| 大熊猫轮状病毒CH-1株VP1基因的克隆和生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 郭玲,杨绍林,张和民,李德生,王承东,曹三杰,黄晓波,文心田,陈世界,颜其贵.大熊猫轮状病毒CH-1株VP1基因的克隆和生物信息学分析[J].中国兽医科学,2014(1). |
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| 作者姓名： | 郭玲 杨绍林 张和民 李德生 王承东 曹三杰 黄晓波 文心田 陈世界 颜其贵 |
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| 作者单位： | 四川农业大学动物医学院;四川省出入境检疫检验局;中国保护大熊猫研究中心;四川农业大学动物疫病与人类健康四川省重点实验室; |
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| 基金项目： | 科技部公益性行业科研专项(200910188);四川省科技厅科技支撑计划项目(2010SZ0050);林业公益性行业科研专项(201104050);大熊猫国际合作研究项目(SD0418);四川农业大学优秀硕士论文培育基金资助项目(YSPY1202) |
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| 摘 要： | 为研究大熊猫源轮状病毒(RV)CH-1株外衣壳蛋白VP1基因的结构及功能,采用MA-104细胞增殖大熊猫源RV,提取总RNA,运用RT-PCR扩增VP1基因,将阳性克隆进行测序,用生物信息学软件预测其功能,并构建系统进化树。结果显示,成功获得了长3 287bp的GPRV VP1蛋白基因(GenBank登录号:HQ641297);经生物信息学分析,此序列包含有一个3 267bp的完整开放阅读框,编码1 089个氨基酸;无信号肽;无跨膜区,其整个蛋白都位于病毒膜外区;抗原表位预测显示VP1蛋白有41个抗原表位;系统进化树分析显示大熊猫轮状病毒CH-1株VP1基因与猪A组轮状病毒VP1基因的进化距离最近。本研究成功获得了大熊猫源RV VP1基因,为今后研究此基因的生物学功能奠定了基础。
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| 关 键 词： | 大熊猫轮状病毒 VP基因 克隆 生物信息学分析 |
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