PCR扩增ZFY/ZFX基因鉴定人类干血痕性别

应用 PCR 技术同时扩增人 ZFY 和 ZFX 基因特异的 DNA 序列,在男性血痕中可检测到两种扩增产物,即340bp 长的 ZFY 基因及488bp 长的 ZFX 基因特异 DNA 片段;在女性血痕中仅可检测到488bp 长的 ZFX 基因特异 DNA 片段,据此判定干血痕性别。干血痕的最小检出需要量为0.125μl 血液量的血痕。室温保存10年的血痕可以准确判定性别。ZFY 基因位于 Y 染色体短臂。本方法同时检测两条性染色体,可以避免由于扩增失败或 Y 染色体长臂变异出现的假阴性或假阳性。扩增产物经琼脂糖凝胶电泳即可区分。     

DNA提取方法和PCR循环次数对STR扩增成功率的影响

目的探讨常见载体上的微量血痕DNA的提取方法、PCR循环次数对STR扩增成功率的影响。方法分别应用Chelex-100法及Chelex-100结合纯化法对8种载体上不同大小的血痕样本进行DNA提取,并采用28次、30次及34次PCR循环进行STR扩增,分别观察其扩增成功率。结果经28次、30次及34次PCR循环,Chelex-100法提取DNA后的STR扩增成功率分别为0.2917,0.3333,0.4583,Chelex-100结合纯化法的STR扩增成功率分别为0.3750,0.4583,0.8750。结论用Chelex-100结合纯化法提取DNA,用34次循环扩增可提高STR基因座的检测成功率。     

一种改良Chelex地方法提取血痕DNA

对于新鲜或量足的血痕,采用文献报道的Chelex-100直接处理提取DNA,一般都能获得满意结果,但在日常检案过程中,陈旧而量少的血痕检材经常遇到,而且载体可能有泥沙、色素或吸附力强等PCR扩增抑制物的存在.这类检材DNA采用普通的Chelex-100快速提取法,有时很难奏效.针对以上问题,本文结合两例检案,对血痕DNA的Chelex-100快速提取法进行了一些改良,显著提高了检出率,使检案成功,报告如下:1 材料与方法1.1 材料:取自本实验室检验的两案例中的22份血痕.     

联苯胺试验对血痕DNA检验的影响

目的探讨联苯胺试验及相关试剂对血痕DNA检验的影响。方法制作含1μL静脉血的滤纸血痕970份,其中10份为对照样本,960份经联苯胺试验及相关试剂分别处理后,采用Chelex-100法和硅珠法提取DNA,Amp F詛STR~(TM)Identifiler~(TM)Plus PCR扩增试剂盒进行复合扩增,对比各组STR分型结果。结果联苯胺试验后立即提取DNA,硅珠法的STR基因座检出数为(3.80±1.34)个,而Chelex-100法均未获得STR分型结果;联苯胺试验后干燥处理,硅珠法有13例(21.7%)获得全部STR基因座分型结果,且STR基因座检出数[(12.90±1.49)个]远高于Chelex-100法[(4.70±1.96)个](P0.05);加入冰醋酸后立即提取DNA,硅珠法的STR基因座检出数为(9.40±2.09)个,而Chelex-100法均未获得STR分型结果;只加冰醋酸后干燥处理以及只加四甲基联苯胺乙醇饱和溶液或3%过氧化氢溶液,两种方法均获得完整15个STR基因座分型结果。结论联苯胺试验对血痕的后续DNA检验有很大的影响,Chelex-100法不适合联苯胺试验后血痕的DNA检验,联苯胺试验后干燥处理及采用硅珠纯化的方法可有效提升联苯胺试验后血痕的STR基因座检出数。     

用引物Y_3,Y_4和DNA扩增技术作血液(痕)和毛根性别鉴定的研究

作者用引物Y_3、Y_4和DNA聚合酶链式反应(PCR)作微量人类血液(痕)和毛根的性别鉴定。扩增的靶序列位于Y染色体DNA特异3.4kb重复序列中,扩增产物为460bp。检材用量为:新鲜血液0.5μl、血痕纱纤维1mm、毛根单个。20例保存4个月的血痕与2例保存6年半的血痕性别判定结果均正确,无性别记载的保存9～11年的3例血痕显现了清晰的460bpY特异DNA扩增带。15例保存20天的自然脱落毛根性别判定结果均正确。本法省略了检材处理中的酚-氯仿抽提DNA等纯化步骤,既简化了实验操作,又减少了检验过程中外源DNA的污染机会和样品DNA的损耗,使这一性别鉴定方法更符合法医学实践的需要。     

Chelex-100提取生物检材DNA实时PCR定量研究

目的研究Chelex-100法提取的生物检材DNA用量与复合STR分型成功率的关系。方法113份各种生物检材采用Chelex-100法提取DNA，应用Quantifiler人类DNA定量试剂盒在ABI 7500荧光定量PCR仪上进行实时PCR定量，同时用Identifiler复合扩增系统在ABI 3100遗传分析仪上对这些DNA样品进行STR分型。结果各种生物检材提取的DNA浓度分别为：37份滤纸、纱布血痕0．042～5．28ng／μl，16份口腔拭子1．15—4．21ng／μl，18份烟头0．016～1．46ng／μl，10份肋软骨0．531—14．40ng／μl，8份肌肉5．75—24．80ng／μl，7份指甲0．788—11．50ng／μl，17份精斑0．79～99．50ng／μl。在建立的8μl扩增体系中，根据上述结果，调整用于复合STR扩增的DNA模板量在0．5—3ng之间，大部分样品可获得完全的STR分型。结论Chelex-100法提取的检材DNA模板用量在0．5—3ng之间可得到有效STR扩增，浓度为0．5ng／μl以上的DNA样品，用小体积模板（1μl）比大体积（3μl）模板扩增效果好。     

吸附性载体上微量血痕的DNA分型

目的研究吸附性载体上微量血痕的DNA提取及其检验。方法用Chelex-100法、QIAamp MiniKit、及QIAamp Mini Kit改良法提取吸附性载体上微量血痕中的DNA,进行PCR扩增及STR检验。结果采用Chelex-100法及QIAamp Mini Kit的分型成功率很低;采用QIAamp Mini Kit的改良法能较好的得到分型图谱。结论采用QIAamp Mini Kit的改良法能较好的提取吸附性载体上微量血痕的模板DNA。     

MPure-12全自动核酸纯化仪与Chelex-100法的比较CSCD

目的通过对DNA含量不同的血痕和多种类型生物学检材进行DNA提取和STR分型检测,探讨MPure-12全自动核酸纯化仪(MPure-12法)在DNA提取中的法医学应用价值。方法收集血痕、精斑、唾液等9种类型的生物学检材,应用MPure-12法和传统Chelex-100法提取DNA,经过PCR扩增和电泳,获取STR分型图谱。结果 MPure-12法对发根、口香糖、烟蒂、肌肉组织、唾液斑、血痕、精斑这些检材能够成功分型,唾液出现了个别等位基因丢失现象,接触拭子分型较差。Chelex-100法对血量为20μL、15μL、10μL、5μL、1μL制成的血痕均有完整分型结果,MPure-12法在血量为1μL时出现等位基因丢失现象。结论 MPure-12法适用于一定浓度血样的检验,而对于微量血样,Chelex-100法提取DNA的效果可能更优。仪器应用于DNA提取具有操作简单、快速、提取效率高,分型成功率高,减少人为污染等优势。     

MPure-12全自动核酸纯化仪与Chelex-100法的比较

目的通过对DNA含量不同的血痕和多种类型生物学检材进行DNA提取和STR分型检测,探讨MPure-12全自动核酸纯化仪(MPure-12法)在DNA提取中的法医学应用价值。方法收集血痕、精斑、唾液等9种类型的生物学检材,应用MPure-12法和传统Chelex-100法提取DNA,经过PCR扩增和电泳,获取STR分型图谱。结果 MPure-12法对发根、口香糖、烟蒂、肌肉组织、唾液斑、血痕、精斑这些检材能够成功分型,唾液出现了个别等位基因丢失现象,接触拭子分型较差。Chelex-100法对血量为20μL、15μL、10μL、5μL、1μL制成的血痕均有完整分型结果,MPure-12法在血量为1μL时出现等位基因丢失现象。结论 MPure-12法适用于一定浓度血样的检验,而对于微量血样,Chelex-100法提取DNA的效果可能更优。仪器应用于DNA提取具有操作简单、快速、提取效率高,分型成功率高,减少人为污染等优势。     

微量PCR反应体系在两种试剂盒中的应用

美国AB I公司的Profiler PlusTM试剂盒和Identifi-lerTM试剂盒在当前法医DNA检案中应用广泛,但价格昂贵。本实验利用5μl体系进行PCR扩增取得满意效果,降低了检验成本。1材料与方法1.1材料法医DNA检案中常规检材,血痕、精斑、烟蒂和毛发(带毛囊)各20份。Profiler PlusTM试剂盒和IdentifilerTM试剂盒(AB I,USA)。1.2方法1.2.1 DNA提取上述检材采用Chelex-100法[1]提取模板DNA。取9mm2血痕加入5%Chelex-100150μl,56℃2h;精斑经两步法视镜检精子量多少酌情加入5%Chelex-100 150~250μl,PK 10μl(2mg/m l),DTT 10μl(1mol/L…     

Deoxyribonucleic acid (DNA) typing of human leukocyte antigen (HLA)-DQA1 from single hairs in Japanese.

The deoxyribonucleic acid (DNA) typing of human leukocyte antigen (HLA)-DQA1 from single hairs is described. HLA-DQA1 genotypes could be determined from single plucked hair roots. However, it was not easy to type HLA-DQA1 with hair shaft portions. Increase in the specimens of hair shaft portions (over 10 cm in length) to get sufficient DNA caused inhibition of polymerase chain reaction (PCR). Synthetic melanin as well as the one extracted from hairs inhibited the PCR of the genomic DNA template when added to the PCR reaction at the concentrations over than 15 ng/100 microL. Therefore, typability of hair shaft portions seems to depend on the delicate balance of the concentrations of DNA and the contaminated melanin in the final DNA extracts.     

Possibilities for using bedside cards as secondary comparison in trace element studies with the PCR technique]

When fresh blood is not available as a control in stain investigations extracted teeth, hair, preserved tissue samples, histological slides, cigarette butts or used stamps can also be used. This paper reports on a stain investigation performed 7 months after the death of the victim, where a bedside card from the medical records was successfully employed as a control blood sample. In a series of 10 bedside cards up to 9 years old, the investigation with the PCR method showed recognizable patterns in the STR systems SE 33 and TC 11. Matching patterns could be found from the 4 sections of each card (anti A, anti B, anti AB and anti D). A comparison of the oldest card with a fresh blood sample of the patient also showed matching patterns. AMPFLPs were successful with more recent cards. Using the PCR method typing of bedside cards from medical records up to 10 years old can be used in stain investigations.     

Short tandem repeat (STR) genotyping of keratinised hair. Part 1. Review of current status and knowledge gaps

We present a review of the literature on procedures for obtaining short tandem repeat (STR) genotypes from keratinised hair, being either hair shaft or telogen phase (naturally shed) hairs without associated scalp, follicle or sheath cells. Both the hair shaft and the telogen hair club have been subjected to the DNA-degrading keratinisation process and are more likely to be found at a crime scene than anagen (plucked) or catagen phase hairs. We discuss human hair structure, the human hair growth cycle, the keratinisation process and their implications for DNA extraction procedures, PCR amplification strategies and the interpretation of STR genotypes. Knowledge gaps and areas requiring research are identified and are the subject of a second article in this series.     

Phosphoglucomutase types in blood and hair roots taken from post-transfusion subjects

Pre- and post-transfusion blood samples were collected from 22 subjects together with the corresponding plucked hair samples taken 2 days and 2 weeks after the transfusion. The phosphoglucomutase1 (PGM1) subphenotypes of blood and hair were determined by isoelectric focusing and the phenotypes confirmed by gel electrophoresis. Many of the post-transfusion blood samples showed an alteration in the PGM1 bands when compared with the pre-transfusion samples. However, the PGM1 types determined from the hair samples were identical to the corresponding pre-transfusion samples in all cases.     

PCR－RFLP技术鉴定ABO基因型的法医学应用研究

目的建立PCR－RFLP、非变性PAG胶垂直电泳和银染技术进行ABO基因分型的方法体系,并对200名广东汉族人群ABO基因型频率进行了调查。方法用Chelex－100和酚、氯仿抽提法处理样本,PCR扩增后用非变性聚丙烯酰胺凝胶垂直电泳和银染技术检测分型。结果ABO位点特异性扩增片段长度为175bp～210bp,6种基因型频率分布为0.0250～0.4300,杂合度H值为0.5162,个体识别力DP值为0.7111。结论该方法可成功运用于血液、血痕、精斑、毛发、骨组织和混合斑等检材的个体识别及亲权鉴定的检验。     

直接扩增法在血痕、肋软骨和唾液检材中的应用

目的采用Identifiler Direct PCR试剂盒直接扩增法进行棉签擦拭血痕、肋软骨和烟蒂唾液斑DNA分型检验,并评价其应用价值。方法收集棉签擦拭血痕、烟蒂各20份,肋软骨10份,采用Identifiler Direct PCR试剂盒进行直接扩增及分型检验,以相同检材采用磁珠法/Chelex-100法提取模板DNA后扩增检验结果作为对照,对两组所得结果进行比较分析。结果棉签擦拭血痕和肋软骨一次检测完整分型率均为100%,分型结果与对照组一致;烟蒂上唾液斑有2份检材第一次未能完整分型,调整方法再次检验后获分型成功。结论实际检案中的棉签血痕、肋软骨和烟上唾液斑,采用直接扩增法检测,方法简单、快速、稳定、检材用量小,可在实际检案中选择使用。     

用引物Y_3、Y_4和PCR方法鉴定性别的法医学应用

用Y3、Y4和Alu9．1、Alug．2两对引物和PCR方法检测陈旧血痕和毛根的性别获得成功。引物Y3、Y4扩增的靶序列位于Y染色体特异3．4Kb重复序列中，扩增产物为460bp；引物Alu9．1、Alu9.2用以扩增男女共有的Alu重复序列，扩增产物为130bP。室温保存13年之久的19例脐带血血痕（男性9冽，女性10例）和室温保存10～11个月的10例已知性别自然脱落毛根（男性6例，女性4例）的性别测定结果均正确；对一起凶杀案的血痕性别测定为定案提供了重要证据。本方法简化了样品的前处理过程。     

一种简便的DNA提取方法在动物毛发检验中的应用

目的建立一种简便的DNA提取方法,用于动物毛干的DNA抽提。方法利用PCR缓冲液及蛋白酶K在PCR仪上对毛发进行消化,以此DNA为模板,扩增mtDNA 12S rRNA基因的部分片段并进行序列测定,测序结果在GenBank上进行BLAST搜索,再利用DNAMAN软件进行同源性分析。结果利用这种新DNA抽提法能从无毛囊毛发中获得后续PCR扩增所需的线粒体DNA。结论该法在无毛囊毛发样本鉴定中具有较高的应用价值。     

扩增X—Y同源Amelogenin基因内含子在性别鉴定中的应用研究

本文用一对针对X－Y同源的Amelogenin基因第一内含子的引物，于同一试管中分别扩增出针对于x和Y染色体的特异性DNA片段：106bp及112bp的PCR产物，经聚丙烯酰胺凝胶电泳后用银染法观察扩增结果，取得了满意的效果．对50pgDNA模板室温放置16年的血痕及单根毛发、烟头等检材均可得到明确的性别鉴定结果．本实验证明该方法简便、灵敏、可靠、特别适用于腐败降解检材的法医学性别鉴定．