3种提取高度腐败检材DNA的方法比较

本文对3种DNA提取方法在高度腐败检材DNA提取中的应用进行了比较,供法医学实践参考。1材料与方法1.1材料3份检材均为尸体肋软骨,其中1号为死后在水里浸泡18天解剖,酒精固定2年的检材,2号检材为死后15天解剖,酒精固定1年的检材,3号检材为死后10天解剖,后酒精固定1月的检材。1.2 DNA提取Chelex-100法[1]3份检材各500mg剪粹,分别加入200μl 5%Chelex-100,10μl PK(10mg/m l),10μlDTT(39mmol/m l二硫苏糖醇),37℃水浴过夜,100℃加热10m in,剧烈震荡,10 000 r/m in离心10m in,上清备用。有机法[2]3份检材各500mg剪粹,分别加入400μl TES…     

微量生物检材常规初检后再行PCR检验的方法

在实际检案中，经常遇到案发现场可获取的生物检材量微，在进行必要的种属检验、精斑确证实验、ABO血型检验等常规物证初检后，便无多余的生物检材移送DNA实验室进一步做法医DNA检验。因此，笔者通过对检案中遇到的上述微量物证检材的再行处理利用，在本实验室条件下，对其进行了TH０１、HUMACTBP２、AluVpA、DIS８０等位点的DNA－PCR分析，获得了良好的效果。使其在实际办案中更充分地发挥了证据作用，报告如下。１材料与方法检案中已经种属或ABO血型检验后的血痕、唾液斑（如烟蒂外层纸）浸泡凹板，加入３００μl去离子水，…     

室外毛巾上腐败血痕STR分析1例报道

1材料与方法1.1案例2006年某日,深圳市某山顶发现一具高度腐败女尸,现场提取一块方形小毛巾(有灰黑色可疑血痕),送检做DNA检测。1.2方法1.2.1提取DNA方法一:常规Chelex-100法[1]提取方形小毛巾上可疑血痕。方法二:应用德国QIAGEN公司生产的BioRo-bot EZ1全自动核酸纯化仪[2](以下简称BioRobotEZ1)提取方形小毛巾上可疑血痕。(1)剪取适量检材,置0.5 ml Eppendorf管中,加入EZ1试剂盒(EZ1 DNA Tissue Kit(48)(Cat.No.953034))中试剂BufferG2 190μl,PK 10μl,56℃裂解30 min,去载体将裂解液转移置2.0 ml样本管中。(2)在BioRobo…     

TH01基因座等位基因丢失1例

<正>1案例资料2010年,本市发生1起入室盗窃案,现场提取血痕2份、烟蒂1枚。采用Chelex法提取检材DNA,使用Identifiler试剂盒10μL体系在AB 9700型扩增仪上进行扩增;扩增产物经AB 3130型遗传分析仪检测,GeneMapperID V3.2软件进行分析。结果血痕、烟蒂为同一个体所留,其中TH01基因座为纯合子(7)。     

MPure-12全自动核酸纯化仪与Chelex-100法的比较CSCD

目的通过对DNA含量不同的血痕和多种类型生物学检材进行DNA提取和STR分型检测,探讨MPure-12全自动核酸纯化仪(MPure-12法)在DNA提取中的法医学应用价值。方法收集血痕、精斑、唾液等9种类型的生物学检材,应用MPure-12法和传统Chelex-100法提取DNA,经过PCR扩增和电泳,获取STR分型图谱。结果 MPure-12法对发根、口香糖、烟蒂、肌肉组织、唾液斑、血痕、精斑这些检材能够成功分型,唾液出现了个别等位基因丢失现象,接触拭子分型较差。Chelex-100法对血量为20μL、15μL、10μL、5μL、1μL制成的血痕均有完整分型结果,MPure-12法在血量为1μL时出现等位基因丢失现象。结论 MPure-12法适用于一定浓度血样的检验,而对于微量血样,Chelex-100法提取DNA的效果可能更优。仪器应用于DNA提取具有操作简单、快速、提取效率高,分型成功率高,减少人为污染等优势。     

MPure-12全自动核酸纯化仪与Chelex-100法的比较

目的通过对DNA含量不同的血痕和多种类型生物学检材进行DNA提取和STR分型检测,探讨MPure-12全自动核酸纯化仪(MPure-12法)在DNA提取中的法医学应用价值。方法收集血痕、精斑、唾液等9种类型的生物学检材,应用MPure-12法和传统Chelex-100法提取DNA,经过PCR扩增和电泳,获取STR分型图谱。结果 MPure-12法对发根、口香糖、烟蒂、肌肉组织、唾液斑、血痕、精斑这些检材能够成功分型,唾液出现了个别等位基因丢失现象,接触拭子分型较差。Chelex-100法对血量为20μL、15μL、10μL、5μL、1μL制成的血痕均有完整分型结果,MPure-12法在血量为1μL时出现等位基因丢失现象。结论 MPure-12法适用于一定浓度血样的检验,而对于微量血样,Chelex-100法提取DNA的效果可能更优。仪器应用于DNA提取具有操作简单、快速、提取效率高,分型成功率高,减少人为污染等优势。     

一种改良Chelex地方法提取血痕DNA

对于新鲜或量足的血痕,采用文献报道的Chelex-100直接处理提取DNA,一般都能获得满意结果,但在日常检案过程中,陈旧而量少的血痕检材经常遇到,而且载体可能有泥沙、色素或吸附力强等PCR扩增抑制物的存在.这类检材DNA采用普通的Chelex-100快速提取法,有时很难奏效.针对以上问题,本文结合两例检案,对血痕DNA的Chelex-100快速提取法进行了一些改良,显著提高了检出率,使检案成功,报告如下:1 材料与方法1.1 材料:取自本实验室检验的两案例中的22份血痕.     

Chelex-100提取生物检材DNA实时PCR定量研究

目的研究Chelex-100法提取的生物检材DNA用量与复合STR分型成功率的关系。方法113份各种生物检材采用Chelex-100法提取DNA，应用Quantifiler人类DNA定量试剂盒在ABI 7500荧光定量PCR仪上进行实时PCR定量，同时用Identifiler复合扩增系统在ABI 3100遗传分析仪上对这些DNA样品进行STR分型。结果各种生物检材提取的DNA浓度分别为：37份滤纸、纱布血痕0．042～5．28ng／μl，16份口腔拭子1．15—4．21ng／μl，18份烟头0．016～1．46ng／μl，10份肋软骨0．531—14．40ng／μl，8份肌肉5．75—24．80ng／μl，7份指甲0．788—11．50ng／μl，17份精斑0．79～99．50ng／μl。在建立的8μl扩增体系中，根据上述结果，调整用于复合STR扩增的DNA模板量在0．5—3ng之间，大部分样品可获得完全的STR分型。结论Chelex-100法提取的检材DNA模板用量在0．5—3ng之间可得到有效STR扩增，浓度为0．5ng／μl以上的DNA样品，用小体积模板（1μl）比大体积（3μl）模板扩增效果好。     

河南地区人群3个基因座的基因频率分布

从血痕、血液、精斑中提取DNA对河南地区随机人群CSFIPO、TPOX和TH01基因座（CTT）进行了基因频率分布调查,现报道如下。1材料与方法137例血样取自河南省血液中心和本实验室检案材料;精斑为本实验室检案积累。采用Chexelx－100处理法提取DNA模板,混合斑中DNA的提取采用两步消化法（‘］。复合扩增采用Promega公司Geneprint试剂盒试剂,按试剂盒说明书操作。扩增产物用4％聚丙烯酸胺变性凝胶分离,恒功率40W电泳1．sh。检测用eromesa公司银染试剂盒,按其说明书操作。通过凝胶中标本扩增带与Promege公司提供的全等位基因标准…     

精斑检材的3种提取方法比较

在日常检案中,精斑检材提取,常规应用Chelex-100法和酚/氯仿抽提法获得精子DNA。Chelex-100法耗时短,提取的精子的DNA量多,但所含的杂质也多,常影响扩增结果。酚/氯仿抽提法获得精子的DNA纯度高,但抽提过程中要用到有毒的化学制剂,消化、抽提耗时长,且抽提过程易造成DNA损失。本文直接应用磁珠法裂解提取精子DNA,获得优于Chelex-100法的高纯度的DNA,且把精斑的提取时间从酚/氯仿抽提法的2~3d缩减到7~8h。同时尝试了一步消化后的精斑检材,使用DNA自动工作站进行DNA提取,大大提高了办案效率。1材料与方法1.1精斑检材性犯罪案件中含…     

Chelex-100法和QIAcube纯化法在接触性检材检验中的比较

<正>在法医DNA检验中,能否提取到足够浓度与纯度的DNA模板,是决定DNA检验成败的关键之一。本研究分别采用Chelex-100法与QIAamp DNA Investigator试剂盒结合QIAcube核酸自动化提取仪(QIAcube纯化法)提取实际检案中的DNA,同等条件下进行PCR扩增与电泳,比较分析二者的图谱,报道如下。1材料与方法1.1材料65份接触性生物检材来自本实验室日常检案积累,其中瓶口32份,工具手柄18份,绳索衣物类     

直接扩增法在血痕、肋软骨和唾液检材中的应用

目的采用Identifiler Direct PCR试剂盒直接扩增法进行棉签擦拭血痕、肋软骨和烟蒂唾液斑DNA分型检验,并评价其应用价值。方法收集棉签擦拭血痕、烟蒂各20份,肋软骨10份,采用Identifiler Direct PCR试剂盒进行直接扩增及分型检验,以相同检材采用磁珠法/Chelex-100法提取模板DNA后扩增检验结果作为对照,对两组所得结果进行比较分析。结果棉签擦拭血痕和肋软骨一次检测完整分型率均为100%,分型结果与对照组一致;烟蒂上唾液斑有2份检材第一次未能完整分型,调整方法再次检验后获分型成功。结论实际检案中的棉签血痕、肋软骨和烟上唾液斑,采用直接扩增法检测,方法简单、快速、稳定、检材用量小,可在实际检案中选择使用。     

水中浸泡50余小时口罩上DNA检验1例

1案件简介2005年2月4日凌晨,我省某县发生一起特大入室抢劫杀人案,案发后50多个小时,在距离案发地1km处一农用大口井内打捞出一个沾有大量淤泥的白色口罩及其他相关犯罪物品。我们重点对口罩进行了DNA检验。2检验与结果(1)取适量检材,常规150μl5%的Chelex-100提取DNA。(2)取(1)中DNA50μl以Microcon-100浓缩柱浓缩至10μl,分别以模板DNA1、2μl进行Plus试剂盒扩增(28个循环,10μl体系),结果1μl模板DNA扩增出4 1个位点(见图2-A)。图2 Microcon-100浓缩柱提取的口罩DNA,Plus试剂盒扩增(28个循环,10μl体系)图谱A:模板1μl(3)取(1)…     

Profiler Plus试剂盒扩增Amelogenin基因座变异1例

目的探讨日常检案及DNA数据库建设中常用的ProfilerPlus系统扩增法医生物检材可能出现的变异情况。方法分别采用ProfilerPlus试剂盒扩增、毛细管电泳分析及Amelogenin单基因座扩增、银染技术分型两种方法分别检测两份血痕的基因型。结果应用ProfilerPlus试剂盒扩增、毛细管电泳分析发现X-Y同源Amelogenin基因座的X片段丢失,而运用Amelogenin单基因座扩增、银染技术分型则X片段正常出现。结论应用ProfilerPlus系统分析法医生物检材,有可能出现等位基因丢失现象,此现象需要引起我们在日常检案及DNA数据库建设中的足够重视。     

特殊检材的DNA检验3例

法医物证鉴定中,较常见的生物学检材有现场血痕、精斑、毛发、牙齿、香烟过滤嘴及在抵抗中遗留在当事人指甲缝中的生物成分DNA[1].但在实际工作中,发现提取的生物检材复杂多样,对于一些疑难检材在DNA提取方面便成为难点,而这些特殊检材的成功分析往往对案件的定性和侦破起着至关重要的作用.现将3个案例中4份特殊检材的DNA检验报道如下.     

生物检材DNA碱性裂解提取法的优化与改良

目的通过对DNA碱性裂解提取法进行优化和改进,建立一种操作更简便、检验快速、结果更可靠的生物检材DNA提取方法。方法以抗凝血作为检验样本,通过改变提取试剂的浓度、pH值、保存时间及孵化样本的温度、时间等条件,观测对检验结果峰值的影响,以确定提取试剂最佳条件,DNA提取物最佳保存条件。通过用改良后的碱性裂解法及Chelex100法同时提取不同量的抗凝血样本、各类法医生物检材,用不同厂家的DNA试剂盒扩增,对碱性裂解法的灵敏度、适应性和适用性进行评估。结果改良后的碱性裂解法只需将生物检材用NaOH（0.25mol/L）99℃孵化8min,振荡后加入TrisHCl（0.05mol/L,pH=6.5）中和液,离心后直接扩增检测。DNA提取物于-20℃冰箱可长期保存。对于毛发及精斑类检材优于Chelex100法。DNA提取物适用于现有各种DNA试剂盒扩增检测,其灵敏度与Chelex100法相似。结论改良后的碱性裂解法,操作简便、检验快速、结果可靠,可适合于法庭科学的检案与建库。     

Maxwell 16裂解纯化法提取陈旧精子DNA的应用

目的利用Maxwell 16裂解纯化法从保存8年以上陈旧精斑检材中获取精子DNA。方法 8份陈旧精斑检材采用Maxwell 16裂解纯化法提取精子DNA,并采用Powerplex○R21试剂盒进行复合扩增,产物用AB3130型遗传分析仪检测,结果与常规方法进行对比。结果成功获得8份陈旧精斑检材精子STR分型。结论差异裂解配合Maxwell 16裂解在陈旧精斑检材精子DNA检验中效果明显。     

指甲垢中异体DNA的检验

在人体伤害案件中,受害人与案犯有近距离的接触或搏斗时,有可能抓刮到案犯皮肤,并在指甲垢里留下肉眼看不到的皮屑组织等微量生物检材,本文对11例指甲垢中异体DNA检验做了分析,以期为同类案件的鉴定提供借鉴。1材料与方法1.1样本来自本实验室日常案件中24名死者(女性20人,男性4人)的240枚指甲,直接剪取指甲板突出皮肤的边缘部分。其中机械性窒息死亡17人,失血性休克死亡4人,颅脑损伤死亡3人;死亡时间最短1h,最长7d。1.2方法试剂5%Chelex-100,蛋白酶K,AmpFISTR(Profiler Plus试剂盒(AB I公司),AmpFLSTR ProfilerIdentifilerTM试剂…     

混合精斑DNA三种提取方法的比较

在法医物证学上,对于混合斑检材,一般采用Chelex法[1,2]抽提DNA,由于得率和纯度较低,检测存在失败的可能。为了提高成功率,作者对检案过程中抽提DNA的步骤进行了优化,现报道如下。1材料与方法1.1检验材料1号检材为卫生巾,2号检材为卫生纸,3、4号检材均为蓝色内裤,其中3号检材较脏且混有血痕。分别剪取1～4号检材微量,涂片经伊红美兰染色,镜检,1、2、4号检材均检见人精子,3号检材检见大量上皮细胞及少量人精子。1.2仪器与试剂梯度PCR仪(德国,Eppendorf);DYY-Ⅲ-4型稳压稳流电泳仪(北京六一仪器厂);人STR六个双基因座复合扩增银染试剂…     

指甲末端微量物证的DNA检验

1材料与方法1.1材料检材取自近两年35例刑事案件,其中受害人指甲31例(男11例,女20例),嫌疑人指甲4例(均为男性)。1.2方法用0.5cm×0.5cm滤纸两步擦拭法[1]转移指甲末端微量物证,加入5%Chelex-100和蛋白酶K,震荡混匀后置56℃保温1h,99℃8min,提取的DNA用Microcon-100柱纯化处理。用Amp FlSTR(ProfilerPlusTM系统复合扩增试剂盒进行STR基因座复合扩增,扩增产物经ABI 3100或ABI 3130X1型基因分析仪荧光检测分型。2结果与讨论在送检的35例检材中,检出含有他人DNA的案例15例,其中受害人为女性的13例,其中婴幼儿1例;男性2例。具体见表…