录组学基础。方法 采摘新鲜艾草后分别提取叶、根、茎组织的总RNA并建立3个组织的cDNA文库,进行高通量测序。对测序后的原始读段进行过滤得到高质量读段,使用Trinity软件对高质量读段进行de novo组装得到功能基因,再对功能基因进行京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)注释和表达量的计算。结果 艾草高通量测序获得99 807个功能基因,与KEGG数据库比对后得到萜类和纤维素合成的代谢通路,发现参与萜类物质合成的相关基因有116个,编码16种关键酶;参与纤维素合成相关基因有119个,编码5种关键酶。在萜类物质合成的关键酶基因中,叶、根、茎组织中都仅存在1个MVD基因和2个CMS基因,并且这3种关键酶基因均在叶中的表达水平最高。结论 艾草中存在许多参与萜类和纤维素合成的关键酶基因,但其最关键的限速酶在艾叶中的表达量比根、茎高,这可能是艾叶作为灸材的关键因素之一。

关 键 词:艾草  可燃性  萜类物质  纤维素  功能基因
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