DNA芯片与法医生物物证检验

DNA芯片是把许许多多已知的某种或某类 DNA片段 ( 作为分子探针 ) 以阵列形式有序地点加在某种基质或载体上 , 形成分子探针的集群或矩阵 , 其中每个探针的位置是固定可寻的 , 犹如计算机的芯片一样 . 将被检测物质与芯片进行杂交 , 若其中含有与芯片中阵列 DNA序列相配对的 DNA片段时 , 通过检测手段把这些配对物检测出来 , 分析计算配对物的相对比率 , 就可以对被检物质做出检验或鉴定结论 . DNA芯片又称为 DNA微矩阵 (DNA microarray[1])或基因芯片 (Gene chips), 但作者认为不宜把 DNA芯片与基因芯片等同起来 , 因为基因芯片应是针对可表达的 DNA片段即外显子的 , 而 DNA芯片则是包括了可表达与不能表达的 DNA片段的全部 , 后面要提到的法医物证检验所用 DNA芯片使用的就是不能表达的 DNA片段即内含子 .     

基因芯片技术在法医毒理学中的研究及应用前景

基因芯片 (genechip) ,也被称之为DNA微阵列 (DNAar ray)、寡核苷酸微芯片 (oligonucleotidemicrochip)或寡核苷酸微阵列 (oligonucleotidearray) ,首先由美国加州Affymetrix公司于 1996年开发 ,它的出现给分子生物学技术和人类基因组计划带来了一场新的革命[1] 。DNA芯片技术的基本原理就是通过RNA链或DNA单链间按碱基互补配对原则进行的杂交[2 ] 。基因芯片利用了大规模集成电路手段 ,控制固相载体上合成的千百万个DNA探针 ,将它们很有规律地排列在固相支持物上 ,形成DNA微阵列。样品DNA/RNA通过PCR扩增或体外转录等技术掺入…     

寡核苷酸芯片技术在HLA-A抗原基因分型中的应用研究

目的建立一种HLA-A位点的基因芯片分型方法,为HLA-A位点的基因分型提供一个较新的思路。方法利用基因芯片技术,根据HLA-A位点不同基因亚型的独特序列设计探针,制成分型芯片;待检测样品经PCR反应标记上荧光之后,与芯片进行杂交,根据杂交产生的荧光信号值分析确定样品HLA-A位点的基因亚型。将这一方法应用于100份标准DNA和200份无关个体的HLA-A位点基因分型并将部分样品进行测序。结果检测结果表明HLA-A基因分型芯片可准确分辨出A位点等位基因20大类,耗时2.5h。结论寡核苷酸芯片技术用于HLA-A基因分型,分辨率高、特异性强、重复性好、操作简便、结果直观,适合于法医学实践和临床应用。     

DNA芯片技术检测HLA-DRB1和ABO基因型

用DNA芯片技术检测HLA-DRB1-ABO基因型。根据HLA和ABO不同基因亚型的独特序列设计探针,制成分型芯片;待检测样品经PCR反应标记上荧光之后,与探针在芯片上进行杂交,通过对杂交产生的荧光信号值进行分析,确定样品DRB1位点和ABO位点的基因亚型。将这一方法应用于111份样本的HLA-DRB1-ABO基因分型并将部分样品进行基因测序。检测结果证明本实验研制的HLA-DR-ABO基因分型芯片可准确分辨出DRB1位点30个等位基因、ABO位点6种基因型。该方法分辨率高、特异性强、重复性好、操作简便,对比常规的PCR-SSP方法,HLA-DR-ABO基因芯片方法更为直观,并具有集成化优势,可以在一张芯片上同时检测HLA和ABO位点,并实现一张芯片多人份,不仅适用于法医学亲子鉴定和个体识别,亦可应用于移植配型、HLA相关疾病及人类遗传学研究。     

运用二重PCR和DNA芯片技术检测ABO基因型

目的以玻片为载体,用寡核苷酸探针杂交技术检测ABO基因型。方法根据ABO基因座外显子6和外显子7的3个SNP点的序列分布特征设计4条寡核苷酸探针,制成分型芯片。将待测样品DNA用末端标记了Cy5的引物进行二重PCR扩增,产物与芯片上的探针进行杂交,根据杂交产生的荧光信号确定样品的ABO基因型。结果利用ABO芯片,可对血斑、毛发等微量检材进行ABO基因型检测。对115名汉族无关个体的调查表明,ABO基因型的分布符合Hardy-Weinberg平衡,等位基因杂合度观察值和期望值分别为0.591、0.616,多态信息含量为0.544,二联体和三联体非父排除率分别为0.188、0.334,个体识别能力为0.777。结论通过DNA芯片检测ABO基因型的技术适用于法医学样本,可满足高通量的检测需求。     

SNPlex系统检测方法及在法医遗传学中的应用前景

被称为第三代遗传标记的SNP是近年来的研究热点,对SNP检验检测方法很多,例如引物延伸结合时间飞行质谱分析法,微矩阵基因分型法,SNPlex基因分型系统等,本文重点介绍的就是SNPlex基因分型系统,及其法医学应用前景.这种系统是利用DNA模板直接与等位基因特异探针和位点特异性探针结合,连接产物经扩增之后与特异探针杂交结合,最后通过毛细管电泳检测特异探针进行SNP分型.     

法医学中的性别鉴定

对用形态学、细胞学、性激素检测、 DNA重组技术和聚合酶链式反应（ PCR）等方法进行性别鉴定进行了概述,显示骨骼的性别鉴定以形态学方法为好;对能获得足够量基因组 DNA的人体组织,最好用 PCR检测牙釉基因。而检测性染色质因阳性率较低,检测性激素仅适用于血痕检材, DNA分子杂交技术需要复杂的仪器及放射性同位素标记的探针,这些方法目前已较少应用。     

DNA甲基化在法医学中的应用前景及其检测方法新进展

DNA甲基化是一种重要的表观遗传标记。新近的一些研究表明,DNA甲基化在二联体亲权鉴定、同卵双生子法医学个体甄别等案例中可能具有一定的应用前景,可作为STR或SNP等经典遗传标记的有益补充。目前基于甲基化敏感的限制性核酸内切酶、重亚硫酸盐转化以及甲基化CpG结合蛋白等原理已建立了一系列的DNA甲基化检测方法。甲基化敏感的单核苷酸引物延伸、实时荧光PCR、甲基化特异性PCR、甲基化特异性多重连接反应依赖性探针扩增、光纤微珠芯片等位点特异性DNA甲基化检测方法都可用于已知CpG位点甲基化状态的检测并可能在法医学实验室具有一定的应用前景;AIMS、HELP、COMPARE-MS等通过对基因组范围内的DNA甲基化扫描分析,可发现具有潜在法医学应用价值的DNA甲基化位点。     

人DNA指纹检测的初步研究

根据随机探针检测DNA限制片段长度多态性的原理和人与鼠的髓鞘硷性蛋白(MBP)基因cDNA有90％以上同源序列的事实,我们选用rMBP-cDNA 3'端非表达区高度重复顺序的0.81kb片段作探针,检测用HaeⅢ酶解的人DNA限制性片段结果可以分解出22条谱带,受检的30例无血缘关系的个体之间,没有两个人的谱带是完全相同的,显示出此方法的高度特异性。本文还比较了若干DNA片段作探针和几种限制性内切酶检测人DNA指纹的结果。     

DNA指纹的个体特异性和细胞稳定性研究

人类基因组的许多高度可变区域能够与小卫星探针杂交,而同时被检测出来,小卫星探针由串联重复的"核心"顺序构成.采用Southern印迹杂交获得的DNA指纹图包含多条高度可变的DNA片段杂交带,这些带主体细胞和生殖细胞中都表现出稳定性,而且安全具有个体特异性.本文用小卫星探针33.15,调查了北京地区的60名无关个体,     

抗污染扩增试剂在法医物证检验中的应用

客观、准确的法医遗传检验结果是作出准确鉴定意见的基础。随着检验设备、扩增检测试剂检验灵敏度日益增加,防控实验室污染、样品污染的压力与日俱增,其中PCR扩增产物对检测结果的污染最难防控。本文测试一款抗污染扩增试剂盒NH-18A,该试剂盒包含16个常染色体STR基因座,1个性别识别基因座（Amel）和一个Y染色体插入缺失基因座（Indel）,NH-18A通过STR复合扩增可得到含有尿嘧啶碱基的DNA片段,该类型的DNA片段在50℃时可被尿嘧啶DNA糖基化酶（UDG）高效水解,每次新一轮PCR扩增前增加一步50℃保温孵育可以彻底消除既往扩增产物对结果的污染威胁。经实验验证,NH-18A具有优异的抗扩增产物污染能力,且替换碱基扩增不改变DNA分型结果,检测灵敏度和DNA产物片段稳定性不降低,后续电泳分析不受影响。利用此试剂盒可以有效消除扩增产物对鉴定结果的污染。     

HinfⅠ和HaeⅢ酶解条件对DNA指纹图的影响

用辣根过氧化物酶标记α-珠蛋白-3’－HVR探针检测同一个体的DNA，其所产生的DNA指纹图谱带随着酶解条件的变化而发生改变。由于谱带的改变，给亲子关系的同一认定带来了困难，尤其是多位点探针的检测。为了了解Hinfl和Hae皿两种酶在不同酶解时间和不同酶量的条件下对DNA指纹图谱带的影响，本文作者利用多位点探针a一珠蛋白一3’－HVR和单位点探针MSS进行检测VNTR图谱的实验。材料与方法一、材料1．无关个体血液样品取自平时破案中所剩检材；2．琼服糖（美国signla公司产）；3．Hinfl和HaeI（美国premagem公司）4．非同位素标记…     

用α-珠旦白-3’HVR探针研究DNA指纹

用α-珠蛋白-3’HVR探针,经Southern印迹法,对100名不相关个体及4个家系的32名相关个体的DNA指纹进行了检测,所产生的DNA图谱具有高度的个体特异性,在被测的所有个体中无一相同。经统计学计算表明,任意两个个体DNA指纹图重合率为10~(-11)。家系分析毒明,DNA片段严格按照孟德尔方式遗传。该探针的应用,将在法医学亲子鉴定和个人同一认定中发挥重要的作用。     

HLA-DRB1基因分型芯片的法医物证学应用价值研究

目的对HLA-DRB1基因分型芯片在个体识别中的应用价值进行研究。方法根据HLA-DRB1基因座不同等位基因的独特序列设计探针,制成分型芯片。将待测样品DNA用末端标记了CY5的引物进行PCR扩增,产物与芯片进行杂交,根据杂交产生的荧光信号值确定样品在HLA-DRB1位点的基因型。将这一方法应用于561份样本的HLA-DRB1基因分型,根据基因型分布统计分析其法医学应用价值。同时,进行了家系调查和方法灵敏度分析,并应用于部分案例。结果利用微量检材,HLA-DRB1基因芯片可检测DRB1位点等位基因26个,基因型的分布符合Hardy-Weinberg平衡定律,该位点的观察杂合度(Ho)为0.888,期望杂合度(He)为0.902,多态信息含量(PIC)为0.893,平均非父排除率(PE)为0.801。家系调查和案例运用的结果表明,HLA-DRB1位点等位基因由亲代向子代的传递符合孟德尔遗传定律。结论HLA-DRB1为高度多态位点,其基因分型芯片可在亲子鉴定和个体识别中发挥重要作用。     

原位杂交技术及其在法医学领域中的应用

原位杂交（InSituHybridzaion，ISH）是应用核酸碱基互补原理在组织切片、细胞涂片、染色体制片等标本上进行核酸定性、定位和相对定量的一项分子生物学技术[1]，是将分子杂交与组织化学相结合的产物，又称为杂交组织化学、细胞杂交或原位杂交组织化学。1969年Gall等[2]最早使用瓜蟾核糖体基因探针与其卵母细胞来交，发现该基因位于核仁，从而建立了ISH技术。一、ISH的基本原理[3]ISH的原理为含有互补顺序的标记DNA或RNA探针，在适宜条件下，与细胞内变性了的DNA或RNA形成杂交体，通过不同的显示方法，显示出杂交体在细胞内的位…     

位点特异性小卫星探针的特点及其在法庭科学上的应用

<正> 在人类DNA上发现了许多事变区,它们通常是由前后重复被称为小卫星的短顺列所组成。由于高度变异性,含有微小卫星的DNA为个体识别及亲子鉴定提供了有价值的遗传探针。为了分离出更多的有效的DNA探针,我们建立了一个由许多高度DNA片段组成的Cha-     

非同位素标记DNA探针初步研究

本文报导了将辣根过氧化物酶直接标记在单链 DNA 探针上,制备出非同位素的 DNA 探针,采用化学光增强法检测杂交结果,所得图谱清晰,容易判读。所制备出的 DNA 探针可用于人类性别鉴定和个体识别,为 DNA 检验技术推广应用开辟了新的领域。     

用α-珠蛋白-3′HVR探针研究DNA纹印

<正> 用α-珠蛋白-3′HVR探针,经Southern印迹法,对100名不相关个体及4个家系的32名相关个体的DNA进行了检测,所产生的DNA纹印具有高度的多态性,在132名个体中无一相同。家系分析表明,DNA片断严格按照孟德尔方式遗传。该探针的应用,将在法医亲子     

法医DNA检验新技术

1985年DNA技术首次运用到人类个人识别方面,使法医生物物证检验技术实现了从只能排除到直接认定个人的飞跃。从此国内外法庭科学界争相研究和应用这门新技术,使之取得日新月异的进步,成为打击罪犯和解决亲权纠纷最有效的技术手段9“七五”后期,公安部物证鉴定中心DNA鉴定处（原公安部第二研究所法医分子遗传室）和辽宁省刑事科学技术研究所建立了多基因座DNA探针检测DNA指纹图方法并用于办案。但是当时我国在这一高新技术领域的总体技术水平与发达国家还有很大差距,也远不能满足大多数案件生物物证鉴定的需要,主要表现在：1．用…     

HLA-DRBl基因分型芯片的法医物证学应用价值研究

目的对HLA-DRBl基因分型芯片在个体识别中的应用价值进行研究。方法根据HLA-DRBl基因座不同等位基因的独特序列设计探针．制成分型芯片。将待测样品DNA用末端标记了CY5的引物进行PCR扩增，产物与芯片进行杂交．根据杂交产生的荧光信号值确定样品在HLA-DRB1位点的基因型。将这一方法应用于561份样本的HLA-DFIBl基因分型，根据基因型分布统计分析其法医学应用价值。同时．进行了家系调查和方法灵敏度分析，并应用于部分案例。结果利用微量检材．HLA-DRB1基因芯片可检测DRB1位点等位基因26个，基因型的分布符合Harely—Weinberg平衡定律．该位点的观察杂合度(Ho)为0．888，期望杂合度(He)为0．902，多态信息含量(PIC)为0．893，平均非父排除率(PE)为0．80l。家系调查和案例运用的结果表明，HLA-DRB1位点等位基因由亲代向子代的传递符合盂德尔遗传定律。结论HLA-DRB1为高度多态位点，其基因分型芯片可在亲子鉴定和个体识别中发挥重要作用。