放置时间对烟蒂上DNA含量及STR分型的影响

目的 探讨不同放置时间对烟蒂上DNA含量及STR分型的影响.方法 以lO名志愿者的40枚"红双喜"烟蒂为检材(每人4枚),用chelex-100法分别在第1、4、7和1O周时提取烟蒂样本外层烟纸和海绵上的DNA,用Quantifiler人类DNA定量试剂盒进行DNA定量.并同时用AmpFL STR Profiler和IdentifilerrM试剂盒(AB公司)进行PCR扩增及STR分型. 结果放置第1、4、7和10周的烟蒂烟纸DNA质量浓度范围分别为0.104～2.52、0.110～2.41、0.096 0～2.32和0.085 0～2.28ng/μL,16个基因座检出率分别为100%、90%、75%和62.5%.海绵DNA质量浓度范围分别为0.0180～2.40、0.0171～2.25、0.0165～2.15和0.0160～2.15ng/μL,16个基因座检出率分别为97.5%、82.5%、50%和12.5%. 结论放置时间对烟纸和海绵上的DNA含量影响不大,对STR分型影响显著,STR分型受海绵的影响比烟纸明显.放置时间越久.检出率越低.     

广东广西地区5个群体9个STR基因座的频率调查

目的 调查广东汉族、广西汉族、广西侗族、广西壮族、广西苗族5个群体9个STR基因座多态性,探讨其在法医学检验中的应用价值。方法 应用AmpFISTR Profiler PlusTM荧光标记复合扩增系统,对广东广西5个群体4个民族的1191个无关个体的血样DNA进行9个STR基因座的复合扩增;用ABI 3100遗传分析仪对扩增产物进行分型,统计9个STR基因座的群体遗传学参数。结果 9个STR基因座在广东广西地区5个群体中的累积偶合率为1.51×10-11～8.08×10-11,累积非父排除率为0.99981—0.99990。,结论 该9个STR基因座可满足汉族、壮族、侗族、苗族群体法医学的个体识别及亲权鉴定的需要。     

广州地区汉族人群PentaD及PentaESTR基因座频率

应用ＰｏｗｅｒＰｌｅｘＴＭ16ｓｙｓｔｅｍ (Ｐｒｏｍｅｇａ)荧光标记复合扩增试剂盒对广州地区汉族无关个体进行遗传多态性调查 ,报道如下。1　材料和方法1 1　实验材料广州地区汉族 170份无关个体血样取自广州市中心血站 ,男性 90例、女性 80例。30个家系样本取自本室采集的已确定亲生关系的家系。1 2　主要仪器与试剂970 0型热循环仪、ＡＢＩ 377 96全自动测序仪(ＰＥ公司 )。ＰｏｗｅｒＰｌｅｘＴＭ16ｓｙｓｔｅｍ荧光标记复合扩增试剂盒 ,内标 (Ｐｒｏｍｅｇａ公司 )。凝胶试剂 (ＰＥ公司 )。1 3　计算机分析系统电泳收集软件ＡＢＩＰ…     

19个常染色体与4个Y染色体STR复合扩增体系的建立

目的建立19个常染色体STR及Amelogenin和4个Y染色体STR基因座复合扩增体系,并对其效能进行评估。方法用五色荧光标记20+4Y-STR基因座,建立同步扩增检测体系,用ABI 3130XL遗传分析仪对扩增产物进行电泳,GeneMapperID 3.2软件进行基因分型;检测体系的灵敏度、均衡性、稳定性、特异性、同一性和稳定性,并观察混合、降解及微量检材的分型情况。结果采用本文体系,DNA模板量在0.05~1.00ng时,分型准确,均衡性、特异性好;混合、降解及微量检材分型正确。该19个常染色体STR基因座的累计个人识别率大于0.999 999 999,三联体累计非父排除率达0.999 999 985,Y-STR单倍型多态性为0.592。结论本文建立的复合扩增体系分型准确,稳定,在法医学案件检验及数据库建设等方面有良好的应用前景。     

粤、桂、琼地区14个人群STR基因座频率调查

STR分型技术在法庭科学中的应用已经由早期的个案分析,发展为数据库索引比对.国外成功建立的许多成熟的DNA数据库系统,在打击犯罪、维护法律中发挥了重要的作用.但目前在DNA数据库研究中,很少对入库样本需要检测出多少个STR基因座才能符合法医实际应用中的不同需要进行讨论.一般认为个体识别选择的基因座要求个体识别能力达到10-9,亲权鉴定要求累积非父排除率大于或等于99.95%.在条件允许的情况下,入库样本检测出STR基因座数目越多越好,多态性越高越好.     

复合扩增A10、C4基因座遗传多态性及法医学意义

目的　建立复合扩增A10、C4基因座的体系 ,研究其在法医学检验中的应用价值。方法　生物学样本用Chelex - 10 0的方法提取DNA ,荧光标记的特异性引物复合扩增A10、C4基因座 ,用ABI 310 0遗传分析仪对扩增产物进行检测分型。结果　A10、C4基因座各检出 6个等位基因 ,GD值分别为 0 .6 86 ,0 .84 6 .共检出 2 3种单倍型 ,其单倍型的个体识别率为 0 .9184。扩增女性DNA ,均无特异性扩增产物 ;调查 30个二代家系 ,均未观察到突变基因的存在。结论　A10、C4复合扩增体系多态性较高 ,对法医学中男女混合检材的个人识别及父系亲缘关系鉴定有较高的应用价值。     

广西地区3个群体15个STR基因座频率多态性

目的调查广西地区仡佬族、仫佬族、瑶族无关个体的15个STR基因座(D8S1179、1321S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、vWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA)多态性,研究其在法医学检验中的应用价值。方法 应用AmpFISTR IdentifilerTM荧光标记复合扩增系统,对314例仡佬族、332例仫佬族、238例瑶族无关个体血样DNA进行15个STR基因座的复合扩增,用ABI 3100遗传分析仪对扩增产物进行检测,GeneScan、GenoTyper软件进行基因分型,统计计算15个STR基因座的群体遗传学参数。结果IdertifilerTM系统的15个STR基因座在仡佬、仫佬、瑶族的累积偶合率为1.839×10-16~5.073×10-17,累积非父排除率为0.9999983~0.9999991。结论该15个STR基因座足可满足仡佬族、仫佬族、瑶族法医学的个体识别及亲权鉴定的需要。     

荧光标记3个miniSTR基因座复合扩增系统的建立

目的建立扩增片段<135bp,包括D5S818,D8S1179,D16S539 3个miniSTR基因座复合扩增系统。方法采用不同荧光染料标记引物,通过PCR扩增,利用ABI 3100遗传分析仪进行片段长度分析,对100份无关个体血样,10个家系样本以及30份高度降解检材进行检测。结果本系统DNA分型结果与AmpFLSTR Identifiler试剂盒完全一致,且灵敏度高于AmpFLSTR Identifiler试剂盒。结论本系统可以应用于个人识别和亲权鉴定,为降解DNA样本分型提供了新的方法。     

广州地区人群15个STR基因座遗传多态性

本文调查了采用广州地区无关人群D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、vWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA等15个STR基因座遗传多态性,为法医个体识别和亲缘鉴定提供了重要数据。1材料与方法1.1样本通过广州市公安局DNA数据库,抽取2001~2005年广州市各类案件中的涉案人员中无亲缘关系样本共计3398份。1.2样本DNA的提取及扩增分别采用Chelex-100法[1]、酚/氯仿抽提和IQTM磁珠试剂盒法提取DNA。按照说明书使用IdentifilerTM荧光复合扩增试剂盒,使用缩减为8μl的反应体…     

24个Y-STR基因座荧光标记复合扩增体系的建立

目的构建包含24个Y-STR基因座的荧光标记复合扩增体系。方法选择DYS531、DYS630、DYS622、DYS552、DYS510、DYS449、DYS459a/b、DYS446、DYS443、DYS635、DYS587、DYS527a/b、DYS460、Y-GATA-A10、DYS520、DYS557、DYS522、DYS481、DYS570、DYS385a/b、DYS444 24个Y-STR基因座,构建荧光复合扩增体系。检测该体系的特异性、同一性、灵敏度、扩增均衡性、抗干扰性和准确性,调查其在广东地区人群的基因多样性。结果建立的复合扩增体系在检测的非人类及女性样本中未发现谱带,同一个体不同组织检测结果一致,0.1 ng以上标准品9948可检测获得完整分型结果。常见抑制物中体系内加入120~200μmol/L血红素、1.5~2.0 mmol/L钙离子时出现等位基因丢失,对靛蓝、腐殖酸、EDTA具有较强抗干扰性。通过146例无关个体与Yfiler系统平行检测比对,24 Y-STR检测体系分型准确。广东地区人群单倍型多样性(HD)为0.999 72,优于Yfiler系统(HD=0.998 58)。结论本研究建立的24个Y-STR基因座荧光标记复合扩增体系法医学应用前景广阔,可用于案件检验、亲权鉴定与Y-STR数据库建设。