DNA芯片在法医生物物证检验

DNA芯片是把许许多多已知的某种或某类DNA片段（作为分子探针）以阵列形式有序地点加在某种基质或载体上,形成分子探针的集群或矩阵,其中每个探针的位置是固定可寻的,犹如计算机的芯片一样。将被检测物质与芯片进行杂交,若其中含有与芯片中阵列DNA序列相配对的DNA片段时,通过检测手段把这些配对物检测出来,分析计算配对物的相对比率,就可以对被检物质做出检验或鉴定结论。DNA芯片又称为DNA微矩阵（DNAmicroarray犤１犦）或基因芯片（Genechips）,但作者认为不宜把DNA芯片与基因芯片等同起来,因为基因芯片应是针对可表达…     

基因芯片技术在法医毒理学中的研究及应用前景

基因芯片 (genechip) ,也被称之为DNA微阵列 (DNAar ray)、寡核苷酸微芯片 (oligonucleotidemicrochip)或寡核苷酸微阵列 (oligonucleotidearray) ,首先由美国加州Affymetrix公司于 1996年开发 ,它的出现给分子生物学技术和人类基因组计划带来了一场新的革命[1] 。DNA芯片技术的基本原理就是通过RNA链或DNA单链间按碱基互补配对原则进行的杂交[2 ] 。基因芯片利用了大规模集成电路手段 ,控制固相载体上合成的千百万个DNA探针 ,将它们很有规律地排列在固相支持物上 ,形成DNA微阵列。样品DNA/RNA通过PCR扩增或体外转录等技术掺入…     

寡核苷酸芯片技术在HLA-A抗原基因分型中的应用研究

目的建立一种HLA-A位点的基因芯片分型方法,为HLA-A位点的基因分型提供一个较新的思路。方法利用基因芯片技术,根据HLA-A位点不同基因亚型的独特序列设计探针,制成分型芯片;待检测样品经PCR反应标记上荧光之后,与芯片进行杂交,根据杂交产生的荧光信号值分析确定样品HLA-A位点的基因亚型。将这一方法应用于100份标准DNA和200份无关个体的HLA-A位点基因分型并将部分样品进行测序。结果检测结果表明HLA-A基因分型芯片可准确分辨出A位点等位基因20大类,耗时2.5h。结论寡核苷酸芯片技术用于HLA-A基因分型,分辨率高、特异性强、重复性好、操作简便、结果直观,适合于法医学实践和临床应用。     

人DNA指纹检测的初步研究

根据随机探针检测DNA限制片段长度多态性的原理和人与鼠的髓鞘硷性蛋白(MBP)基因cDNA有90％以上同源序列的事实,我们选用rMBP-cDNA 3'端非表达区高度重复顺序的0.81kb片段作探针,检测用HaeⅢ酶解的人DNA限制性片段结果可以分解出22条谱带,受检的30例无血缘关系的个体之间,没有两个人的谱带是完全相同的,显示出此方法的高度特异性。本文还比较了若干DNA片段作探针和几种限制性内切酶检测人DNA指纹的结果。     

DNA芯片技术检测HLA-DRB1和ABO基因型

用DNA芯片技术检测HLA-DRB1-ABO基因型。根据HLA和ABO不同基因亚型的独特序列设计探针,制成分型芯片;待检测样品经PCR反应标记上荧光之后,与探针在芯片上进行杂交,通过对杂交产生的荧光信号值进行分析,确定样品DRB1位点和ABO位点的基因亚型。将这一方法应用于111份样本的HLA-DRB1-ABO基因分型并将部分样品进行基因测序。检测结果证明本实验研制的HLA-DR-ABO基因分型芯片可准确分辨出DRB1位点30个等位基因、ABO位点6种基因型。该方法分辨率高、特异性强、重复性好、操作简便,对比常规的PCR-SSP方法,HLA-DR-ABO基因芯片方法更为直观,并具有集成化优势,可以在一张芯片上同时检测HLA和ABO位点,并实现一张芯片多人份,不仅适用于法医学亲子鉴定和个体识别,亦可应用于移植配型、HLA相关疾病及人类遗传学研究。     

SNPlex系统检测方法及在法医遗传学中的应用前景

被称为第三代遗传标记的SNP是近年来的研究热点,对SNP检验检测方法很多,例如引物延伸结合时间飞行质谱分析法,微矩阵基因分型法,SNPlex基因分型系统等,本文重点介绍的就是SNPlex基因分型系统,及其法医学应用前景.这种系统是利用DNA模板直接与等位基因特异探针和位点特异性探针结合,连接产物经扩增之后与特异探针杂交结合,最后通过毛细管电泳检测特异探针进行SNP分型.     

DNA指纹的个体特异性和细胞稳定性研究

人类基因组的许多高度可变区域能够与小卫星探针杂交,而同时被检测出来,小卫星探针由串联重复的"核心"顺序构成.采用Southern印迹杂交获得的DNA指纹图包含多条高度可变的DNA片段杂交带,这些带主体细胞和生殖细胞中都表现出稳定性,而且安全具有个体特异性.本文用小卫星探针33.15,调查了北京地区的60名无关个体,     

运用二重PCR和DNA芯片技术检测ABO基因型

目的以玻片为载体,用寡核苷酸探针杂交技术检测ABO基因型。方法根据ABO基因座外显子6和外显子7的3个SNP点的序列分布特征设计4条寡核苷酸探针,制成分型芯片。将待测样品DNA用末端标记了Cy5的引物进行二重PCR扩增,产物与芯片上的探针进行杂交,根据杂交产生的荧光信号确定样品的ABO基因型。结果利用ABO芯片,可对血斑、毛发等微量检材进行ABO基因型检测。对115名汉族无关个体的调查表明,ABO基因型的分布符合Hardy-Weinberg平衡,等位基因杂合度观察值和期望值分别为0.591、0.616,多态信息含量为0.544,二联体和三联体非父排除率分别为0.188、0.334,个体识别能力为0.777。结论通过DNA芯片检测ABO基因型的技术适用于法医学样本,可满足高通量的检测需求。     

HLA-DRB1基因分型芯片的法医物证学应用价值研究

目的对HLA-DRB1基因分型芯片在个体识别中的应用价值进行研究。方法根据HLA-DRB1基因座不同等位基因的独特序列设计探针,制成分型芯片。将待测样品DNA用末端标记了CY5的引物进行PCR扩增,产物与芯片进行杂交,根据杂交产生的荧光信号值确定样品在HLA-DRB1位点的基因型。将这一方法应用于561份样本的HLA-DRB1基因分型,根据基因型分布统计分析其法医学应用价值。同时,进行了家系调查和方法灵敏度分析,并应用于部分案例。结果利用微量检材,HLA-DRB1基因芯片可检测DRB1位点等位基因26个,基因型的分布符合Hardy-Weinberg平衡定律,该位点的观察杂合度(Ho)为0.888,期望杂合度(He)为0.902,多态信息含量(PIC)为0.893,平均非父排除率(PE)为0.801。家系调查和案例运用的结果表明,HLA-DRB1位点等位基因由亲代向子代的传递符合孟德尔遗传定律。结论HLA-DRB1为高度多态位点,其基因分型芯片可在亲子鉴定和个体识别中发挥重要作用。     

DNA甲基化在法医学中的应用前景及其检测方法新进展

DNA甲基化是一种重要的表观遗传标记。新近的一些研究表明,DNA甲基化在二联体亲权鉴定、同卵双生子法医学个体甄别等案例中可能具有一定的应用前景,可作为STR或SNP等经典遗传标记的有益补充。目前基于甲基化敏感的限制性核酸内切酶、重亚硫酸盐转化以及甲基化CpG结合蛋白等原理已建立了一系列的DNA甲基化检测方法。甲基化敏感的单核苷酸引物延伸、实时荧光PCR、甲基化特异性PCR、甲基化特异性多重连接反应依赖性探针扩增、光纤微珠芯片等位点特异性DNA甲基化检测方法都可用于已知CpG位点甲基化状态的检测并可能在法医学实验室具有一定的应用前景;AIMS、HELP、COMPARE-MS等通过对基因组范围内的DNA甲基化扫描分析,可发现具有潜在法医学应用价值的DNA甲基化位点。     

用α-珠旦白-3’HVR探针研究DNA指纹

用α-珠蛋白-3’HVR探针,经Southern印迹法,对100名不相关个体及4个家系的32名相关个体的DNA指纹进行了检测,所产生的DNA图谱具有高度的个体特异性,在被测的所有个体中无一相同。经统计学计算表明,任意两个个体DNA指纹图重合率为10~(-11)。家系分析毒明,DNA片段严格按照孟德尔方式遗传。该探针的应用,将在法医学亲子鉴定和个人同一认定中发挥重要的作用。     

HLA-DRBl基因分型芯片的法医物证学应用价值研究

目的对HLA-DRBl基因分型芯片在个体识别中的应用价值进行研究。方法根据HLA-DRBl基因座不同等位基因的独特序列设计探针．制成分型芯片。将待测样品DNA用末端标记了CY5的引物进行PCR扩增，产物与芯片进行杂交．根据杂交产生的荧光信号值确定样品在HLA-DRB1位点的基因型。将这一方法应用于561份样本的HLA-DFIBl基因分型，根据基因型分布统计分析其法医学应用价值。同时．进行了家系调查和方法灵敏度分析，并应用于部分案例。结果利用微量检材．HLA-DRB1基因芯片可检测DRB1位点等位基因26个，基因型的分布符合Harely—Weinberg平衡定律．该位点的观察杂合度(Ho)为0．888，期望杂合度(He)为0．902，多态信息含量(PIC)为0．893，平均非父排除率(PE)为0．80l。家系调查和案例运用的结果表明，HLA-DRB1位点等位基因由亲代向子代的传递符合盂德尔遗传定律。结论HLA-DRB1为高度多态位点，其基因分型芯片可在亲子鉴定和个体识别中发挥重要作用。     

法庭DNA技术与标准化

1 法庭DNA技术的发展与现状法庭DNA技术自1985年被首次应用以来,经过十多年的努力,已经由最初的限制性片段长度多态性检测(RFLP)发展到如今的扩增片段长度多态性检测(PCR-VNTR,PCR-STR)以及DNA序列变异测定等.人们充分利用DNA分子的序列多态性和长度多态性来进行个体识别,由此产生了DNA指纹技术,VN-TR-PCR扩增技术,STR-PCR技术,MVR-PCR技术,PCR测序技术等一系列新兴的法庭科学技术,促进了整个遗传科学和法庭科学的发展.     

亲权鉴定中的DNA纹印图谱和常规血清学——一种比较性研究

<正> 为了评价DNA纹印图谱在亲权鉴定中的潜在价值,本研究对经常规血清学检测作出结论的186例,用DNA纹印图谱进行复检以便与常规血清学的结论进行比较。用改良法作DNA纹印图谱,应用小卫星探针33.15(Jeffreys等,1985),在不能排除的125例中有112例(89.6％),由DNA纹印图谱得到证实。有2例(1.6％)DNA纹印图谱显示了血清学未发     

法医DNA检验新技术

1985年DNA技术首次运用到人类个人识别方面,使法医生物物证检验技术实现了从只能排除到直接认定个人的飞跃。从此国内外法庭科学界争相研究和应用这门新技术,使之取得日新月异的进步,成为打击罪犯和解决亲权纠纷最有效的技术手段9“七五”后期,公安部物证鉴定中心DNA鉴定处（原公安部第二研究所法医分子遗传室）和辽宁省刑事科学技术研究所建立了多基因座DNA探针检测DNA指纹图方法并用于办案。但是当时我国在这一高新技术领域的总体技术水平与发达国家还有很大差距,也远不能满足大多数案件生物物证鉴定的需要,主要表现在：1．用…     

人体表型特征的DNA分子鉴识——5年新进展

人体外部可见特征(externally visible characteristic,EVC)的分子鉴识,也被称为法医DNA表型(forensic DNA phenotyping,FDP)推断。在常规调查无法确定罪犯身份、DNA数据库未成功比对时,可作为"分子目击证人",通过从犯罪现场留下的生物检材或未知名尸体中获取DNA,推断其外部可见表型特征,以协助侦破案件。近年来,筛选不同EVC相关分子标记的研究多有报道,一部分EVC的推断已经具有一定的准确性,如发色和虹膜颜色。随着人体外部表型特征分子遗传学基础研究的持续深入,以及分子生物学技术的不断创新,将促进人体表型特征DNA分子鉴识的飞速发展。     

H2O2诱导PC12细胞凋亡前后miRNA的变化及探讨

目的用微小RNA(miRNA)基因芯片技术检测H2O2诱导凋亡的PC12细胞和正常PC12细胞miR-NA的表达谱差异。方法分别以不同浓度的H2O2处理PC12细胞12h,用MTT和流式细胞仪检测处理后细胞的生长活力和凋亡情况;分别提取A(0浓度H2O2处理组)和B(400nmol/LH2O2处理组)PC12细胞的miRNA做miRNA基因芯片检测。结果以A组作为对照,30、50、100、200、400nmol/L的H2O2处理的PC12细胞生存率分别为(92±9.80)%、(90±14.70)%、(80±13.85)%、(54±12.33)%、(22±7.35)%(P<0.01);0、30、50、100、200和400nmol/L的H2O2处理的PC12细胞早期凋亡率分别为2.6%、5.2%、7.2%、10.4%、16.6%、72.2%;在样品A中共筛选出68个有效表达的miRNA分子数据,在样品B中筛选出46个有效表达的miRNA分子数据,两者样品中均检测到有效表达的miRNA分子有39个,其中与样品A相比,在样品B中显著性下调表达的有6个。结论为脑缺血再灌注损伤中神经细胞凋亡的机制和治疗的研究提供了理论依据和新的研究思路。     

线粒体DNA cytb和HVI的分析用于种属鉴定

目的以线粒体DNA为目标序列,探讨生物检材的种属来源问题。方法复合扩增线粒体DNA细胞色素b基因(Cb)片段和D-环HVI上人源特异性DNA片段,2%琼脂糖凝胶电泳检测复合扩增产物谱带;用常规测序技术获得种属来源不明的检材Cytb基因序列,登陆美国国家生物信息中心网站主页(http://www.ncbi.nlm.nih.gov),将Cytb序列的测序结果用BLAST2.2.9[2004.5.1]进行匹配查询,查询数据库中存在的与其相匹配的物种条目。结果检材经复合扩增后电泳检测可区分人源性检材和非人源性检材;用生物信息法可确定检材种属来源结论检测线粒体DNA细胞色素b基因和D-环HVI的有关序列可在DNA分子水平上鉴别人源性检材和非人源性检材,结合测序的分子生物信息学方法,可对检材进行种属鉴定。     

PowerPlex(R)16HS系统在建立DNA数据库中的应用

免提取型法医DNA检测试剂盒是近年出现的新产品,具有成本低、速度快、操作简便等优点[1],在DNA数据库大样本量检验分析和检验标准化方面,优势明显.本研究采用PowerPlex(R)16 HS系统对DNA建库样本(FTA卡血样或滤纸片血样)进行直接扩增,检测情况报道如下..     

骨骼肌circRNA在死亡时间推断中的初步筛选及验证研究

目的通过构建骨骼肌中环状RNA(circular RNA,circRNA)表达谱,筛选出人体骨骼肌中与死亡时间具有时序性变化的circRNAs,并对筛选出的circRNAs进行验证,进而探讨其相对表达量与死亡时间的相关性。方法芯片实验选取2例外界温度、湿度相对一致,已知死亡时间在24 h内的个体,分别于尸检即刻(12 h以内)、3、5、7、10 d各取50 g组织进行总RNA提取,并进行逆转录、探针标记、基因芯片检测等实验,初步得到circRNA表达谱;对筛选出的circRNAs在后续收集的18例检材中进行验证,对所得数据进行统计分析。结果骨骼肌组织中共检测出13156个circRNAs,但在10 d内整体呈下降趋势的circRNAs只有hsa_circ_0001727、hsa_circ_0001136、hsa_circ_0001871、hsa_circ_0005251、hsa_circ_0000284、hsa_circ_0000520、hsa_circ_00019717个。对所筛选出的7个circRNAs在18例检材中进行验证,发现只有hsa_circ_0001727、hsa_circ_0001136、hsa_circ_0001871、hsa_circ_0005251、hsa_circ_00002845个circRNAs随着死亡时间增加,其相对表达量显著下降,具有统计学意义(P<0.05)。而hsa_circ_0000520、hsa_circ_00019712个circRNAs的表达为阴性。结论circRNA是一种较为稳定的生物标记物,部分可用于死亡时间推断的研究。