法医学二代测序STR分型准确度与测序深度的关联性评估

目的利用实验数据对法医学二代测序STR分型测序深度与分型结果准确度的关联性进行评估。方法使用商业化基因组DNA制备单一来源和混合的DNA样本,以Thermo Fisher公司的25重早期测试试剂盒进行目的STR片段扩增,每种扩增产物分别使用4种不同的序列标签平行建库,并控制标记每一种序列标签的文库上机量依次占一张Ion 318芯片的1/4、1/8、1/16、1/32。经Ion PGMTM基因测序仪测序,以及Ion Torrent SuiteTM软件进行数据分析;同时对庞敬博等人发表的基于相同试剂盒和测序仪检测的95名中国汉族无关个体的6928条等位基因、影子峰和噪音序列进行测序深度统计分析,寻找测序深度与STR分型准确度的关联性。结果各基因座测序深度随文库上样量减少而呈明显下降趋势。对于单一来源样本,每张芯片上样不超过8个均一化文库可实现全部基因座的完整分型;对于1∶20比例的混合DNA,每张芯片上样不超过4个均一化文库时,未发现微量组分的等位基因丢失。人群数据测序深度统计显示,该体系基因座间存在不均衡性,有必要针对各基因座分别设定分析阈值参数。结论测序深度与法医学STR分型结果的准确性密切相关,各基因座最低测序深度与平均测序深度的比值可作为设定分析阈值的重要参考指标。本研究确定的单张芯片上样数量仅适用于本实验体系,但相关实验设计和方案可供其他实验体系开展类似工作参考。     

MHSeq Typer47试剂盒在亲缘关系鉴定中的应用效能评估

目的探讨MHSeqTyper47试剂盒在亲缘关系鉴定中的应用价值。方法采用MHSeqTyper47试剂盒对113份亲缘关系个体DNA样本进行基因座复合扩增及文库构建,使用MiSeq FGx测序仪进行测序,测得的数据应用MHTyper数据分析软件进行基因分型,计算亲缘关系指数评估该试剂盒在亲缘关系鉴定中的应用效能并与GlobalFiler^TM试剂盒进行比较。结果MHSeqTyper47在三联体鉴定中CPI值1.43×10¹¹～6.15×10¹⁸,二联体鉴定中CPI值3.75×10⁵～1.53×10¹³,全同胞鉴定中CFSI值7.73×10¹～2.59×10¹⁶,三联体、二联体和全同胞关系对均与无关个体对可以完全区分。MHSeqTyper47和GlobalFiler^TM试剂盒联用在二级亲缘关系中的系统效能为0.466 2。结论MHSeqTyper47混合DNA鉴定试剂盒在一级亲缘关系鉴定中有较高的应用价值;与Glob...     

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2004年7月18日下午，自治区党委办公厅在南宁召开赴京出席第七次全国归侨侨眷代表大会广西代表座谈会，自治区党委刘奇葆副书记亲切接见并与全体代表进行座谈，勉励和鼓舞代表们开好会。图中：自治区党委副书记刘奇葆；右二：自治区党委常委、组织部副部长覃郁华；左二：自治区党委办公厅副主任苏海棠；右一：自治区侨联副主席、广西代表团副团长王永朗；左一：自治区侨联副主席、广西代表团副团长韦穗奇。