STR等位基因梯阶制备的研究

目的 建立制备STR的等位基因梯阶标准对照的新方法。方法 以T-质粒载体直接连接STR等位基因扩增产物,导入大肠杆菌,使其随大肠杆菌的无性繁殖而复制、扩增,获得单一DNA分子的大量拷贝;经PCR鉴定及测序分析后,制备出标准的STR等位基因梯阶对照(AL)。结果 所建方法制备出了标准AL;保存重组质粒及转染的大肠杆菌,可保证AL的大量快速制备,并能长期保存。结论 该方法制备的AL在法医物证检验中有很高的应用价值,对STR试剂盒国产化有重要意义。     

北京地区人群(汉族)人血清备解素因子B分布频率的调查及其在血痕中的检出

作者采用琼脂糖凝胶高压电泳、PAGIEF及免疫固定技术测定了北京地区234份健康人(汉族)血清Bf的分布。其表型频率为SS171人,FS49人,FF8人,SS07 4人,FS07 1人及SS045 1人;基因频率为Bf~S=0.8462,Bf~F=0.1410,Bf~(S07)=0.0107,Bf~(S045)=0.0021。Bf表型分布与Hardy-Weinberg定律相吻合。经测定室温保存的已知Bf型的22份血痕,其可检出时限为3周。并将Bf型测定用于检案的血痕分析及亲权鉴定。     

荧光标记复合扩增检测4个STR基因座多态性

目的建立荧光标记复合扩增D1S2142,D13S1492,D14S306,D15S659基因座检测分型方法,并对成都汉族群体4个基因座的遗传多态性进行调查。方法用6-FAM标记D1S2142和D15S659引物,HEX、TMR分别标记D14S306和D13S1492引物,PCR复合扩增,310基因分析仪电泳自动收集电泳结果数据,GeneScan Analysis Software3.7NT软件计算扩增产物片段相对大小,Genotyper(3.7NT软件进行样本基因型分型,建立了荧光标记复合扩增检测4个STR基因座基因型的方法,对145名成都汉族无关个体样本进行分型。结果荧光标记复合扩增D1S2142,D13S1492,D14S306,D15S659基因座,每个STR基因座都获得了清晰的基因型分型结果。145份样本,4个STR基因座分别检出10,14,7,12个等位基因和22,54,21,39种基因型,其基因型分布均符合Hardy-W e inberg平衡。4个基因座在成都汉族群体的杂合度分别依次为0.7793,0.8345,0.7793和0.8345;多态信息含量分别依次为:0.7656,0.8730,0.7470和0.8312。累计非父排除率为0.9783,累计个人识别机率为0.9999 917。结论荧光标记复合扩增D1S2142,D13S1492,D14S306,D15S659基因座,可实现对每个基因座准确分型;成都汉族群体该4个基因座的遗传学数据,可为群体遗传学和法医学研究与应用提供基础资料。     

等位基因分型标准物的法医应用及制备研究

短串联重复序列(shorttandemrepeats,简称STR)由于其本身的优点和检测技术的不断完善,在今后相当长的时间内仍将是法医应用的重要遗传标记。等位基因分型标准物是STR检测试剂盒的组成部分,能够保证各等位基因分型的准确性。本文对等位基因分型标准物的出现、在法庭科学上的应用以及目前制备方法进行了综述,并对各种制备方法进行比较,以期对各实验室按照实际需要自行制备相关STR的等位基因分型标准物在方法选择上有所帮助,从而更好地进行法医物证鉴定。     

用超薄层聚丙烯酰胺凝胶等电聚焦法调查西藏藏族群体GC亚型频率报道

作者采用超薄层聚丙烯酰胺凝胶等电聚焦法检测了142例西藏地区无关藏族青年男女GC亚型,发现6例变异型,其中2例1A变异;1例1c变异;3例1F1S-2变异,这种新的变异型,迄今国内外尚未见报道。GC亚型的基因频率分别为:GC*1F=0.3921、GC*1S=0.3705、GC*2=0.2266、GC*1A=0.0072、GC*1C=0.0036。个人识别机率为0.8079;非父排除率为0.3430。     

D18S872基因座在汉、维、蒙古、回族群体中的遗传多态性研究及其应用

目的　调查D18S872基因座在成都汉族 ,新疆维族和蒙古族 ,甘肃回族 4个民族中的遗传多态性 ,获得群体遗传学基本数据。　方法　等位基因分型标准物制备采用分子克隆技术 ,样本基因分型采用PCR和PAG垂直电泳技术、银染显色方法。　结果　获得D18S872基因座等位基因分型标准物及该基因座在 4个群体中的遗传学数据。　结论　结果表明D18S872基因座在法医学个人识别和亲子鉴定中有一定的应用价值。     

Probabilistic expert systems for handling artifacts in complex DNA mixtures

This paper presents a coherent probabilistic framework for taking account of allelic dropout, stutter bands and silent alleles when interpreting STR DNA profiles from a mixture sample using peak size information arising from a PCR analysis. This information can be exploited for evaluating the evidential strength for a hypothesis that DNA from a particular person is present in the mixture. It extends an earlier Bayesian network approach that ignored such artifacts. We illustrate the use of the extended network on a published casework example.     

STR data for the 15 AmpFlSTR identifiler loci in the Western Romanian population

Allele frequencies for the 15 tetranucleotide short tandem repeat loci contained in the AmpFlSTR Identifiler kit were obtained from a population sample of 219 unrelated individuals born in the western part of Romania.     

Estimating drop-out probabilities of STR alleles accounting for stutters,detection threshold truncation and degradation

Allelic drop-out continues to be a challenge to forensic geneticists when interpreting crime scene evidence and calculating the evidential weight. Methods exist for estimating the probability of allelic drop-out, where the most promising methods use the signal intensities as input for quantifying the drop-out probability. Using data from real crime cases, we demonstrate that taking degradation of the biological material and truncation of the data due to a detection threshold into account is superior to previous approaches. An additional correction for stuttering effects showed limited improvement.