用dHPLC技术检测线粒体DNA编码区单核苷酸多态性

目的研究线粒体DNA(m tDNA)编码区单核苷酸多态性,建立检测m tDNA编码区单核苷酸多态性(SNP)的变性高效液相色谱(dHPLC)方法。方法设计针对线粒体DNA编码区nt10287-10679及nt8507-8805引物,应用dHPLC技术检测其序列多态性。结果100例中国汉族无关个体中,m tDNA nt10287-10679检出13个SNP位点,13种单倍型,基因多样性(H)为70.79%,偶合概率(P)为29.92%;m tDNA nt8507-8805检出10个SNP位点,12种单倍型,H为70.42%,P为30.28%;两段序列联合起来共检出23个SNP位点,23种单倍型,H为84.14%,P为16.70%。结论所建立的dHPLC方法可用于快速、准确地检测m tDNA编码区序列多态性;m tDNA编码区多态性位点作为m tDNA控制区多态性位点的补充,联合应用可以提高m tDNA的个体识别能力。     

湖南平江地区汉族人群(客家人)20个STR基因座的遗传多态性

<正>短串联重复序列(STR)分型检验是当前法医DNA检验的重要技术之一,被广泛应用于法医学个体识别和亲缘关系鉴定~([1])。湖南平江地区东南部是"客姓人"(客家人)的聚居地,本研究对该地区汉族人群(客家人)20个STR基因座进行遗传多态性分析,为法医学研究提供遗传学基础数据。1材料与方法1.1样本及DNA提取598例湖南平江地区汉族人群(客家人)无关个体血样(男性382例,女性216例)均由长沙市第一医     

河北汉族人群线粒体DNA HV3(CA)n重复子长度多态性

线粒体DNA的控制区具有高度多态性和母系遗传等特征被广泛应用于法医学个人识别和母系亲权鉴定。目前法医学主要应用HV1、HV2区(16024~16365nt、73~340nt)序列多态性,在m tDNA 00438~00574nt的HV3区域也具有多态性[1],其中位于00514~00524的(CA)n重复子是一个长度多态性区域,重     

北京地区汉族人群SE33基因座遗传多态性

SE33基因座是短串联重复序列STR基因座,位于人类6号染色体长臂,核心序列为AAAG,片段大小在203~333之间。本文对北京地区汉族人群206例无关个体的血样进行SE33基因座多态性调查,现报道如下。1材料和方法206份北京地区汉族无关个体血样。Chelex-100法提取DNA;PowerPlex SE33基因座扩增试剂盒(Promega,美国)(详见试剂盒说明)、9700基因扩增仪扩增;产物用AB I 3100基因分析仪进行分离和检测;Genescan和Genetyper软件进行结果分析。运用统计学计算通用公式[1]进行统计学分析。2结果和讨论206例无关个体的SE33基因座分型结果见表1。表1…     

用PCR-DGGE技术检测人外周血mtDNA HVⅠ单倍型及异质性

目的建立简单、有效的m tDNA单倍型检测及异质性筛查技术,并获取其相应的汉族人群频率分布。方法用PCR-DGGE技术对200例武汉汉族无关个体外周血m tDNA HVⅠ15997~16174nt和16208~16401nt区域进行分型检测。结果200例汉族无关个体中,15997~16174nt和16208~16401nt区域分别检出20种和22种单倍型,其单倍型多样性(HD值)分别为0.8159和0.8844;m tDNA HVⅠ组合单倍型共90种,其HD值达0.9803。两区域分别有4名和2名个体观察到异质性,其发生率为3%。结论PCR-DGGE是一种简单、灵敏、高效的m tDNA多态性及异质性检测技术,可应用于法医学实践。     

人线粒体DNA序列分析在法医学中的应用研究及其进展

综述人线粒体DNA(m tDNA)序列分析在法医学种属鉴别、个体识别,以及个体年龄推断中的应用研究及其进展,展望对m tDNA异质性的研究及建立人m tDNA数据库,并具有重要的法医学实践意义。     

陕西安康地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性

短串联重复序列(STR)分型检测已被广泛应用于法医学个体识别和亲权鉴定,本文调查511名陕西安康地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性,为法医学研究和实践提供基础数据. 1材料与方法 1.1 样本及DNA提取 511份安康地区汉族无血缘关系个体血样,为本实验室日常工作中积累,其中男性385名,女性126名.采用Chelex法提取模板DNA[1]     

混合血迹中不同个体成份逐一分离识别的研究

目的研究法庭科学混合血迹物证中不同个体成份逐一分离、识别的问题,建立适合混合血迹个体识别的分析技术。方法采用PCR-SSCP及测序技术,选择m tDNA D-loop区的HVI 16030~16481区域452 bp片段作为分析目标,对中国汉族两无关个体、三无关个体混合血迹进行分析。结果100份两个体混合血迹样品m tDNA 452bp的PCR产物经SSCP电泳分离,结果有95份样品完全分离开,分离成功率达95%;30份三个体混合血迹样品452 bp片段经SSCP电泳分离,结果有26份样品有1~3个个体完全分离开,分离成功率达84%。对其中3份两个体混合血样、2份三个体混合血样SSCP电泳分离后的谱带进行回收、测序分析,两个体混合血样每一份均可准确获得其中单一个体序列及以另一个体主要成份(峰值比达4∶1以上)的序列结果;三个体混合血迹中不同个体成份可以达到初步分离,1份可准确确定单一个体序列。对两个体不同比例混合样品SSCP分析,结果可以检测到较少成份的最低比例为20∶80。结论本研究建立的PCR-SSCP及测序分析混合血迹综合技术,是对混合血迹中不同个体成份逐一分离、识别的一种有效技术手段。     

中国5个民族mtDNA(CA)n重复的多态性

目的 探讨中国维族、汉族、黎族、瑶族、藏族mtDNA 514-523位置(CA)n重复遗传多态性。方法应用自行设计的引物对维族、汉族、黎族、瑶族各100名无关个体及42名藏族无关个体进行直接测序。结果 维族人群发现5种等位基因,黎族4种,瑶族3种,而汉族、藏族只观察到两种等位基因。结论 五个民族间mtDNA(CA)_n重复次数存在差异,与国外其他人群相比也有差异。     

江西上饶地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性

短串联重复序列（STR）检测已经广泛应用到法医物证学个体识别及亲权鉴定中,本文对485例江西上饶地区汉族无关人群15个STR基因座进行遗传多态性分析,为法医物证学相关研究工作提供数据。1材料与方法 1.1样本及DNA提取随机收集上饶地区汉族健康无亲缘关系滤纸血痕样本485例,其中男性361例,女性124例。采用常规Chelex-100法提取DNA[1]。     

闽南地区汉族人群12个Y-STR基因座遗传多态性

近年来,Y染色体短串联重复序列作为常用的Y染色体特异性遗传标记在法医学个人识别和亲子鉴定以及人类进化研究中具有独特的作用[1,2]。本文调查了闽南地区汉族人群109名无关男性个体12个Y-STR基因座,现报道如下。1材料与方法1.1样本109份无关男性个体,血样采自调查证实3代以上居住于福建省安溪县与南安市的汉族群体。1.2 DNA提取常规chelex-100快速提取法或盐析法提取基因组DNA。1.3 PCR复合扩增采用PowerPlex Y System试剂盒(美国Promega公司),总反应体系为10μl,其中Gold STR 10×Buffer1μl,PowerPlex Y 10×Primer PairM i…     

天津汉族6个STR基因座的基因频率调查

<正> 采用PowerPlex~(TM)16 System荧光标记复合扩增试剂盒,ABI-310型DNA序列分析仪,对219名天津汉族无关个体血样进行TH01、PENT E、     

新疆汉族人群6个STR基因座的遗传多态性

参照美国Promega公司Geneprint试剂盒提供的方法 ,采用CTTMultiplex和SilverSTRⅢSystem复合扩增试剂盒 ,对新疆地区汉族人群CCT系统 15 1名和STRⅢ系统 14 2名无关个体血样进行CSFIPO、TPOX、THOI、D16S5 39、D7S82 0、D13S317等 6个STR基因座的基因频率调查 ,结果如下 :新疆地区汉族人群 15 1名 (CTT系统 )及 14 2名 (STRⅢ系统 )无关个体的血样经Chelex 10 0快速提取法提取DNA ,PCR扩增 ,用标准等位基因作参照物 ,电泳分离 ,银染检测后 ,进行DNA分型和统计学分析。CSFIPO、TPOX、THOI、D16S5 39、D7S82 0…     

山东沂源县汉族人群18个STR基因座遗传多态性

正本文应用DNA TyperTM15 plus试剂盒(公安部物证鉴定中心)对山东省沂源县1012名汉族无关个体18个STR基因座遗传多态性进行调查,为法医学及相关研究与实践提供遗传学资料。1材料与方法1012名常住沂源县汉族无关个体血样(男性741例,女性271例)均系本实验室日常工作积累。采用DNA TyperTM15 plus试剂盒10μL反应体系免提取直接扩增[1]。扩增产物应用ABI 3500基因分析仪检     

北京地区汉族人群Penta B、E、C基因座遗传多态性

微卫星(STR)基因座常根据串联重复单元的核苷酸数进行分类。其中五核苷酸重复序列(Pentanucleotide)是指串联重复单元为五核苷酸的STR基因座,其结构比四核苷酸重复序列更加稳定[1]。四核苷酸序列基因座是法医DNA分析最常用的基因座,而五核苷酸序列基因座在当前法医学所采用的商品化的试剂盒中仅有Penta E、Penta D(Promega,USA),所以存在很大的研究空间。本文选取Penta B、Penta E和Penta C(基因座信息见表1)三个STR基因座,在北京地区汉族人群中,随机抽取203名无关个体进行多态性调查。表1 Penta B、E、C基因座信息基因座基因…     

哈尔滨地区汉族人群3个基因座的基因频率调查

短串联重复序列(ＳＴＲ)由2～5ｂｐ的核心序列串联重复构成。ＳＴＲ广泛分布于整个基因组中,是人类重要的遗传标记系统,现已被广泛用于法医个体识别和亲权鉴定中。本文作者对哈尔滨地区160名无关个体的Ｄ16Ｓ539、Ｄ7Ｓ820、Ｄ13Ｓ317基因座进行基因频率分布调查,其结果如下1　材料与方法11　材料160名本室检案积累的无关个体血样;Ｐｒｏｍｅｇａ公司的Ｓｉｌｖｅｒｌｌ复合扩增系统试剂盒。12　方法采用酚—氯仿抽提法提取血样ＤＮＡ。ＰＣＲ复合扩增,其基因座[1、2]引物,ＰＣＲ反应在25μｌ[3]体系中进行,25μｌ10×ｂｕｆｆｅｒ(10ｍｍｏ…     

石家庄地区汉族群体9个STR基因座遗传多态性

本文作者对石家庄地区汉族群体9个STR基因座进行基因频率调查,以期为石家庄地区的法医学个体识别,亲权鉴定及群体遗传学研究提供基础数据。1材料与方法河北石家庄地区汉族无关个体血样277份,由实验室办案积累。用Chelex-100法提取血样DNA。按Identifiler(ABI公司,美国)试剂盒说     

中国汉人线粒体DNA(CA)n重复子的多态性

线粒体DNA的控制区具有高度多态性,对个体识别有十分重要作用。mtDNA多态性分析广泛用于法医学、人类学和分子进化学。主要是对高变区HVRI和11直接全部测序来分析D－Loop区差异性。众所周知DNA直接测序费时,成本昂贵,周期长,因此不能广泛用于法庭科学日常检案中。另外也缺乏有效的群体遗传数据门］目前已知mtDNA的控制区如同染色体DNA一样,也存在着重复单位的多态性。（CA）n重复子是其中的一个多态性位《（‘,’］。它定位于D－Loop3’区域。参照Adesons拥有5个（CA）重复序列。定位于＂t00514＂t00524。本文在此报道中…     

天津汉族人群D19S433和D2S1338基因座遗传多态性

采用AB I AmpFlSTR IdentifilerTM荧光标记复合扩增试剂盒,AB I-310型DNA序列分析仪,对200名天津地区汉族无关个体血样D19S433和D2S1338基因座遗传多态性进行调查,现报告如下。1材料与方法200份天津地区汉族无关个体血样系本实验室日常检案积累。采用Chelex-100法提取血样DNA[1];PCR扩增、电泳检测及数据收集均按AB I公司操作手册进行。用AB I-GeneScan、Genotype软件分析DNA分型,并制成COD IS表格,导入DNA数据分析处理系统,进行统计学计算,得到D19S433、D2S1338基因座的等位基因频率和相关统计学数据。2结果与讨论天…     

利用STR分型方法进行同胞关系鉴定

本文运用人类短串联重复序列(shorttandemrepeats,STR)分型方法对1案例进行了同胞血缘关系鉴定,通过这一案例的分析得出了一些数据,供同行们参考。1案情2004年,应委托人王某之要求,对5位已知同胞兄弟姐妹与另一位可疑个体之间是否存在同父同母之同胞关系进行鉴定。2材料和方法2.1DNA抽提取5名同胞兄妹的血样(1,2,3,5,6号)和可疑个体血样(4号),用Chelex-100快速提取法[1]提取DNA。2.2PCR反应用ABI公司荧光标记扩增试剂盒(AmpFlSTRTCofilerPCRAmplificationKit、AmpFlSTRTMProfilerPluPCRAmplificationKit)对DNA进行PCR扩…