石蜡包埋人体组织DNA分型的研究

目的研究石蜡包埋人体组织的DNA提取方法对其STR分型的影响,并建立石蜡包埋组织的DNA提取方法。方法经不同预处理条件后采用Chelex-100法提取石蜡包埋人体组织中的DNA,用不同的反应体系进行STR复合扩增检验。结果经福尔马林固定、石蜡包埋的人体组织直接采用Celex-100法提取DNA与65℃水浴除蜡后采用Celex-100法提取DNA均可获得满意的DNA分型。结论该方法简便易行,实验效果好,适合检案。     

HE染色涂片上精子DNA的提取与HLA-DQa基因扩增分型

本文对ＨＥ染色涂片上精子ＤＮＡ的提取、ＰＣＲ扩增分型的可行性与可靠性进行了研究。２０张ＨＥ染色涂片的实验结果表明：ＨＥ染色涂片上的精子是可以被回收并提取到ＤＮＡ进行ＨＬＡ－ＤＱａ基因的ＰＣＲ扩增分型的，其分型结果准确可靠。这说明精子的ＨＥ染色涂片也是进行ＤＮＡ分析的一种很好的检材来源。     

甲醛固定石蜡包埋组织STR分型检测

目的评估10%甲醛固定石蜡包埋组织STR分型结果的影响因素。方法采用QIAGEN法、IQ法、Chelex法对2具新鲜尸体在尸检时常规制备的心、脑、肝、脾、肾、肺、胃、肠石蜡包埋组织进行DNA提取,用AmpFlSTR Identifiler试剂盒进行PCR扩增,在3100-Avant上完成片段分析。另外对15个案例中室温保存1～5年的心、肝、肺、肠存档石蜡包埋组织共56份采用同样的方法进行STR分型。以STR基因座检出率评估分型有效性。结果各种组织DNA片段均随着保存时间延长而持续降解,其中心、肺组织STR基因座检出率与保存时间存在线性相关。相同保存时间时,各种组织基因座检出率差异有统计学意义。其中以肺组织在不同保存时间中基因座检出率最高。结论在甲醛固定时间一定的条件下,存放时间、组织类型、DNA提取方法和PCR模板质量浓度是影响石蜡包埋组织STR分型的重要因素。     

Triton X-100快速提取甲醛固定、石蜡包埋组织内DNA的方法

目的建立一种快速提取甲醛固定、石蜡包埋组织内DNA的方法。方法利用TritonX-100一步提取甲醛固定、石蜡包埋组织内DNA,并具体研究了不同浓度TritonX-100对提取后DNA-STR分型效果的影响。结果成功地一步提取出甲醛固定、石蜡包埋组织内DNA,浓度为1%的TritonX-100提取效果较好。结论利用TritonX-100提取甲醛固定、石蜡包埋组织内的DNA,为快速提取DNA提供了有效的途径,是法科学领域中一种值得推荐的方法。     

中国黎族人群13个STR基因座的多态性调查

应用四色荧光标记引物复合扩增技术 ,对 2 13名黎族无关个体的 13个ＳＴＲ基因座进行分型研究 ,计算中国黎族 13个ＳＴＲ基因座的基因频率 ,统计分析各基因座的杂合度 (Ｈ)、多态信息总量 (ＰＩＣ)、个体识别机率 (Ｄｐ)及累积个体识别率、累积非父排除率。1　材料和方法1 1　材料黎族无关个体血样 2 13份 ,取自海南省琼中黎族自治县、陵水黎族自治县等黎族居住地。抽取静脉血液涂布于滤纸上 ,阴干保存。1 2　方法1 2 1　ＤＮＡ提取　所有检材均应用Ｃｈｅｌｅｘ 10 0法提取ＤＮＡ。1 2 2　ＰＣＲ试剂　用ＡＢＩ公司Ｐｒｏｆｉｌｅｒ Ｐｌ…     

癌组织的基因突变对PCR反应及结果分析的影响

在实际检案中,办案人员有时送检石蜡包埋人体病理组织(癌)或切片。这类检材由于存在基因突变的可能,往往影响正确的结果分析,使给出鉴定结论造成困难。某地发生一起保险欺诈案件中,送检子宫癌病理组织蜡块,要求与当事人的血液进行同一认定,笔者通过该案例检验探讨癌组织的基因突变对PCR反应及结果分析的影响。1材料与方法采用Chelex-100法提取当事人的血液样本DNA,经PCR扩增,获得STR分型(图1)。采用文献[1]的方法提取DNA,经PCR扩增,获得STR分型(图2)。2讨论(1)本例检验结果表明,癌组织的基因突变会影响PCR扩增,使STR分型结果发…     

混合精斑的DNA检验结果分析

1999年 8月 ,河南高某 (女 ,2 8岁 )被两名犯罪分子轮奸 ,现场提取带有精斑的短裤 1件。经侦察 ,当地公安局发现 2名重大嫌疑人王某和秦某 ,遂将现场提取的精斑和两嫌疑人的血样进行ＤＮＡ检验。1　材料与方法1 1　检验材料现场提取的受害人高某所穿的短裤 1件 ,裆部有精斑 ,编为 1号 ;受害人高某、嫌疑人王某和秦某的血液各 1份 ,分别编为 2、3、4号。1 2　ＤＮＡ的提取用两步分离法分离 1号混合斑中的精子 ,并用Ｃｈｅｌｅｘ法提取精子ＤＮＡ ;用Ｃｈｅｌｅｘ法直接提取 2、3、4号ＤＮＡ。1 3　ＤＮＡ的扩增及检测用ＡｍｐＦＩＳＴＲＰｒ…     

镜下单片状头屑DNA提取分型法与EZ-tape法的比较

目的改进常规头屑类样本的EZ-tape提取分型方法,借助显微镜采集单片状头屑,提高样本利用率、降低漏检率,并减少混合分型结果比例。方法采用EZ-tape脱落细胞粘取器和透明胶带粘取2名志愿者轮流佩戴的帽子内侧,EZ-tape法遵循传统方法直接提取DNA,镜下单片状头屑DNA提取分型法(简称"单片头屑分析法")则借助显微镜分拣出透明胶带中的单片状头屑。两种方法均分别进行持续振荡和静置消化。所有样本均采用Chelex-100法提取DNA,扩增及电泳后获得STR分型。比较EZ-tape法及单片头屑分析法所获的STR分型结果。结果 EZ-tape法所获分型中11份(45.8%)样本发生漏检,仅获得单一来源的分型结果,10份(41.7%)样本为混合分型结果,其中6份样本有等位基因插入或丢失。单片头屑分析法有12份样本获得了与志愿者一致的单一来源分型结果,仅2份样本获得混合分型结果。振荡处理的分型准确数高于静置消化(P0.05)。结论 DNA提取过程中进行振荡有利于DNA的释放。单片头屑分析法获得单一来源STR分型成功率较高,样本漏检率低,可作为法医临案工作中头屑类特殊检材的特定样本采集方式。     

3种DNA提取法在污染严重混合斑分型中的应用比较

目的比较Chelex-100法、酚/氯仿法和二氧化硅膜法3种DNA提取法在污染严重混合斑分型中的应用效果。方法从日常案例中收集污染严重的混合斑25份,差异消化法分离精子后同时用Chelex-100法、酚/氯仿法和二氧化硅膜技术3种方法提取DNA,采用PCR-STR技术对D19S253、FGA和CSF1PO 3个基因座进行分型,Gel-Pro软件处理电泳图谱,SPSS软件分析比较不同方法之间的差异。结果采用Chelex-100法提取DNA,25份检材分型结果均未成功;采用酚/氯仿法,25份检材中10份分型成功,3份检材FGA和CSF1PO基因座可分型,4份检材CSF1PO基因座可分型;采二氧化硅膜纯化法,25份检材均成功分型;酚/氯仿法和二氧化硅膜法两种方法比较,结果存在显著性差异(P<0.05)。结论二氧化硅膜纯化技术可以有效去除PCR抑制物,提取的DNA扩增效果明显优于Chelex-100法和酚/氯仿法,具有较高的应用价值。     

哈尔滨(地区)汉族人群F13A01、FESFPS、vWA基因座多态性

参照美国Ｐｒｏｍｅｇａ公司Ｇｅｎｅｐｒｉｎｔ试剂盒提供的方法 ,采用Ｆ13Ａ0 1、ＦＥＳＦＰＳ、ｖＷＡ三基因座复合扩增技术 ,对哈尔滨 (地区 )汉族人群中 16 3个无关个体的 3个基因座进行基因频率分布调查 ,现报告如下。1　结果与讨论通过对 16 3名无关个体的血样经酚、氯仿萃取法提取ＤＮＡ ,ＰＣＲ扩增 ,用标准等位基因作参照物 ,电泳分离 ,银染检测后 ,进行ＤＮＡ分型和统计学分析。Ｆ13Ａ0 1基因座观察到 4个等位基因 ,9个基因型 ;ＦＥＳＦＰＳ基因座观察到6个等位基因 ,13个基因型 ;ｖＷＡ基因座观察到 8个等位基因 ,2 3个基因型 ;…     

PCR-STR分型技术在尿样DNA分型中的应用

目的　对尿样的DNA分型进行研究。　方法　 10份尿样随机收集于无关个体 ,同时采集血液样本做DNA分型对照 ,用PCR -STR分型技术对尿样DNA进行FIBRA和D18S5 35基因座分型。　结果　 10份尿样 10ml、1ml及 0 .2ml体积均获得准确的分型结果 ,且与同一个体的血样DNA分型结果完全相同 ;室温储存 4天及 4℃保存 4周的尿样均分型成功。　结论PCR -STR分型技术对尿样DNA分型是一种有效的方法 ,在尿样的个人识别中具有极高的实用价值。     

氨基比林血痕预试验处理血痕后样本的DNA定量

目的：探讨氨基比林血痕预试验处理血痕后样本DNA含量的变化及对STR分型检测的影响。方法10名健康无关个体EDTA抗凝血液制成滤纸血痕,氨基比林血痕预试验检测,按试验后血样干燥保存时间分30 min、1 h、3 h、6 h、12 h、24 h共6个实验组,并采用磁珠法、QIAcube DNA纯化法、Chelex-100法三种方法提取样本DNA,应用荧光定量PCR检测样本DNA含量,PCR-STR荧光技术进行STR分型。结果提取方法相同时,氨基比林血痕预试验后血样随干燥保存时间的延长,样本DNA含量呈逐渐降低的趋势。保存时间相同时,不同DNA提取方法间,样本DNA含量差异也有统计学意义。90.56%样本均可获得16个STR基因座明确分型。结论氨基比林血痕预试验对血痕样本DNA有损伤,24 h内多可获有效STR分型。磁珠法提取样本DNA进行STR分型,效果最好。     

全基因组扩增在微量检材DNA分型中的应用

目的探索全基因组扩增技术对微量检材DNA分型的有效性。方法通过显微操作制备含1~20个细胞的模拟微量检材样本,在常规PCR-STR分型前加入全基因组扩增步骤,从等位基因不平衡、等位基因丢失、基因座丢失、伪等位基因(包含stutter峰)等方面探究PEP和MDA两种全基因组扩增方法对微量检材DNA分型的有效性。结果 MDA扩增效率高于PEP,但等位基因丢失和伪等位基因严重;PEP方法的正确分型率高于MDA,但小片段DNA优势扩增现象较严重。结论 MDA方法并不适合目前以STR分型为主导的法庭科学,当微量检材样本的绝对量相当少时,可以考虑使用PEP方法来扩大样本量,以满足重复检验的要求,但可能面临大片段DNA扩增失败的风险。     

Differex~（TM）与Chelex-100法在混合斑检验中的应用比较

目的探讨DifferexTM系统法在法医学性侵犯案件混合斑检验中的应用价值,并与传统Chelex-100法进行比较。方法对日常性侵犯案件中的生物检材分别通过DifferexTM系统法与Chelex-100法检验来比较两种方法的优劣。结果采用Chelex-100法提取时,在所检验样本中仅有床单全部获得单一分型,而采用DifferexTM系统法则只有一条内裤的分型为混合型,其它均为单一分型。应用DifferexTM系统法还可以同时提取女性上皮细胞DNA,成功率为100%。采用Chelex-100法时出现双尖峰的频率也明显超过DifferexTM系统法。结论 DifferexTM系统法在法医学性侵犯案件混合斑检验中比Chelex-100法具有更明显的优势,是一种非常有应用前景的方法。     

牙齿的DNA提取及STR分型研究

目的建立有效的牙齿DNA提取方法。方法使用物理及化学方法去除牙齿表面污染物,经脱钙、裂解、纯化从牙粉中提取DNA进行STR分型。结果对96例牙齿检材进行DNA检验,获得STR分型的有94例,在查找尸源的案件中发挥了重要作用。结论本方法操作简单快速,能够显著提高牙齿DNA检验的成功率。     

Evaluation of ABO and Lewis genotypes using primer extension preamplification

There are some difficulties with blood typing from ABO variant bloodstains and Lewis negative samples using serologic methods. In these samples, DNA analysis should be employed simultaneously to avoid errors in typing. Primer extension preamplification (PEP) produces copies of template DNA. The minimum quantity to examine nucleotide substitutions of ABO and Lewis genotypes by PCR ranged from 1 to 3 ng DNA. The PCR products with or without PEP treatment showed identical ABO and Lewis genotyping results. Performing both serologic and PCR testing served to crosscheck the ABO and Lewis grouping of such specimens. Errors in ABO and Lewis typing can be avoided as discrepancies are investigated further. The application of the PEP method to limited amounts of DNA samples for ABO and Lewis blood groupings is useful.     

The personal identification of many samples recovered from under the sea

An automatic and rapid DNA typing system was employed for personal identification, using fragmentary tissue samples from victims in an airplane accident. Two victims were crushed into small pieces, and 33 samples suspected to belong to them were recovered from under the sea. From each sample, 10 mg was used for testing. The parents' bloods of two presumptive victims were also examined. DNA extraction from samples was performed by the NaI method, and the obtained DNA samples were analyzed with the ABI PRISM system. Among 33 samples, 31 samples were identified to be human tissues, possibly from two victims. The other two samples seemed to be parts of marine animals. ABO blood group, STR polymorphism, and mitochondrial DNA polymorphism typing were possible in every examined human sample. Two victims' fragmentary tissues were identified by determining ABO genotype, STR type and mitochondrial DNA type. The system we employed enabled an accurate typing of many fragmentary samples in a short time, thus contributing to the fast and secure identification of many victims in such cases as big air accidents.     

人体接触检材前处理方式对磁珠法提取DNA效果的影响

目的比较3种常见的接触检材前处理方式对磁珠法提取DNA效果的影响。方法收集烟蒂、牙刷、纱线手套各10份;分别采用95℃、70℃直接裂解和TNE、SDS、PK预消化方式进行前处理,再用磁珠法提取纯化DNA,并进行DNA定量,统计提取的接触DNA量和IPC CT值;同时用Sinofiler复合扩增系统进行STR分型检测。结果 3种方法前处理后用磁珠提取的DNA纯度均较高I,PC CT值在26.63～27.19之间。用预消化法获得的DNA量高于裂解法,而95℃裂解与70℃裂解方法提取的DNA量无显著性差异。STR扩增检测结果亦表明,采用预消化法处理的样品STR分型成功率高于裂解法9,5℃与70℃裂解方法处理的样品STR分型成功率无显著性差异。结论人体接触检材采用预消化磁珠法提取DNA,有助于提高STR检验成功率。     

A new sensitive short pentaplex (ShoP) PCR for typing of degraded DNA

Analysis of short tandem repeat makers has become the most powerful tool for DNA typing in forensic casework analysis. Unfortunately, typing of DNA extracted from telogen shed hairs, bones buried in the soil or from paraffin-embedded, formalin-fixed tissue often reveals no results due to the degradation of DNA. The reduction in size of the target fragments by development of new primers and their combination in multiplex approaches open a new field of DNA analysis. Here we present a new sensitive short pentaplex PCR including the loci amelogenin, TH01, VWA, D3S1358 and D8S1179. Validation tests of our new method included sensitivity, mixtures, human specificity, artificial degradation of DNA by DNase I and case work analysis on a panel of different forensic samples. The detection limit was 12.5 pg of human DNA, and mixtures of 50 pg in a total of 1000 pg were clearly detectable and revealed complete profiles. Only DNA extracts of human primates displayed a few signals, whereas other animal, fungal or bacterial DNA showed no signals. Our method proved extremely valuable in the analysis of artificially degraded DNA and in forensic cases, where only poorly preserved DNA was available. This approach and other similar methods can aid in the analysis of samples where allelic drop out of larger fragments is observed. It is highly recommended to develop more of these multiplexes to improve poor quality DNA typing.     

Recovery of genomic DNA from archived PCR product mixes for subsequent multiplex amplification and typing of additional loci: forensic significance for older unsolved criminal cases

A method for genomic DNA recovery from different types of PCR product mixes suitable for multiplex amplification and typing using the Profiler Plus STR typing system has been investigated. The application of this method is of significance in cases where the original DNA samples have been exhausted due to repeated typing analyses in an effort to maximize their evidentiary value. Such cases typically involve samples analyzed using the available DNA typing systems of the time which gave a markedly lower power of discrimination, either alone or in combination, compared to that of modern multiplex STR typing systems. It was found that an effective method for recovering genomic DNA from HLA-DQA1 +PM and CTT triplex amplification mixes, suitable for reproducible achievement of the complete Profiler Plus profile, involved the use of Amicon Microcon-100 microconcentrators. Interestingly, this method was not required to achieve the complete nine STR profile using D1S80 amplification mixes.