96孔过滤板在接触性DNA自动化检验中的应用

目的将96孔过滤板用于自动化工作站,对接触性DNA进行检验。方法收集553份现场提取的附着在烟蒂、饮料瓶、门窗把手、电源网线头、作案工具、手套上的微量接触性生物检材,在96孔过滤板上进行裂解后整体离心,分离载体与裂解液;应用自动化核酸提取纯化仪结合M48磁珠纯化试剂盒提取纯化DNA,采用IdentifilerPlus试剂盒进行扩增,3500XL测序仪电泳分型,ID-X专家系统分析结果。结果在553份检材中,成功获得STR分型的有271份,检验成功率在31.6%~97.3%之间,烟蒂、饮料瓶检材的成功率均在90%以上,提取纯化过程约90min。结论将96孔过滤板用于自动化工作站,可在实现批量接触性DNA的快速、自动化提取的同时,有效提高接触性DNA检出率。     

批量陈旧血样DNA的自动化检验

目的建立批量陈旧血样DNA自动化提取检验的方法。方法采用普通磁珠法和本文建立的磁珠法经TECAN Freedom EVO150—8型自动化工作站分别提取540份陈旧血样模板DNA,采用Sinofiler^TM试剂盒进行荧光标记复合扩增。结果采用普通磁珠法和本文所建DNA提取方法,在540份样本中获得全部基因座STR分型的样本分别为217份和488份,检验成功率分别为40．2％和90．3％。结论本文所建方法可显著提高大批量陈旧血样自动化检验成功率。     

衣物类生物检材DNA检验的研究

目的建立对衣物类生物检材STR检验的有效自动提取纯化方法。方法对100例衣物类生物检材用EZ1DNA Investigator试剂盒、EZ1Advanced XL工作站的Large-Volume程序(大体积法)进行提取纯化,AmpFLSTR~Identifiler~Plus荧光STR复合扩增,3500x L型遗传分析仪分析结果。结果 69份检材中检出了单一DNA分型结果,9份检出了混合基因型,22份未检出基因型。结论该方法对衣物类生物检材DNA提取纯化后进行荧光STR检测,可应用于法庭科学实践。     

Maxwell 16裂解纯化法提取陈旧精子DNA的应用

目的利用Maxwell 16裂解纯化法从保存8年以上陈旧精斑检材中获取精子DNA。方法 8份陈旧精斑检材采用Maxwell 16裂解纯化法提取精子DNA,并采用Powerplex○R21试剂盒进行复合扩增,产物用AB3130型遗传分析仪检测,结果与常规方法进行对比。结果成功获得8份陈旧精斑检材精子STR分型。结论差异裂解配合Maxwell 16裂解在陈旧精斑检材精子DNA检验中效果明显。     

Chelex-100法和QIAcube纯化法在接触性检材检验中的比较

<正>在法医DNA检验中,能否提取到足够浓度与纯度的DNA模板,是决定DNA检验成败的关键之一。本研究分别采用Chelex-100法与QIAamp DNA Investigator试剂盒结合QIAcube核酸自动化提取仪(QIAcube纯化法)提取实际检案中的DNA,同等条件下进行PCR扩增与电泳,比较分析二者的图谱,报道如下。1材料与方法1.1材料65份接触性生物检材来自本实验室日常检案积累,其中瓶口32份,工具手柄18份,绳索衣物类     

现场大量生物检材的自动化提取应用

正随着司法诉讼进程对证据质量要求的不断提高,重特大案件的现场重建直接导致生物检材的送检量大幅度提升,时效要求也越来越高。而现场送检的生物检材种类繁多,以往应用Chelex-100法手工操作耗时长、易污染,手工磁珠法无法批量进行,传统方式已无法适应形势的要求~([1]),寻求高通量的生物检材DNA自动化提取应用已迫在眉睫。本研究通过采用Auto Lys STAR自动化工作站结合微量检材DNA提取试剂盒建立生物检材DNA自动化检验体系,以实     

脱落上皮细胞类生物检材的自动化提取

目的建立一种自动化提取脱落上皮细胞类生物检材DNA的方法。方法附着于不同载体上的脱落上皮细胞类生物检材共278份,应用Eppendorf epMotion 5075LH工作站结合DNA IQTM系统提取模板DNA,并用Identifiler试剂盒进行STR检验。结果在278份被检的生物检材,其中126份检材获得13个基因座以上的STR分型,不同类型的检材其检出率不相同,最高达73.44%,最低为10.89%。结论脱落上皮细胞类检材应用自动化工作站提取DNA模板可在法医日常检案中广泛应用。     

国产磁珠结合自动化工作站批量提取生物检材DNA的应用

目的建立国产磁珠结合自动化工作站批量提取案件中生物检材DNA的方法。方法采用国产磁珠结合Bio-Robert Universal System自动化工作站对案件中常见的生物样本进行DNA提取,检测Identifiler系统16个STR基因座,在ABI3130XL遗传分析仪上进行STR分型。其中210份样品同时在ABI7500型荧光定量PCR仪上进行定量。结果9100份10类生物检材应用国产磁珠结合自动化工作站,大部分可提取到足够的DNA进行STR检验。STR检验成功率最高的为口腔拭子、肌肉,达100%,接触细胞检材的成功率较低,为50.0%。结论国产磁珠结合自动化工作站可用于案件中常见的大部分生物样本的DNA提取。     

磁珠法自动化纯化现场检材DNA方法研究

目的利用TE-MAGS在TECAN工作站上结合磁珠试剂盒,建立自动化工作站批量纯化现场检材DNA的方法,并探讨其在法医物证检案中的应用。方法灵敏度测试:标准品使用0.1ng/μL 9947A,用200μL TES稀释制备DNA总量0.1ng~1ng共10种的标准样品,采用本文方法提取纯化,使用IdentifilerTM试剂盒扩增,用3130XL型测序仪检测,Gene Mapper ID-X分析,分析STR图谱质量;纯化能力测试:在1ng总量的标准样品中加入腐殖酸、血红素,采用本文方法提取纯化、扩增检测,分析STR图谱质量;实际案件应用对比:收集304份现场检材,分别采用本方法和硅珠法进行提取纯化,经扩增检测,统计对比两种提取纯化方法 STR分型成功率。结果灵敏度测试:0.1ng~0.2ng总量标准样品提取的DNA模板,扩增后可检测到部分基因座STR图谱,0.3ng~1ng总量标准样品提取的DNA模板,扩增后可以得到完整的STR图谱;纯化能力测试:对混合有一定浓度的腐殖酸、血红素的标准样品的提取产物检测图谱未见明显抑制;实际案件应用对比测试:304份现场检材工作站磁珠法检出成功率(50%)高于硅珠法(40.8%)。结论本文所建立的方法缓冲范围较大,回收率高,纯化能力强,提取产物STR分型成功率高,适合现场检材批量化DNA检验。     

磁珠直接吸附法对体态检材游离DNA的提取

目的采用磁珠直接吸附法对人体尿液、唾液、血液3种体态生物检材中的游离DNA进行提取检验,为法医物证中游离DNA的研究及检验工作提供参考。方法对3种生物检材采取离心吸取上清液的方法分离游离DNA,然后采用磁珠直接吸附法进行提取纯化,Identifiler-Plus试剂盒进行复合扩增后常规STR检测。结果在3种检材中均检出了游离DNA,其中血液中游离DNA检出率为100%,唾液为90%,尿液为70%。结论人体体态生物检材中存在游离DNA,同时磁珠直接吸附法可高效、快捷的提取生物检材中的游离DNA。     

Validation of a DNA IQ™-based extraction method for TECAN robotic liquid handling workstations for processing casework

A semi-automated DNA extraction process for casework samples based on the Promega DNA IQ™ system was optimized and validated on TECAN Genesis 150/8 and Freedom EVO robotic liquid handling stations configured with fixed tips and a TECAN TE-Shake™ unit. The use of an orbital shaker during the extraction process promoted efficiency with respect to DNA capture, magnetic bead/DNA complex washes and DNA elution. Validation studies determined the reliability and limitations of this shaker-based process. Reproducibility with regards to DNA yields for the tested robotic workstations proved to be excellent and not significantly different than that offered by the manual phenol/chloroform extraction. DNA extraction of animal:human blood mixtures contaminated with soil demonstrated that a human profile was detectable even in the presence of abundant animal blood. For exhibits containing small amounts of biological material, concordance studies confirmed that DNA yields for this shaker-based extraction process are equivalent or greater to those observed with phenol/chloroform extraction as well as our original validated automated magnetic bead percolation-based extraction process. Our data further supports the increasing use of robotics for the processing of casework samples.     

应用自动化工作站提取常见生物样本DNA

目的建立使用自动化工作站提取法医案件生物样本DNA的方法。方法选用Biomek 3000自动化工作站,采用DNA IQTM系统及Chelex法对法医案件中常见生物样本进行DNA提取,荧光定量技术进行定量,PCR扩增16个STR基因座并与手工提取方法比较。结果与手工提取方法进行比较,选用自动化工作站结合使用DNAIQTM系统及Chelex法提取DNA可获得满意的STR检验结果。结论自动化工作站可用于法医案件中常见生物样本的DNA提取。     

Automated processing of forensic casework samples using robotic workstations equipped with nondisposable tips: contamination prevention

An automated process has been developed for the analysis of forensic casework samples using TECAN Genesis RSP 150/8 or Freedom EVO liquid handling workstations equipped exclusively with nondisposable tips. Robot tip cleaning routines have been incorporated strategically within the DNA extraction process as well as at the end of each session. Alternative options were examined for cleaning the tips and different strategies were employed to verify cross-contamination. A 2% sodium hypochlorite wash (1/5th dilution of the 10.8% commercial bleach stock) proved to be the best overall approach for preventing cross-contamination of samples processed using our automated protocol. The bleach wash steps do not adversely impact the short tandem repeat (STR) profiles developed from DNA extracted robotically and allow for major cost savings through the implementation of fixed tips. We have demonstrated that robotic workstations equipped with fixed pipette tips can be used with confidence with properly designed tip washing routines to process casework samples using an adapted magnetic bead extraction protocol.     

胍盐裂解液对自动化提取工作站DNA回收率的影响

目的研究不同稀释度胍盐裂解液对自动化提取工作站DNA回收效率的影响。方法制备不同浓度的DNA样本,并将EQ1000法医DNA提取试剂盒中的胍盐裂解液梯度稀释,在本实验室配置的自动化提取工作站上,运行＂工作站磁珠法＂提取程序,AB-7500型荧光定量PCR仪检测提取前后的样本DNA浓度。选取2～7号梯度组DNA回收效率数据进行统计学检验,比较不同稀释度胍盐裂解液的处理对样品DNA回收效率的影响。结果 90%～60%稀释度胍盐裂解液组样品回收效率在66%左右;50%～20%稀释度组样品DNA回收效率在41%左右;稀释度在50%以下与60%以上组样品回收效率之间差异极显著。结论应用＂工作站磁珠法＂提取生物检材DNA,其DNA回收效率受胍盐裂解液浓度的影响。     

法医物证DNA自动化检验技术体系的研究

目的建立自动化工作站同步提取不同种类涉案法医生物检材DNA的新方法。方法选用TECAN Freedom EVO100．4、75—2型自动化提取、加样工作站,采用磁珠法及Chelex-100法对各类涉案生物检材进行DNA提取、PCR扩增、毛细管电泳检测其STR分型,进行比较测试。在“全国公安机关DNA数据库应用系统”中建立并应用实验室信息管理系统（LIMS）模拟实施规范化DNA检案。结果1552份各类检材,采用工作站-磁珠法提取DNA效果最佳,STR检测成功率为95％,工作站-Chelex法为88％;二者分别与其手工提取法比较,成功率无明显差异。92个样本同期检测,自动化工作站较手工操作DNA检案时间可缩减1．25倍。结论工作站域珠法提取涉案检材DNA,可获得满意的STR分型结果。应用LIMS管控,可有效防控污染,明显提高检案效率及鉴定质量。     

FTA-DNA直接提取法的研究与应用

目的建立一种简约且易于自动化操作的Whatman FTA卡血样DNA提取方法。方法取直径1．2mm FTA卡血样，分别用FTA-DNA直接提取法及FTA常规提取方法提取DNA，AB-Identifiler^TM试剂盒分别进行10山和25山体系检测比较，并筛选批量grA卡血样DNA自动化提取程序。结果200份grA卡血样分别采用2种方法提取DNA模板，25μl体系PCR-STR检测，分型结果均良好。10μl体系检测，FTA-DNA直接提取法优于FTA常规提取方法，图谱RFU值为1000～2000，采用自动化工作站运行该提取程序较手工操作DNA分型图谱均衡性更佳；采用FTA常规提取方法检测，图谱RFU值100～2000，小片段优先扩增现象明显，且有19％的样本出现丢峰现象，采用自动化工作站运行该程序对其结果改善不明显。经工作站运行FTA-DNA直接提取法自动程序及10山体系检测本2万余份FTA卡采集的血样，均获得16个STR基因座DNA分型结果。结论本文建立的FTA-DNA直接提取法适用于FTA卡血样自动化DNA建库。     

3种DNA提取法在污染严重混合斑分型中的应用比较

目的比较Chelex-100法、酚/氯仿法和二氧化硅膜法3种DNA提取法在污染严重混合斑分型中的应用效果。方法从日常案例中收集污染严重的混合斑25份,差异消化法分离精子后同时用Chelex-100法、酚/氯仿法和二氧化硅膜技术3种方法提取DNA,采用PCR-STR技术对D19S253、FGA和CSF1PO 3个基因座进行分型,Gel-Pro软件处理电泳图谱,SPSS软件分析比较不同方法之间的差异。结果采用Chelex-100法提取DNA,25份检材分型结果均未成功;采用酚/氯仿法,25份检材中10份分型成功,3份检材FGA和CSF1PO基因座可分型,4份检材CSF1PO基因座可分型;采二氧化硅膜纯化法,25份检材均成功分型;酚/氯仿法和二氧化硅膜法两种方法比较,结果存在显著性差异(P<0.05)。结论二氧化硅膜纯化技术可以有效去除PCR抑制物,提取的DNA扩增效果明显优于Chelex-100法和酚/氯仿法,具有较高的应用价值。     

利用AutoMate Express~(TM)系统提取陈旧性骨骼DNA

目的建立利用AutoMate Express~(TM)系统提取陈旧性骨骼DNA的方法。方法将骨骼用冷冻研磨机研磨成骨粉,经AutoMate Express~(TM)系统提取后,用Identifiler~Plus、MiniFiler~(TM)试剂盒扩增分型。结果10例保存在不同环境中、死亡时间在10~20年的骨骼样本利用AutoMate Express~(TM)系统3 h内完成DNA提取,有8例获得完整STR分型。结论 AutoMate Express~(TM)系统能快速、高效地提取陈旧性骨骼DNA,可应用于法医实际案件检验。