脱落细胞类DNA提取方法的研究应用

笔者在DNA检案过程中,运用Chelex法和硅珠纯化法联合提取脱落细胞类生物检材DNA作STR分型,获得了较满意的结果。     

擦拭直扩法和粘取磁珠法检测衣物脱落细胞DNA的比较

<正>法医检案中经常遇到对衣物接触DNA检验的要求,目前多为先用真空吸附或胶带粘取的方法富集衣物上的脱落细胞,然后用Chelex-100法、磁珠法或硅珠法提取DNA进行STR分型检测[1-5]。上述方法操作均较繁琐,且容易污染。本研究用生物检材采集与保存套管的尖头棉签擦拭穿过的衣物上的脱落细胞,然后剪取少量棉签头部,采用直接扩增法及用脱落细胞粘取器粘取后磁珠提取法获得脱落细胞DNA,并     

QIAcube小型工作站在生物接触类检材提取中的应用研究

目的 探讨QIAcube工作站在生物接触类检材中的提取效果。方法 将90份以脱落细胞粘取膜、实物样本(纱线转移)或棉签擦拭物为载体的生物接触类检材,分别采用QIAcube工作站、EZ1工作站和手工硅珠法进行基因组DNA提取、定量并检测15个常染色体基因座的STR分型。结果 利用QIAcube工作站提取的生物接触类检材平均检出率达到44.4%,其中脱落细胞粘取膜组检出率为56.7%,实物纱线转移组检出率为46.7%,棉签擦拭物组检出率为30.0%。脱落细胞粘取膜组和实物样本(纱线转移)组均获得较好的STR分型结果,所得DNA浓度均优于棉签擦拭物组样本。QIAcube工作站组平均检出率为44.4%,手工硅珠法组平均检出率为43.2%,而EZ1工作站组平均检出率为26.9%,前两者平均检出率明显高于EZ1工作站组。QIAcube工作站组与硅珠法组所得DNA浓度无显著差异,但均明显高于EZ1工作站组。QIAcube工作站组与硅珠法组检测得到的STR分型RFU值及峰值均衡性均优于EZ1工作站组,尤其是大片段基因在前两组中均能够被完整检测到。结论 采用QIAcube工作站提取生物接触类检材检出率高,STR分型结果良好,可应用于法医物证实际案件检验。     

触摸检材DNA的STR检验

触摸检材是指附有人体手部脱落细胞的生物检材。刑事案件中此类检材由于与人体接触时间短,所含脱落细胞量少,STR检验的难度相对较大。笔者在实际检案中利用硅珠法处理这类检材取得了较好的效果。     

两种DNA提取法对签字笔上脱落细胞STR分型比较

目的比较Chelex-100法和硅珠法两种DNA提取法,在签字笔上附着微量脱落上皮细胞分型中的应用效果。方法 17名志愿者每人使用14支签字笔,每支笔每天使用20min,为期1个月,平均分为两组,分别保存1、3、5、7、14、21和28d,同时运用Chelex-100法和硅珠法两种方法提取签字笔上遗留微量脱落细胞中的DNA,用Identifiler复合扩增系统在AB I 3100遗传分析仪上对这些DNA样品进行STR分型,同时采集上述17名志愿者口腔拭子作为对照。结果以基因座检出个数为指标,使用后签字笔保存1、3、5、7、14、21和28d后,采用Chelex-100法和硅珠法两种方法提取DNA并进行分型检出的基因座个数相比差异均有统计学意义(P0.01);口腔拭子保存1、3、5、7、14、21和28d后,采用Chelex-100法和硅珠法两种方法提取DNA并进行分型检出的基因座个数相比差异均无统计学意义(P0.05)。结论对于微量检材,应用硅珠法提取的DNA分型效果明显优于Chelex-100法,具有较高的应用价值,而在检材量比较多时区别不明显。     

检材量对硅珠法提取脱落细胞DNA的影响

犯罪嫌疑人遗留在犯罪现场的帽子、口罩、衣服、手套、运动鞋、袜子等含有机体脱落细胞,在实验室逐渐成为常规检材。由于这类检材含有的脱落细胞少,散在分布,给检验带来了一定的困难。本文通过增加取材量和在15mL离心管中消化后用硅珠法纯化DNA,能显著提高检验成功率。1材料与方法1.1检材本实验室日常受理的案件检材54例,其中帽子5例,口罩5例,衣服10例,手套20例,运动鞋10例,袜子4例以及对应的犯罪嫌疑人血样。     

改良EVO150-8方法在DNA自动化检案中的应用

目的探讨改良EVO150-8方法在批量生物检材DNA检验中的应用价值,建立一种自动化、简单、快速的DNA提取方法。方法采用改良EVO150-8自动化核酸提取纯化仪器与DNA IQ磁珠法纯化试剂盒,对各现场提取的880份血迹、烟蒂、口香糖、精斑（混合斑）、组织、骨骼、脱落细胞等常见生物检材进行DNA提取与纯化,采用Identifiler试剂盒进行扩增检验,用3130XL电泳,GeneMapper ID V3.2分析软件进行分析比对。结果在880份生物检材中,有836份检材成功获得STR分型;检验92份检材仅需时128min。结论改良EVO150-8适合批量生物检材的自动化提取。     

三种磁珠法提取脱落细胞DNA的比较

正法医DNA鉴定中的脱落细胞检材是指含有人体皮肤黏膜脱落上皮细胞的检材,是当前刑事案件现场最有可能提取到的生物物证。目前关于脱落细胞提取纯化方法对比的报道~([1-3])较多,但相同提取方法效果横向比较的研究较少。本研究对IQ磁珠、M48磁珠、Prep Filer磁珠三种常见的磁珠法提取脱落细胞DNA的检验效果进行比较,为法庭科学实践提供参考依据,现报道如下。     

自动化高通量提取脱落细胞检材DNA

正脱落细胞是目前法医DNA检验中的重要检材之一,此类物证具有体积小、较为隐蔽、不易察觉、不易毁灭等特点。通过提取脱落细胞中的DNA,可以直接获取犯罪现场人员信息,为案件侦破提供重要技术支持。但在现场检材中通常仅能采集到微量的脱落细胞,且常常带有扩增抑制物,手工进行DNA提取操作复杂,提取效果因人而异,给DNA检验带来了诸多困难。为有效提高脱落细胞的获取量,必然要增加现场采样的数量,这又大大增加了后续DNA提取的工作     

微量口腔脱落细胞检材的DNA检验

目的寻求提高微量口腔脱落细胞检材的DNA检验成功率的简便有效的提取方法。方法对不同载体上的100份微量口腔脱落细胞检材采用小体积Chelex-100法提取DNA,在ABI7500型荧光定量PCR仪上进行定量,同时用IdentifilerTM复合扩增系统扩增,在ABI3130遗传分析仪上进行STR分型。结果从25根饮料吸管上提取的DNA量在0.72～116.7.8ng,16个水杯杯缘提取的DNA量在2.15-142.5ng,31个饮料瓶(罐)口提取的DNA量在1～34.65ng,10根筷子上提取的DNA量在3.35～26.6ng,12个果核中提取的DNA量在0.294～21.4ng,6份吃剩的骨头中提取的DNA量在0.88～5.88ng。100份检材性别及9个以上STR位点分型成功率平均为59.38%。除了使用者的个人原因外,检材的提取送检方式、检材的质地、饮料的性质对提取的DNA量有显著影响,是否加蛋白酶K对提取的DNA量无显著影响。结论采用小体积Chelex-100法可对60%左右的微量口腔脱落细胞检材提取DNA进行STR分型。     

大面积载体上隐性浸润性生物物质DNA的提取

大面积载体上隐性浸润性生物检材主要指毛巾、衣裤等载体上看不见摸不着的人体脱落细胞。对于反复使用的物品,如牙刷、鞋帽、眼镜等,由于人体遗留的脱落上皮细胞较多,使用常规DNA提取方法如Chelex-100法等往往能获得理想的检测结果[1]。     

光滑载体上接触DNA的检验

接触DNA是指通过皮肤接触而遗留在客体表面人体皮肤脱落上皮细胞的DNA[1].通常遗留在光滑载体（如刀柄、手枪等）表面接触DNA较少,检验难度较大.对于这类检材,较常采用硅珠法、磁珠法或Chelex-100法进行DNA提取,但成功率不高.本文尝试采用直接扩增法（简称直扩法）进行检验,收到了很好的效果,报道如下.     

生物检材采集与保存套管的应用

目的探讨生物检材采集与保存套管在法医学中的应用价值。方法在不同温、湿度环境下，观察悬空放置在生物检材采集与保存套管、有孔与外界相通的套管及密闭管内的湿润棉签的干燥时间30次；分别用生物检材采集与保存套管和医用棉签采集纸袋保存口腔细胞、血液、皮肤脱落细胞样本各20例，磁珠法提取DNA并进行DNA定量；用生物检材采集与保存套管采集口腔脱落细胞和血样进行DNA直接扩增。结果在温度4～30℃、相对湿度21％～90％的环境下，湿润棉签在套管内的平均干燥时间为7．89h，有孔管内的为23．30h，密闭管内观察15天仍不干燥，出现霉斑。生物检材用套管采集保存比医用棉签采集纸袋保存方式获得的DNA量显著提高，平均高达0．968倍；用套管采集口腔细胞和血样进行直接扩增，操作简单方便，成功率高。结论生物检材采集与保存套管具有快速干燥、对检材无损耗和浓缩等优点，可提高检材DNA的提取效率，且适合直接扩增。     

微量脱落细胞DNA检验方法的比较分析

结合日常检案,本文从实验室提取方法和检验时限两个方面对盗窃案件脱落细胞类生物学检材的DNA检出率进行了比较分析,提取方法使用Eppendorf epMotion 5075工作站结合DNA IQTM系统（以下简称5075结合磁珠法）和手工硅珠法,检验时限规定为案发至检验时间段.现将分析结果交流如下.     

签字笔上附着的脱落上皮细胞STR分型

目的 探讨遗留在签字笔上微量脱落细胞DNA分型的可行性以及保存时间对分型的影响.方法 17名志愿者每人使用7支签字笔,每支笔每天使用20 min,为期1个月,分别保存1、3、5、7、14、21和28 d,运用硅珠法提取签字笔上微量脱落细胞中的DNA,应用荧光标记PCR-STR技术进行DNA分型,同时采集上述17名志愿者口腔拭子作为对照,分析签字笔作为检材进行DNA分型的可行性以及保存时间对DNA分型的影响. 结果以基因座检出个数为指标,签字笔脱落细胞和口腔拭子的DNA分型结果随保存时间变化而产生的差异具有统计学意义(P＜0.01).签字笔保存1、3、5、7、14、21和28 d后进行DNA分型检出的基因座个数与对应的口腔拭子DNA分型检出的基因座个数相比差异均有统计学意义(P＜0.01).签字笔使用后保存1 d进行DNA分型.可明确判读12个以上基因座的占41.2%. 结论签字笔上附着的微量手指脱落细胞可作为一种法庭生物检材进行DNA分型,但其保存时间会影响DNA分型.     

一种收集衣服上脱落细胞的新方法

目的建立一种生物脱落细胞的微量提取新方法。方法利用一套自制的“生物细胞提取仪”无损提取衣物等载体上的人体脱落细胞,采用Chelex-100法提取DNA,用不同的试剂盒进行STR复合扩增检验。结果10例检材都得到16个基因座成功分型。结论用该方法提取微量细胞DNA,可获得满意的DNA分型。     

激光捕获显微分离技术在DNA检验中的应用研究

目的建立一套显微细胞捕获技术用于法医学生物检材DNA检验方法。方法使用VeritasTM LCM激光捕获仪,采用紫外加红外的捕获方式,对框架覆膜玻片上经苏木素染色口腔上皮细胞进行捕获,采用改良硅珠法提取细胞DNA,使用Identifiler TM试剂盒在5μL体系中进行PCR扩增。结果成功获得20个口腔上皮细胞的13个以上完整STR基因座分型谱带。结论本研究建立的方法适合法医学生物检材制成的染色涂片上细胞的DNA检验。     

改良差异裂解法结合硅珠法提取混合斑精子DNA

目的采用改良差异裂解法结合硅珠法提取混合斑中精子DNA,并评价其应用价值。方法收集52例经常规差异裂解法检验含有女性分型的混合斑检材,采用改良差异裂解法结合硅珠法提取精子细胞DNA,IdentifilerTM试剂盒进行PCR扩增检验。并将常规差异裂解法结果作为对照。结果52例混合斑检材中,采用改良差异裂解法结合硅珠法检出单一男性精子成分有38例,男性分型检出率达到98．08％。结论改良差异裂解法结合硅珠法适合提取混合斑中精子DNA。     

Chelex-100法提取脱落细胞检材DNA的实时定量研究

目的研究脱落细胞检材DNA检验的简便有效的提取方法。方法对76份包括帽子、眼镜、牙刷、剃须刀、梳子、口香糖、羊水在内的7种脱落细胞检材采用Chelex-100法提取DNA,在ABI7500型荧光定量PCR仪上进行定量,同时用Identifiler复合扩增系统扩增,在ABI3130遗传分析仪上进行STR分型。结果从帽子（头套）中获得的脱落细胞DNA平均含量为8.31ng,眼镜擦拭物上获得的脱落细胞DNA平均含量为6.20ng,牙刷上获得的脱落细胞DNA平均含量为49.40ng,剃须刀擦拭物上获得的脱落细胞DNA平均含量为6.92ng、梳子擦拭物上获得的的脱落细胞DNA平均含量为10.68ng,口香糖的脱落细胞DNA平均含量为16.30ng,羊水的脱落细胞DNA平均含量为320ng。以上76份检材性别及10个以上STR位点分型成功率为75.8%。结论从帽子、眼镜、牙刷、剃须刀、梳子、口香糖、羊水等检材提取的脱落细胞可用Chelex-100法提取DNA作STR分型。     

用于DNA提取的磁性纳米技术

众所周知,DNA提取技术是法医DNA检验的第一个步骤,也是最关键的步骤.可以说,能否成功进行DNA检验的前提就是能否从生物检材中获得高质量DNA.尤其对于腐败、变质、污染等各种条件下的现场生物检材,DNA的提取质量将直接关系到DNA检验的成败.就我国DNA提取技术发展现状来讲,主要存在以下两个问题:一是技术发展滞后.现在采用的DNA提取技术仍然停留在Chelex100法、有机提取法、硅珠法等常规方法,存在着提取DNA不纯,效率低、耗时,不能自动化,不能定量,扩增成功率较低等诸多缺点,因此直接影响DNA检验的整体流程和效能的发挥.