旋毛虫组织蛋白酶B基因TsCB1的克隆与生物信息学分析 |
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引用本文: | 谢志宙,李文卉,曲自刚,刘静宜,高小磊,岳龙,张德林,付宝权.旋毛虫组织蛋白酶B基因TsCB1的克隆与生物信息学分析[J].中国兽医科学,2013(7):661-667. |
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作者姓名: | 谢志宙 李文卉 曲自刚 刘静宜 高小磊 岳龙 张德林 付宝权 |
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作者单位: | 中国农业科学院兰州兽医研究所 家畜疫病病原生物学国家重点实验室 农业部兽医公共卫生重点开放实验室 甘肃省动物寄生虫病重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(31272555);甘肃省创新研究群体计划项目(1210RJIA006) |
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摘 要: | 为了研究旋毛虫组织蛋白酶B的功能,对GenBank中旋毛虫基因组数据库和EST数据库进行检索,获得旋毛虫组织蛋白酶B的cDNA序列并设计引物。以旋毛虫肌幼虫总RNA为模板,进行RT-PCR,将PCR产物克隆到pMD18-T载体后测序并进行生物信息学分析。结果表明,成功克隆到旋毛虫组织蛋白酶B基因(TsCB1)的cDNA序列,TsCB1cDNA含有1个由1 449个核苷酸组成的完整的开放阅读框,编码482个氨基酸残基组成的多肽,蛋白质分子质量理论值为55.1ku,理论等电点为7.66。TsCB1第1~35位氨基酸残基为信号肽序列,有2个潜在的N-糖基化位点,具有1个生长调节素B结构域和半胱氨酸蛋白酶结构域,半胱氨酸残基活性位点被丝氨酸残基所替换,同源性分析表明与其他线虫组织蛋白酶B的一致性在60%左右。
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关 键 词: | 旋毛虫 组织蛋白酶B 克隆 生物信息学分析 |
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