HUMCYAR04基因座扩增片段长度多态性

HUMCYAR04基因座是Holly等人[1]报道的一个短串联重复序列（STR）基因座。笔者根据本实验室的条件，以中国人为研究对象，进行了此基因座的扩增和频率调查，并用于法医物证常见的血痕、混合斑的检验，取得了较好的效果。材料和方法一、实验材料1．血液取自昆明及玉溪地区191名无关汉族个体的静脉血，构椽酸钠抗凝；2混合斑及组织决、血痕血样实验室办案中积累；3．家系血样自愿者提供；4HUMCYAR04序列[1]：5’GGTAAGCAGGTACTTAGTTAGCTAC－3’；5’－GTTACAGTGAGCCAAGGTCGTGAG－3’。由北京赛百盛（美国）生物工…     

牛四核苷酸STR基因座的筛选和多态性分析

目的筛选阴影带出现率低且多态性较高的牛四核苷酸STR基因座。方法用Tandem repeats finder软件搜索牛基因组中的四核苷酸重复STR序列片段,用Primer Premier 5.0软件设计引物,然后扩增、电泳,筛选出符合要求的STR基因座,并对100份无关黄牛个体血样进行STR基因座分型。结果共筛选出6个具有多态性的牛四核苷酸重复STR基因座（B006、B007、B008、B022、B025、B026）,其100份无关黄牛个体血样的累积个体识别率和累积非父排除概率分别为0.99995和0.859591。结论本研究筛选出的6个四核苷酸STR基因座阴影带出现率低且多态性较高,可用于牛的个体识别和亲子鉴定的研究。     

TKM法提取血液DNA调查山西地区人群的HUMTPOX基因座多态性

采用TKM法提取DNA模板,进行PCR扩增,对山西地区汉族人群的HUMTPOX基因座[1]进行了群体遗传学调查,获得山西地区HUMTPOX基因座的群体遗传学数据。所用方法,结果显示较佳,现报告如下。1材料与方法1．1材料TKM1溶液：10mmol／L,Tris－HCI（pH7．4）;10mmoVLKCI;10mmol／LMgC12;Zmmol／LEDTAoTKMZ溶液：TKMI溶液中加0．4mol／LN。CI．10％SDS及NP－40。互．2DNAM取0．sml抗凝血加入0．smlTKMI溶液和12．splNP－40,混匀,室温下离心10min（30O0r／min）,奔上清,细胞沉淀中再加TKMI溶液,混匀后再离…     

16个X-STR基因座的连锁不平衡检验和突变率调查

目的：检测X染色体上16个STR基因座的连锁不平衡情况,并对其遗传稳定性进行调查。方法从华东汉族群体选取女性无关个体500名、家系885个,提取血样DNA,利用自主研发的IDtyperX-16试剂盒对16个X-STR基因座进行多重PCR扩增和毛细管电泳分型,使用PowerMarker v3.25软件对基因座进行连锁不平衡检验,并分析各个基因座的突变率。结果16个X-STR基因座彼此之间不存在连锁不平衡现象;有10个基因座检见突变,其中DXS6809和DXS7132的突变率均高达0.0048。结论对于IDtyperX-16试剂盒中的16个X-STR基因座,在亲权鉴定中应用时可运用乘积原理计算似然率,但若遇到不符合遗传规律的情形（尤其是DXS6809、DXS7132基因座）,应考虑存在突变的可能。     

男性样本Amel基因座Y片段引物结合区变异1例

1案例资料 1.1 简要案情 2011年11月23日在某地发现1具无名尸体,经解剖仅具有男性生理特征,现场有1处血迹.提取无名尸血样及现场血迹进行DNA分型检验. 1.2 DNA检验 采用Chelex-100法提取尸体及现场血迹样本DNA.采用ID试剂盒进行PCR复合扩增,扩增产物经3130遗传分析仪进行毛细管电泳,用GenemapperID v3.2软件分析各基因座的基因型.2份检材的分型结果一致,提示为同一人,但牙釉质蛋白基因座(amelogenin gene,Amel)分型显示为女性(图1).     

亲子鉴定中D8S1179基因座等位基因丢失分析1例

1案例资料1.1简要案情田某,女,36岁,因落户需要,要求对其与女儿进行亲权鉴定。1.2检验方法采用Chelex法抽取血样样本DNA;分别用Power Plex21试剂盒（普洛麦格（北京）生物科技有限公司）、GoldeneyeTM20A试剂盒（北京基点认知公司）进行复合PCR扩增;用3130XL遗传分析仪（美国AB公司）进行毛细管电泳,用GeneMapperIDv3．2软件进行基因型分析。     

应用等电聚焦电泳调查武汉地区人群红细胞EsD基因频率

<正> 为了解我国人群稀有基因分布情况,作者用薄层聚丙烯酰胺凝胶等电聚焦电泳,对武汉地区人群 EsD 多态性作了调查。材料与方法1.血样处理血样采自武汉地区无亲缘关系健康成人。取静脉血1ml,生理盐水洗涤2次,取压积红细胞加等量蒸馏水置-18℃冰冻过夜,温融后离心。取溶血物加等体     

中国成都地区汉族群体四核苷酸重复序列FIBRA基因座的多态性

建立FIBRA基因座Amp-FLP分型方法,分析136个无关中国成都地区汉族人群中STRFIBRA基因座的多态性,并将其应用于法医学实践。用Amp－FLP技术,丙烯酰胺凝胶电泳,银染,对FIBRA基因座进行分型。观察到16个等位基因,44种不同的基因型。观察杂合度（H）为0．9044,个体识别力（DP）为0．9588,多态性信息量（PIC）为0．8595,非父排除率（CE）为67．4％,观察的基因型分布符合Hardy－Weinberg平衡;10个家系调查结果表明,该基因座符合孟德尔遗传规律。FIBRA基因座多态性好,所建立的Amp-FLP方法适用于法科学的亲子鉴定和个人识别。     

16个X-STR基因座的连锁不平衡检验和突变率调查CSCD

目的检测X染色体上16个STR基因座的连锁不平衡情况,并对其遗传稳定性进行调查。方法从华东汉族群体选取女性无关个体500名、家系885个,提取血样DNA,利用自主研发的IDtyper X-16试剂盒对16个X-STR基因座进行多重PCR扩增和毛细管电泳分型,使用Power Marker v3.25软件对基因座进行连锁不平衡检验,并分析各个基因座的突变率。结果 16个X-STR基因座彼此之间不存在连锁不平衡现象;有10个基因座检见突变,其中DXS6809和DXS7132的突变率均高达0.004 8。结论对于IDtyper X-16试剂盒中的16个X-STR基因座,在亲权鉴定中应用时可运用乘积原理计算似然率,但若遇到不符合遗传规律的情形(尤其是DXS6809、DXS7132基因座),应考虑存在突变的可能。     

中国人D7S21基因应5′端侧翼DNA多态性

分析D7S21基因座5’端侧翼DNA3个基因座多态性（－4A／G、－109C／T和一22lG／C）和单倍体分型。用PCR和扩增产物限制性内切酶酶解的方法检测了100名中国人无关个体的多态性,获得了6个不同等位基因的频率,即-4A＝0．29,－4G＝0．71,－109C＝0．54,－109T＝0．46,－221G＝0．74,－221C＝0．26。结果表明,D7SZI基因座5’端侧翼DNA3个基因座的DP值达0．944,在法医学个体识别中具有很高的个体识别能力。     

15个STR基因座的突变观察和分析

目的调查15个STR基因座的突变情况。方法采集817例亲子鉴定的2722份血样本,采用Identi—filerTM系统扩增15个STR基因座分型,共有33060次等位基因传递,统计各基因座发生突变的频率。结果在15个基因座中发现涉及11个基因座共25次突变,平均突变率为0．8×101（95％C10．5—1．1×10-3）,其中一步突变20次,两步突变3次,三步突变2次;父、母来源突变比率为2．6：1,不能确定来源突变7次。结论STR基因座等位基因在IdentifilerTM复合扩增系统突变现象较为常见,亲子鉴定时应引起注意。     

河南地区人群3个基因座的基因频率分布

从血痕、血液、精斑中提取DNA对河南地区随机人群CSFIPO、TPOX和TH01基因座（CTT）进行了基因频率分布调查,现报道如下。1材料与方法137例血样取自河南省血液中心和本实验室检案材料;精斑为本实验室检案积累。采用Chexelx－100处理法提取DNA模板,混合斑中DNA的提取采用两步消化法（‘］。复合扩增采用Promega公司Geneprint试剂盒试剂,按试剂盒说明书操作。扩增产物用4％聚丙烯酸胺变性凝胶分离,恒功率40W电泳1．sh。检测用eromesa公司银染试剂盒,按其说明书操作。通过凝胶中标本扩增带与Promege公司提供的全等位基因标准…     

6个STR基因座在宁夏山区回族聚居区的多态性

<正> 128名无关个体血样,取自宁夏回族聚居之南部山区6县。Chelex法提取DNA,按Promega公司试剂盒操作方法进行D16S539、D7S820、D13S317、CSF1PO、TPOX、TH01等6个基因座的复合扩增,并进行聚丙烯酰胺变性胶电泳分离和银染检测,得到基因分型及各基因座等位基因频率分布(表1)。     

D19S433稀有等位基因的确认和判读2例

1案例资料1.1简要案情日常检案中发现的疑为D19S433基因座稀有等位基因的2例亲权鉴定。1.2实验方法采用Chelex-100法提取甲、甲父、乙和乙母的DNA;使用Power Plex21试剂盒（promega公司,美国）和AGCU Expressmarker 22试剂盒（无锡中德美联公司）进行STR复合扩增;PCR扩增产物在ABI-3130型遗传分析仪（ABI,美国）上进行毛细管电泳,电泳信息由DataCollection数据收集软件自动收集,GeneMapperID v3．2．1软件分析数据获得各基因座的基因型。     

湖南地区汉族人群18个STR基因座遗传多态性

本文应用DNATyper19直扩试剂盒（公安部物证鉴定中心研制）,对湖南地区汉族人群18个STR基因座进行遗传多态性调查,为法医学研究和实践提供基础数据。1材料与方法1.1样本从湖南省违法犯罪人员数据库筛选获得2 437份湖南地区汉族无关个体血样（博坤公司血样采集卡）,样本来源地覆盖全省14个市州。1.2 STR扩增及分型检测采用DNATyper19直扩试剂盒进行直接扩增,     

重庆地区汉族群体Amelogenin及9个STR基因座的群体遗传学调查

对重庆地区汉族群体200例无关个体进行Amelogenin及9个STR基因座群体遗传学调查,并对人血液（痕）、精斑、组织、染色的细胞涂片、毛发、牙齿及骨骼组织进行基因型测定,并用于法科学检查。采用Chelex或酚-氯仿提取DNA荧光标记复合扩增法对Amelogenin及9个STR基因座,即D3S1358、VWA、FGA、TH01．TPOX、CSF1PO、DSS818、D135317、D75820进行复合扩增,扩增产物由毛细管电泳进行分离和荧光检测。9个STR基因座分别发现6、7、17、7、5、8、7、7、7个等位基因,其最高的基因频率分别是0．3900、0．2480、0．1650、0．5380、0．5280、0．4500、0．3140、0．3150、0．4000。发现的基因型数分别是16、25、71、20、12、22、26、22、26个。基因型频率均符合Hardy－Weinberg平衡,未发现基因连锁。9个STR基因座的DP值分别是0．8610、0．9220、0．9750、0．8020、0．7730、0．8780、0．9210、0．9140、0．8990,累计DP值是0．9999;非父排除率分别是0．5990、0．5450、0．7650、0．2950、0．3620、0．4520、0．6840、0．6660、0．5180,累积非父排除率是0．9995;杂合度分别是0．8000、0．7700、0．8850、0．6030、0．6550、0．7150、0．8440、0．8350、0．7550,累积杂合度是0．9999。证明这些基因座均适用于重庆     

3个miniSTR基因座在湖南汉族人群中的遗传多态性

目的建立扩增片段小于120bp,包括D10S1248、D2S441和D1S16773个miniSTR基因座的复合扩增系统,并调查其在湖南汉族人群中的遗传多态性。方法采用不同荧光染料标记引物,通过PCR扩增,利用ABI 310遗传分析仪对186份无关个体血样进行3个miniSTR基因座片段长度分析。结果D10S1248、D2S441和D1S1677 miniSTR基因座均获得了清晰的基因分型结果,经对186名无关个体进行分析,分别检出9、7、7个等位基因和21、19、15种基因型,基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡。3个基因座在湖南汉族人群的非父排除率和个体识别力分别为0．465、0．491、0．361和0．886、0．899、0．818。结论建立的3个miniSTR基因座扩增系统在DNA高度降解检材分析中具有较高的应用价值,并且在湖南汉族人群中具有较好的遗传多态性,可应用于个体识别和亲权鉴定。     

广东地区汉族人群 13个 STR基因座的频率调查

目的调查广东地区汉族无关个体的 13个 STR基因座（ D3S1358、 vWA、 FGA、 D8S1179、 D21S11、 D18S51、 D5S818、 D13S317、 D7S820、 D1 6S539、 TH01、 TPOX、 CSF1PO）多态性,研究其在法医学检验中的应用价值。方法用 AmpFlSTR Profiler Plus及 Cofiler二个荧光标记系统对新鲜血样进行 13个基因座的复合扩增,用 ABI 377-96全自动测序仪对扩增产物进行检测,用 GenoTyper软件进行基因分型。结果 13个基因座 PIC >0.5,DP >0.76,家系调查符合孟德尔遗传规律。结论含有 13个 STR基因座的二个荧光标记复合扩增系统可满足法医物证学的个体识别及亲权鉴定的需要。     

汉族人群五个STR基因座的多态性调查

应用PCR及PAG电泳技术研究了PLA2A、vWA、CYP19、TH和LPL五个基因座的多态性，调查武汉地区汉族无关个体，获得汉族人群的频率分布。五个基因座基因型频率分布与Hardy-Weinberg平衡吻合良好、分别计算基因座的杂合度（H）、个人识别能力（Dp）、非父排除率（PE）和多态性信息总量（PIC）。为法医学应用提供了基础数据。     

DNA遗传标记STR基因座的高分辨电泳分型

应用聚丙烯酰胺凝胶水平不连续电泳和自动激光荧光DNA分析等两种高分辨电泳技术，比较和评估它们对4个STR基因座分型的准确性。结果表明，两者对HUMTH01、HUMVWA和HUM-FES三个基因座的分型结果完全一致。对HUMTHF13A基因座分型，聚丙烯酰胺凝胶水平不连续电泳获得的结果与自动激光荧光DNA分析不具可比性。