DNATyper Y21试剂盒基因座在河南人群中的遗传多态性

本文采用DNA Typer Y21试剂盒对中国河南地区汉族604个健康无关个体进行19个Y-STR基因座和1个常染色体STR基因座遗传多态性进行调查。采用血卡样本进行直扩,用DNA Typer Y21试剂盒进行扩增及检测。结果在20个基因座共检出164个等位基因和601种单倍型,其分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05)。所调查的河南人群20个STR基因座具有较好识别能力,该试剂盒与Yfiler Plus相同基因座遗传学数据比较无显著差异。     

基于重组质粒制备STR分型阳性参照物

目的基于重组质粒制备可用于校准法医STR分型的阳性参照物。方法以常用阳性参照物9948人类基因组DNA STR分型为依据,基于重组质粒构建包含CSF1PO、D7S820、TH01等40个常染色体位点,DYS391、DYS522、DYS385a/b等22个Y染色体位点以及性别判定基因座Amelogenin的STR分型阳性参照物。将重组质粒定量、稀释后等比例混合,分别应用于DNATyper~?19、DNATyper~?24、DNATyper~?Y、Amp F?STR~?Identifiler~?Plus以及Power Plex~?18D System五种扩增试剂盒。结果阳性参照物中各重组质粒浓度为0.01pg/μL~0.001pg/μL;应用于Amp F?STR~?Identifiler~?Plus PCR扩增试剂盒,基于重组质粒制备的阳性参照物与人类基因组DNA扩增检测结果差异较小;将此阳性参照物分别应用于不同公司、不同STR基因座的四种STR扩增试剂盒,电泳检测图谱显示各基因座基因型完整,分型正确,峰高相当,基因座间均衡性良好。结论基于重组质粒制备STR分型阳性参照物,是一种可以替代细胞系制备阳性参照物的方法,具有一定的参考价值。基于此方法制备的阳性参照物可适用于市面上常用的STR检验试剂盒,普适性较强,对法医DNA分型检测有一定的实用价值。     

STR遗传多态性调查中样本量和采样方式选择初探

目的对STR基因座进行遗传学调查时样本量大小和采样方式进行考察分析。方法用DNA Typer~(TM)19试剂盒对血卡样本进行直扩,ABI3730型遗传分析仪电泳检测,Genemapper ID v3.2软件进行等位基因分型,根据公式计算群体遗传学参数。计算样本量在50、100、150、200、250、300、350、400、450、500十个水平上遗传多态性水平,并评估与总体的差异。计算常见的四种采样方法(整群采样、随机采样、系统采样、分层采样)所抽取样本遗传多态性水平,并评估抽样误差。结果 18个STR基因座在河北地区16 058份随机样本共检出317种等位基因,基因频率分布在3.114e-5~0.515。18个STR基因座在河北群体水平上PM为6.04e-14,TDP为0.999 999 999 999 94,CEP为0.999 999 987 514 828。PM值、CEP值在样本量大于200后中值基本稳定。四种抽样方法的抽样误差大小是:整群抽样≥单纯随机抽样≥系统抽样≥分层抽样。结论 DNATyper~(TM)19试剂盒的18个STR基因座在河北地区具有较高的遗传多态性水平。在小范围内进行人群频率调查时,可随机选择200份样本代表当地遗传多态性水平。在相对较大范围或遗传背景复杂的区域,可采用分层抽样的方法降低抽样误差。     

现代足迹检验技术实验室的建设实践与发展

足迹是案件现场出现率最高的痕迹物证,是现场勘查中发现其他物证的关键“导航仪”,在案件侦破中发挥着重要的作用。新形势下,足迹检验技术专业受限于人才培养不足、体系建设粗疏、理论研究滞后等问题,未能紧跟时代步伐,对侦查、诉讼的支撑明显弱化。2018年,公安部物证鉴定中心与重庆市公安局刑侦总队决定共建“现代足迹检验技术实验室”,希望起到以点带面的作用,实现足迹检验技术的继承创新、跨越发展。本文主要介绍实验室的规划、组织架构、战法流程和运行机制,并对利用新兴技术推动足迹检验技术发展进行展望。     

DNATyper^TM21试剂盒的法医学验证

目的测试DNATyper^TM21试剂盒的技术性能指标,评估其法医学应用价值。方法从灵敏度、种属特异性、准确性、耐受性、适应性、一致性、均衡性、混合样本、稳定性等九个方面对该试剂盒进行测试。结果DNATyper^TM21具有良好的种属特异性、准确性、适应性、均衡性和稳定性,试剂盒的灵敏度达到0.125ng,能检测案件中常见的不同类型的检材,对降解检材及抑制剂具有一定的耐受性,能检测4:1比例的混合DNA样本并得到正确分型。结论DNATyper^TM21试剂盒的性能指标达到了STR检测试剂盒的技术水平,可用于个体识别、亲权鉴定及法医遗传学分析。     

9色荧光STR复合扩增体系的构建及验证

构建一套包含39个常染色体基因座及Amelogenin性别基因的9色荧光STR复合扩增体系，并验证其在微量与降解检材中的应用效果。根据中国人群核心基因座推荐标准及实际办案需要，筛选出合适的候选基因座，设计引物并以9种荧光染料对其进行标记，构建复合扩增体系并优化；对该体系进行灵敏度、种属特异性、稳定性等确证实验，并通过检验案件样本做进一步评估。结果表明：一套包含39个常染色体STR基因座及Amelogenin性别基因座（其中28个基因座<300 bp）的9色荧光复合扩增体系构建成功。各基因座均衡性良好，灵敏度达0.125 ng，对常见PCR抑制剂具备一定的耐受能力。两性混合样本最低检测比例为1∶4；适用于不同类型案件样本检测，且与市场上其他同类试剂盒比对分型结果一致，种属特异性较好。所构建体系首次采用9色荧光标记技术制成复合扩增试剂，一次性检出基因座数量多，系统效能高；该体系构成以miniSTR为主，对于微量降解检材具有较高的实际应用价值。     

26个Y-STR基因座遗传多态性及突变调查

目的调查26个Y-STR基因座的突变率和遗传多态性,研究其法医学应用效能。方法本文以575对蒙古族父子对为模板,统计26个Y-STR基因座的突变率,并且研究26个Y-STR基因座在黑龙江省蒙古族、江西省汉族及福州市汉族等3个地区777个无关男性个体中的遗传多态性,评估该试剂盒的法医学应用价值。结果26个Y-STR基因座在575个蒙古族父子对中观察到52次突变,在46个父子对中观察到突变现象,平均突变速率为1.93×10^-3。遗传多态性研究中,黑龙江236名蒙古族检出235种分型,单倍型多样性为0.999964;323名福建汉族检测出320种分型,单倍型多样性为0.999942;218名江西汉族检测出217种分型,单倍型多样性为0.999958。结论快速突变基因座可以帮助增加系统的识别能力,但在Y-STR数据库家系查询应注意突变的影响。系统中所选择分析的基因座对该系统在法医学应用中的分辨能力至关重要,实验结果表明该体系在案件检验及数据库建设中具有良好的应用价值。     

10个Y-STR基因座复合扩增体系建立及应用

目的建立DYF404S1a/b、DYF399S1 a/b/c、DYF403S1 a1-3/b、DYS576、DYS570、DYS627、DYS588、DYS447、DYS446、DYS449共10个Y-STR基因座的四色荧光复合扩增体系,调查河南汉族群体中的遗传多态性,评价其法医学应用价值。方法采集500名河南汉族男性个体血液样本,用6-FAM、HEX和TAMRA荧光染料分组标记10个Y-STR基因座,PCR扩增产物采用ABI3130XL遗传分析仪进行分离,Gene Mapper ID v3.2软件分型。结果采用本文方法,检测的最低基因组DNA量为0.05ng;群体调查在上述10个Y-STR基因座分别检测出8~28个等位基因,GD值在0.472 0~0.999 0范围之间,DP值在0.471 1~0.997 0之间。10个基因座所组成的单体型共观察到497种,其中仅出现1次的单体型有494种,HD值达到0.999 908 75,DC值为0.994 0。结论建立的10个Y-STR基因座荧光复合扩增体系灵敏度较高,在河南汉族群体中具有较高的遗传多态性,可以在相关研究和应用中选择使用。     

新疆和田地区维吾尔族人群18个STR基因座遗传多态性

本文使用DNATyperTM15 Plus试剂盒,对中国新疆和田地区维吾尔族300个健康无关个体进行18个常染色体STR基因座遗传多态性调查。结果 18个基因座共检出206个等位基因,其分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05)。基因频率分布在0.002~0.343之间,H值在0.68~0.91之间,DP值在0.812~0.986之间,PIC值在0.59~0.92之间。该系统在所调查的人群中具有较好识别能力。     

四川泸州汉族人群21个Y-STR基因座遗传多态性

本文对中国四川泸州地区汉族457个健康无关男性个体进行21个Y-STR基因座遗传多态性调查。采用血卡作模板,用DNATyper Y21试剂盒进行扩增及检测。结果在21个STR基因座共检出288个等位基因和455种基因型,其分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05)。21个Y-STR基因座对所调查的四川泸州汉族人群具有较好识别能力。