贵州汉族人群6个STR基因座的多态性

参照美国Ｐｒｏｍｅｇａ公司的方法 ,应用ＳＴＲ复合扩增技术对 6个ＳＴＲ基因座 ,即ＣＳＦ1ＰＯ、ＴＰＯＸ、ＴＨ0 1、Ｄ7Ｓ82 0、Ｄ16Ｓ5 39、Ｄ13Ｓ317的基因频率分布进行调查 ,以获得贵州汉族人群的多态性资料 ,为实际检案提供参考数据。对贵州 (地区 ) 10 8份汉族无关个体的血样 ,用Ｃｈｅｌｅｘ 10 0法提取ＤＮＡ ,按Ｐｒｏｍｅｇａ公司试剂盒操作手册进行上述6个基因座的复合扩增。经ＤＮＡ分型和统计学分析 ,10 8份检材 6个基因座的累计个人识别率为 :0 99999887。所有基因座经 χ2检验 ,符合Ｈａｒｄｙ Ｗｅｉｎｂｅｒｇ平衡。本…     

哈尔滨(地区)人群CSF1 PO-TPOX-TH01基因座的基因频率调查

参照美国Ｐｒｏｍｅｇａ公司的方法 ,复合扩增ＣＳＦ1ＰＯ、ＴＰＯＸ、ＴＨ0 1基因座 ,并对 3个基因座的基因频率分布进行调查。1　材料和方法1 1　材料血样取自哈尔滨 (地区 )人群的无关个体。采耳血制成干血纱。1 2　方法1 2 1　引物　Ｐｒｏｍｅｇａ公司的ＣＴＴ复合扩增系统试剂盒提供。1 2 2　ＤＮＡ提取　用Ｃｈｅｌｅｘ〔1〕方法提取血纱ＤＮＡ。1 2 3　ＰＣＲ复合扩增　采用ＧｅｎｅｐｒｉｎｔＳＴＲｓｙｓｔｅｍＣＴＴ试剂盒 (ＰｒｏｍｅｇａＵＳＡ ) :2 5μｌ 10×ｂｕｆｆｅｒ(10ｍｍｏｌ/ＬＴｒｉｓ ＨＣｌｐＨ9 0 ,50 0ｍ…     

哈尔滨地区汉族人群3个基因座的基因频率调查

短串联重复序列(ＳＴＲ)由2～5ｂｐ的核心序列串联重复构成。ＳＴＲ广泛分布于整个基因组中,是人类重要的遗传标记系统,现已被广泛用于法医个体识别和亲权鉴定中。本文作者对哈尔滨地区160名无关个体的Ｄ16Ｓ539、Ｄ7Ｓ820、Ｄ13Ｓ317基因座进行基因频率分布调查,其结果如下1　材料与方法11　材料160名本室检案积累的无关个体血样;Ｐｒｏｍｅｇａ公司的Ｓｉｌｖｅｒｌｌ复合扩增系统试剂盒。12　方法采用酚—氯仿抽提法提取血样ＤＮＡ。ＰＣＲ复合扩增,其基因座[1、2]引物,ＰＣＲ反应在25μｌ[3]体系中进行,25μｌ10×ｂｕｆｆｅｒ(10ｍｍｏ…     

荧光标记复合扩增对中国汉族群体8个STR基因座的多态性

应用ＳＴＲ复合扩增技术对ＦＢＩ推荐的 8个ＳＴＲ基因座 ,即Ｄ5Ｓ818,Ｄ13Ｓ317,Ｄ7Ｓ82 0 ,Ｄ16Ｓ539,ｖＷＡ ,ＴＨ0 1,ＴＰＯＸ ,ＣＳＦ1ＰＯ ,进行荧光复合扩增 ,其产物经ＡＢＩ377ＸＬ序列分析仪检测 ,对 110名中国汉人无关个体进行频率调查 ,为大规模ＤＮＡ数据库的建立提供有益探索。1　材料和方法1 1　实验材料无关个体血样来自本室日常检案积累 ;扩增及检测试剂购自美国ＰＲＯＭＥＧＡ公司 ;ＡＢＩ377ＸＬ序列分析仪。1 2　实验方法〔1、2〕　1 2 1　ＤＮＡ模板的制备　 5%ｃｈｅｌｅｘ10 0 (Ｂｉｏ ｒａｄ)2 0 0ｍｌ处理 ,56℃孵…     

河南地区汉族群体9个STR基因座的频率分布调查

应用ＰＣＲ技术 ,对 9个ＳＴＲ基因座分三组 (Ⅰ组 :ＣＳＦ1ＰＯ ,ＴＰＯＸ ,ＴＨ0 1;Ⅱ组Ｆ13Ａ0 1,ＦＥＳＦＰＳ ,ｖＷＡ ;Ⅲ :Ｄ16Ｓ539.Ｄ7Ｓ82 0 ,Ｄ13Ｓ317)进行复合扩增 ,对河南地区汉族 10 0例无关个体血样ＤＮＡ进行群体调查 ,得到 9个基因座的基因频率。计算出各基因座及 9个基因座综合的杂合度 (Ｈ)、多态性信息总量(ＰＩＣ)、鉴别机率 (Ｄｐ)、匹配概率 (Ｐｍ)和非父排除率 (ＰＥ) ,并在常规的办案中应用三组 9个ＳＴＲ基因座对各类案件进行检验 ,结果报告如下。1　结果与讨论9个基因座的分型结果经 χ2 检验 ,均符合Ｈａｒｄｙ…     

广西壮汉群体3个STR基因座的遗传多态性

ＳＴＲ广泛存在于人类基因组中。其多态性好 ,易于扩增 ,且扩增片段短 ( 10 0～ 50 0ｂｐ) ,多个ＳＴＲ基因座的联合使用完全能达到同一认定[1、2 ] 。国内有关Ｄ16Ｓ539、Ｄ7Ｓ82 0、Ｄ13Ｓ317基因座的人群调查资料相对较少。本文作者对上述基因座在广西壮、汉群体中的遗传多态性进行了研究。1　材料与方法1 1　群体及家系样本广西地区壮、汉人群无关个体的橼酸钠抗凝血分别采自广西壮族自区崇左县的壮族农民自愿者、南宁市某中学的汉族学生自愿者 ;2个三代家系 ( 1个三代5人和 1个三代 7人 ) ;30例经其它ＤＮＡ技术检测确定亲生关系 (ＲＣ…     

太原地区汉族人群3个STR基因座的多态性分析

短串联重复序列 (ＳＴＲ)属微卫星ＤＮＡ ,在人类基因组中广泛分布。具有ＶＮＴＲ序列特征的ＳＴＲ基因座已成为一类重要的遗传标记。ＳＴＲ基因座多态片段长度小 ,ＰＣＲ扩增成功率高 ,尤其对ＳＴＲ基因座进行复合扩增使单次扩增获得多基因座的信息量 ,简单 ,快速得到分型结果 ,在法医鉴定中具有重要的意义[1] 。应用复合扩增方法调查了太原地区汉族人群 3个ＳＴＲ即Ｄ16Ｓ539、Ｄ7Ｓ82 0和Ｐ13Ｓ317基因座的基因频率分布 ,获得了 3个ＳＴＲ多态性基因座的遗传学数据。1　材料方法1 1　实验材料1 1 1　样本　 10 1例ＥＤＴＡ抗凝血来自无亲…     

武汉汉族人群D14S608、D16S3253、D21S1437基因座多态性

利用ＰＣＲ和ＰＡＧＥ技术 ,对武地区汉族人群Ｄ14Ｓ60 8、Ｄ16Ｓ3 2 5 3、Ｄ2 1Ｓ14 3 73个ＳＴＲ基因座进行调查。2 80例武汉地区汉族无关个体抗凝血样取自同济医院血库。ＤＮＡ提取、ＰＣＲ扩增产物检测 ,基因型命名及群体数据参照杨庆恩方法[1] ,3个ＳＴＲ基本特征和其引物参数文献[2 ] 。武汉汉族人群Ｄ 14Ｓ60 8、Ｄ 16Ｓ3 2 5 3和Ｄ2 1Ｓ14 3 7等位基因频率分布见表 1。Ｄ14Ｓ60 8、Ｄ16Ｓ3 2 5 3和Ｄ2 1Ｓ14 3 7基因座Ｈ、ＤＰ、Ｐｍ和ＰＩＣ值见表 2。　　为了从众多的ＳＴＲ位点中筛选出频率更好、分型稳定的ＳＴＲ基因座。选取了…     

哈尔滨(地区)汉族人群F13A01、FESFPS、vWA基因座多态性

参照美国Ｐｒｏｍｅｇａ公司Ｇｅｎｅｐｒｉｎｔ试剂盒提供的方法 ,采用Ｆ13Ａ0 1、ＦＥＳＦＰＳ、ｖＷＡ三基因座复合扩增技术 ,对哈尔滨 (地区 )汉族人群中 16 3个无关个体的 3个基因座进行基因频率分布调查 ,现报告如下。1　结果与讨论通过对 16 3名无关个体的血样经酚、氯仿萃取法提取ＤＮＡ ,ＰＣＲ扩增 ,用标准等位基因作参照物 ,电泳分离 ,银染检测后 ,进行ＤＮＡ分型和统计学分析。Ｆ13Ａ0 1基因座观察到 4个等位基因 ,9个基因型 ;ＦＥＳＦＰＳ基因座观察到6个等位基因 ,13个基因型 ;ｖＷＡ基因座观察到 8个等位基因 ,2 3个基因型 ;…     

浙江汉族人群9个STR基因座的遗传多态性调查

利用四色荧光标记复合扩增的方法 ,在同一反应管内复合扩增Ｄ3Ｓ1358、ｖＷＡ、ＦＧＡ、Ｄ8Ｓ1179、Ｄ2 1Ｓ11、Ｄ18Ｓ51、Ｄ5Ｓ818、Ｄ13Ｓ317及Ｄ7Ｓ82 0九个ＳＴＲ基因座。扩增产物用ＡＢＩ310型基因分析仪进行毛细管电泳分离 ,自动荧光检测予以分型。经对2 0 0名浙江汉族无关个体进行群体遗传学调查 ,获得该 9个ＳＴＲ基因座的频率分布 ,以及各基因座的杂合度 (Ｈ)、个人识别能力 (ＤＰ)、偶合率 (ＰＭ)、非父排除率 (ＥＰＰ)和多态性信息总量 (ＰＩＣ)等群体遗传学参数 ,为法医学应用提供理论依据 ,现报告如下。1　材料与方法1 1　实验…     

广西壮族人群2个Y-STR基因座多态性研究

1999年Ｗｈｉｔｅ等[1] 报道了 7个Ｙ ＳＴＲ基因座 ,其核心重复序列均为ＧＡＴＡ。本文作者对其中Ａ10、Ａ7 1两个基因座在中国壮族人群中的分布频率进行了调查 ,报告如下。1　材料及方法1 1　样品及其ＤＮＡ提取来源于广西壮族无关男性个体血斑 10 0份 ,4℃低温保存。采用Ｃｈｅｌｅｘ 10 0快速提取法[2 ] 。离心后4℃低温保存。1 2　引物合成与标记根据文献 [1]。由上海生物工程公司合成如下引物序列。Ａ10和Ａ7 1引物的 5′端用ＦＡＭ标记。1 3　ＰＣＲ扩增及其产物检测10 μｌ反应体系 ,包括 10×ＰＥＢｕｆｆｅｒⅡ (Ｐｅｒｋｉｎ Ｅ…     

中国新疆维吾尔族群体DYS389Ⅰ/Ⅱ、DYS390 基因座及单倍型遗传多态性分析

在法医检验实践中 ,Ｙ染色体一直被用作性别鉴定。ＤＹＳ390、ＤＹＳ389Ⅰ /Ⅱ基因座是Ｙ染色体上分别以ＣＴＧＴ/ＣＴＡＴ为核心序列重复单位的微卫星。本文作者对中国新疆维吾尔族男性 3个Ｙ ＳＴＲ (Ｙｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓｐｅｃｉｆｉｃｓｈｏｒｔｔａｎｄｅｍｒｅｐｅａｔ ,简称Ｙ ＳＴＲ)基因座基因型及单倍型构成进行了研究 ,并分析其遗传多态性。1　材料与方法1 1　样本ＤＮＡ56份静脉抗凝血随机采自中国新疆乌鲁木齐市无血缘关系健康维吾尔族男性个体。Ｃｈｅｌｅｘ法提取ＤＮＡ。1 2　引物序列[1] (Ｃｙｂｅｒｓｙｎ公司合成 )…     

法医常染色体STR分型

短串联重复序列 (ＳＴＲ)是广泛存在于人类基因组中的一类具有长度多态性的ＤＮＡ序列。它由 2～ 6个碱基对构成核心序列 ,呈串联重复排列 ,其长度多态性主要由核心序列拷贝数目的变化而产生。一般认为 ,人类基因组平均每 6～ 10ｋｂ就有 1个ＳＴＲ基因座 ,为法医个人识别和亲子鉴定提供了高信息基因座的丰富来源。与限制性片段长度多态性产生的ＤＮＡ指纹相比 ,用聚合酶链反应技术 (ＰＣＲ)扩增ＳＴＲ基因座产生的ＤＮＡ纹印具有更高的灵敏度。ＳＴＲ扩增片段较短 (10 0～ 30 0ｂｐ) ,对于常见含部分降解ＤＮＡ的陈旧斑痕 ,ＰＣＲ扩增ＳＴ…     

南方汉族、黎族人群15个STR基因座频率调查

目的调查南方汉族、黎族人群无关个体的15个STR基因座(D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、vWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA)多态性,研究其在法医学检验中的应用价值。方法应用AmpFlSTRIdentifilerTM荧光标记复合扩增系统对南方332例汉族、334例黎族无关个体血样DNA进行15个STR基因座的复合扩增,用ABI3100遗传分析仪对扩增产物进行检测,用GeneScan、GenoTyper软件进行基因分型,统计计算15个STR基因座的群体遗传学参数。结果IdentifilerTM荧光标记系统的15个STR基因座在南方汉族、黎族人群的累积偶合率分别为4.94×10-17、2.50×10-17,累积非父排除率分别为0.9999989、0.9999988。结论该15个STR基因座足可满足南方汉族、黎族法医学的个体识别及亲权鉴定的需要。     

D2S1338和D19S433基因座的多态性及其法医学应用

为了寻找在法医学上更有应用价值 ,且适用于国内外实验室交流的ＳＴＲ标记系统 ,本文作者应用ＰＣＲ复合扩增和四色荧光技术对Ｄ2Ｓ1338和Ｄ19Ｓ4 33基因座进行了研究 ,并初步将其运用于法医学检验。现将结果报道如下。1　材料与方法1 1　样本收集 160名华东地区汉族无关个体血样 ,制成血斑纱布 ,用于频率调查 ;5 0个两代家系血样 ,用于家系调查 ;及本室近期收检的 90例亲子鉴定和 7例个体识别案生物学检材 ,用于案例检验。1 2　方法用Ｃｈｅｌｅｘ法提取血样ＤＮＡ ,扩增用ＰＥＡｍＰＦ1ＳＴＲＳＧＭＰｌｕｓ试剂盒 (方法见说明书 )。ＰＣ…     

STR基因座特性及其多态性

微卫星ＤＮＡ(ｍｉｎｉｓａｔｅｌｌｉｔｅＤＮＡ)或称短串联重复序列(ｓｈｏｒｔｔａｎｄｅｍｒｅｐｅａｔ,ＳＴＲ),约占人类基因组的10%。其分布均匀,重复单位长1～6ｂｐ,重复次数10～60次。ＳＴＲ基因座等位基因片段短(100～500ｂｐ),适合于陈旧及降解检材的分析,避免短片段等位基因优先扩增而造成的错误判型;易进行复合扩增,提高有限检材的利用率和检验速度。因此,ＳＴＲ基因座在法医学领域得到广泛应用。目前已发现数千个ＳＴＲ基因座,常用的有20个左右。在欧洲,至少75%的实验室用四核苷酸重复基因座,即ＴＨ01、ｖＷＡ31、Ｆ13及ＦＥＳ…     

福建汉族群体3个VNTR基因座的多态性及其在亲子鉴定中的应用

为了获得福建汉族群体Ｄ2Ｓ4 4、Ｄ10Ｓ2 8、Ｄ4Ｓ16 3三个ＶＮＴＲ基因座的遗传信息 ,提高亲子鉴定的准确性 ,本文作者应用ＲＦＬＰ技术 ,Ｌｉｆｅｃｏｄｅｓ公司提供的试剂 ,首次对福建省上述 3个基因座的多态性进行调查和用此基因座检测的亲子鉴定案进行分析 ,现报告如下。1　材料及方法1 1　样本来源10 3份样本来源于世代居住在福建省区域的汉族健康无关成年个体 ;15例亲子鉴定案例为本站近年检测。每份样本均采血 1ｍｌ,用ＥＤＴＡ抗凝 ,由本站保存于超低温冰箱 (- 80℃ )中。1 2　方法1 2 1　提取样本中ＤＮＡ　取ＥＤＴＡ抗凝血样 5…     

云南彝族、瑶族、壮族及回族群体3个STR基因座的遗传多态性

采用ＳＴＲ ＰＣＲ技术从血痕中提取ＤＮＡ ,复合扩增ＣＳＦ1ＰＯ、ＴＰＯＸ和ＴＨ0 13个基因座 ,对云南彝族、瑶族、壮族和回族群体的等位基因进行基因频率分布调查 ,现报道如下。1　材料与方法1 1　样本云南峨山县彝族 172人 ,云南勐腊县瑶族 10 0人 ,云南蒙自县壮族 137人 ,云南澄江县回族 112人。均为健康、三代无与其他民族通婚史 ,彼此间无血缘关系。1 2　ＤＮＡ提取取 5× 5ｍｍ血痕纱布 ,剪碎放入 1 5ｍｌＥｐｐｅｎｏｒｆ管 ,加入消化液 30 0 μｌ (ＡＧＴＣＩｎｃ) 2 0 μｌ蛋白酶Ｋ溶液 ,2 0 μｌ 1 0ｍｏｌ/ＬＤＴＴ ,37℃过夜 …     

海南黎族群体14个STR基因座遗传多态性

STR基因座是建立DNA数据库首选遗传标记,建库需要针对目标人群做了大量的基因频率调查,本文作者应用公安部物证鉴定中心研发的DNATyperTM15试剂盒,对345个海南黎族无关个体14个基因座进行了调查。1材料与方法样本345份无关个体血样取自看守所内在押海南黎族人,采指尖末梢静脉血滴于滤纸上,阴干保存。DNA提取全部345份检材均选用Chelex-100法提取DNA[1]。复合扩增应用公安部物证鉴定中心研发的DNATyperTM15试剂盒,对14基因座进行复合PCR扩增。扩增体系为B ffer 2.0μl,10×primer 1.0μl,Taq酶0.2μl,灭菌水5.8μl,模板DNA 1.0…     

亲子鉴定中2个STR基因座突变1例

目前 ,国内外亲子鉴定案例中多采用ＳＴＲ基因座分型方法。由于ＳＴＲ序列核心序列短 ,在遗传过程发生变异的机会较高 ,已引起法医分子生物学和遗传学工作者的重视[1] 。但在父子二代的一家中有 2个ＳＴＲ基因座同时突变较为罕见 ,现报道如下。1　案情与检验结果1例因移民要求做亲子鉴定的案件 ,受检者争议父 4 0岁 ,母 37岁 ,子 10岁 ,均为东莞汉族人。用Ｃｈｅｌｅｘ 10 0提取新鲜血的ＤＮＡ。先用ＧｅｎｅｐｒｉｎｔＰｏｗｅｒｐｌｅｘ[ＴＭ ] 16ｓｙｓｔｅｍ试剂盒 (Ｐｒｏｍｅｇａ公司 )检测Ｄ3Ｓ135 8、ＴＨ0 1、Ｄ2 1Ｓ11、Ｄ18Ｓ5 1…