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目的DNA基因分型软件是DNA检测技术体系不可缺少的一环,为拓展GA118系列遗传分析仪器的应用,须研制一套DNA基因分型专家系统,以满足法庭科学DNA检验鉴定工作的需要。方法基于已掌握的DNA片段定长和基因分型数据处理解决方法及相关核心算法,使用JAVA语言和MYSQL数据库,利用Maven进行项目管理,经对GA118系列、ABI系列数据文件解析和数据分析,研发了专家系统GAMarker。结果该系统实现了样本和数据呈现、样本分析要素质量评估、分析方法管理、分型结果展示和人工核查、电泳数据审查、生成分析报告、系统安全等功能,并可分析8色荧光数据。结论GAMarker可进行软件设定、数据分析与比对、图谱查看与编辑,是一套完整的DNA片段分析流程和直观的数据审核工具,可代替国外产品、有效支撑国产遗传分析仪相关系列型号的数据分析,能满足侦破案件、DNA数据库建设的需要。 相似文献
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正本文应用DNA TyperTM15 plus试剂盒(公安部物证鉴定中心)对山东省沂源县1012名汉族无关个体18个STR基因座遗传多态性进行调查,为法医学及相关研究与实践提供遗传学资料。1材料与方法1012名常住沂源县汉族无关个体血样(男性741例,女性271例)均系本实验室日常工作积累。采用DNA TyperTM15 plus试剂盒10μL反应体系免提取直接扩增[1]。扩增产物应用ABI 3500基因分析仪检 相似文献
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目的比较05式警用转轮手枪弹壳表面接触性DNA检验方法,为实际检验提供参考和借鉴。方法制备40例击发后手枪弹壳的模拟样本,分别用两步转移法提取弹壳表面不同部位检材,采用两种DNA提取法和两种扩增试剂盒对样本进行STR分型检验,比较评价检验结果。结果避开发射药残留区域采用两步转移法提取样本,有助于提高检出率;Chelex-100联合Microcon-100法提取模板DNA的产量最高可达1.18ng,高于Mini M48试剂盒法(0.91ng);MiniFilerTM试剂盒的等位基因检出率(23.61%)高于IdentifilerTM试剂盒(6.41%)。结论采用选择适当区域提取检材,采用Chelex-100联合Microcon-100法提取DNA,经MiniFilerTM试剂盒扩增,进行弹壳接触DNA分型的效果较好。 相似文献
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目的对STR基因座进行遗传学调查时样本量大小和采样方式进行考察分析。方法用DNA Typer~(TM)19试剂盒对血卡样本进行直扩,ABI3730型遗传分析仪电泳检测,Genemapper ID v3.2软件进行等位基因分型,根据公式计算群体遗传学参数。计算样本量在50、100、150、200、250、300、350、400、450、500十个水平上遗传多态性水平,并评估与总体的差异。计算常见的四种采样方法(整群采样、随机采样、系统采样、分层采样)所抽取样本遗传多态性水平,并评估抽样误差。结果 18个STR基因座在河北地区16 058份随机样本共检出317种等位基因,基因频率分布在3.114e-5~0.515。18个STR基因座在河北群体水平上PM为6.04e-14,TDP为0.999 999 999 999 94,CEP为0.999 999 987 514 828。PM值、CEP值在样本量大于200后中值基本稳定。四种抽样方法的抽样误差大小是:整群抽样≥单纯随机抽样≥系统抽样≥分层抽样。结论 DNATyper~(TM)19试剂盒的18个STR基因座在河北地区具有较高的遗传多态性水平。在小范围内进行人群频率调查时,可随机选择200份样本代表当地遗传多态性水平。在相对较大范围或遗传背景复杂的区域,可采用分层抽样的方法降低抽样误差。 相似文献
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目的建立扩增片段小于120bp,包括D10S1248、D2S441和D1S16773个miniSTR基因座的复合扩增系统,并调查其在湖南汉族人群中的遗传多态性。方法采用不同荧光染料标记引物,通过PCR扩增,利用ABI 310遗传分析仪对186份无关个体血样进行3个miniSTR基因座片段长度分析。结果D10S1248、D2S441和D1S1677 miniSTR基因座均获得了清晰的基因分型结果,经对186名无关个体进行分析,分别检出9、7、7个等位基因和21、19、15种基因型,基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡。3个基因座在湖南汉族人群的非父排除率和个体识别力分别为0.465、0.491、0.361和0.886、0.899、0.818。结论建立的3个miniSTR基因座扩增系统在DNA高度降解检材分析中具有较高的应用价值,并且在湖南汉族人群中具有较好的遗传多态性,可应用于个体识别和亲权鉴定。 相似文献
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