人肺癌中TNF-α基因多态性分布的意义及其对细胞凋亡的影响

目的:观察TNF-α基因启动子区-308位核苷酸多态性基因型在肺癌和对照人群中的分布,以及这种多态性对该基因表达和细胞凋亡的影响。方法:PER-RFLP分析112例肺癌和99例正常人的TNF-α基因启动子区-308位核苷酸多态性,TNF-α-308*G等位基因记做TNF-α1,TNF-α-308*A等位基因记做TNF- α2。免疫组织化学方法检测肺癌组织中TNF-α的表达,比较不同基因型肺癌病例的标本之间TNF-α基因表达的差异性。TUNEL法检测肺癌组织中细胞凋亡,并对比分析TNF-α-308位核苷酸多态性及其对肺癌组织中TNF -α表达和不同类型细胞凋亡的影响。结果:肺癌组与对照组的基因型分布为TNF-α1/1(52．7％、46．5％)。 TNF-α1/2(35．7％、48．5％),TNF-α2／2(11．6％、5．1％);等位基因频率为TNF-α1(70．5％、70．7％),TNF- α2(29．5％、29．3％),组间没有显著性差异,P>0．05。两种基因型个体在TNF-α基因表达上,TNF-α2/2基因型个体高于TNF-α1／1基因型的个体,两者差异显著,P<0．01。TNF-α表达的高低与癌细胞凋亡有比较明确的关系,TNF-α表达高的病例,肺癌细胞凋亡也多,与表达低的病例之间有明显差异,P<0．01。TNF-α表达的高低与间质细胞凋亡之间没有明确的关系。间质细胞平均凋亡指数在高、低分化的肺癌中分别为3．4±0．4和 3．1±0．5,组间没有显著性差异,P>0．015;癌细胞的平均凋亡指数在高、低分化的肺癌中分别为2．4±0．3和 1．7±0．4,两组间有显著性差异,P<0．05,,结论:TNF-α-308位核苷酸的多态性基因型在肺癌和正常人中的分布之间没有明显差别,这种多态性可能不是肺癌易感的遗传因素。但这种多态性与该基因的表达有关。TNF-α高表达肺癌细胞凋亡较多,间质细胞凋亡与TNF-α表达的高低变化之间没有明确的关系。在高分化的肺癌中, TNF-α表达较高,癌细胞凋亡也多,TNF-α-308位核苷酸的多态性可能与了肺癌的分化有关。     

线粒体 DNA突变与心肌病关系的研究进展

人类某些疾病与线粒体DNA(mtDNA)基因组缺陷有关.本文就mtDNA突变与缺血性心肌病和肥厚型心肌病关系的研究加以回顾.目前的研究大多认为心肌缺血缺氧致氧化磷酸化紊乱,产生氧自由基损伤mtDNA,以及缺氧致氧化磷酸化过度诱导而损伤mtDNA,慢性损伤积累终致mtDNA片断缺失或点突变,主要表现出mtDNA5.0kb、7.4kb缺失及细胞色素b(cytb)基因上C15452A点突变;tRNA基因保守序列突变,致肌肉收缩蛋白合成缺陷,缺陷的收缩蛋白持续而无效的收缩可能会增加心肌对ATP的代谢需求,因此导致心肌肥厚.     

Two examples of null alleles at the D19S433 locus due to the same 4 bp deletion in the presumptive primer binding site of the AmpFlSTR Identifiler kit

Two cases of allelic loss at the D19S433 locus after multiplex PCR with the AmpFlSTR Identifiler kit (Applied Biosystems) are described. In both cases the failure of PCR resulted in genetic inconsistencies due to opposite homozygosity. After singleplex PCR with published primers additional alleles were observed and Mendelian inheritance was restored. These PCR products were sequenced and in both cases the same 4 bp deletion near the 3′ end of the repeat region was detected in two alleles of different length. The frequency of these null alleles (two events in 1026 allelic transfers) amounts to 0.0019 (95% confidence limits: 0.0002-0.0070).     

STRtyper-10G系统9个STR基因座突变分析

目的观察和分析STRtyper-10G系统9个STR基因座的突变特点。方法在7 707例肯定亲子关系的案件中,统计使用STRtyper-10G试剂盒（9个STR基因座）检测发现的突变事件,判断突变等位基因的来源,计算各基因座的突变率,分析突变特点。结果在9个基因座上共发现118个突变事件,均为1步突变;平均突变率为1.69×10-3（95%CI 1.40×10-3~2.03×10-3）,各基因座的突变率介于0.78×10-3~2.84×10-3,父、母来源突变比例为9.64∶1;短、中、长等位基因的突变比值约为1∶8∶3,增加和减少重复单位的突变比值为1.29∶1。结论 9个基因座的突变率存在显著差异,实际检案时应结合各基因座的突变率进行PI值计算更为科学。     

39个STR基因座在二联体亲子鉴定突变案例中的应用

目的探讨39个常染色体STR基因座在二联体亲子鉴定突变案例中的应用价值。方法提取全血基因组,采用AGCU Expressmarker 22荧光检测试剂盒进行二联体亲子鉴定,若出现1~2个矛盾基因座,则加做AGCU 21+1 STR荧光检测试剂盒,计算累计父权指数(CPI)值,根据亲子鉴定判断标准判定结果。结果共检测502例二联体亲子鉴定案例,其中排除亲权关系17例,485例不排除亲权关系,10例出现单基因座不符合。加做AGCU 21+1后除1例出现一个新的STR基因座不符合,其他均符合遗传规律,且CPI≥10 000。结论 39个STR基因座的联合应用能够有效解决二联体亲子鉴定中的大部分突变案例。     

TGF-β1在SCN5A基因变异所致心源性猝死中调控作用

SCN5A基因变异所致心源性猝死发生机制尚不清楚。目前研究显示TGF-β1介导心肌纤维化以及离子通道重构调节机制的异常可能是SCN5A基因变异导致SUNDS发生的主要原因。本文就转化生长因子β1对SCN5A基因变异所致心源性猝死调控的影响机制研究进展进行综述,以期为心源性猝死法医学研究和实践提供参考。     

全外显子组测序对肥厚型心肌病猝死者的基因分析

目的在全外显子组水平分析1例肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)猝死病例的相关致病性基因突变。方法对1例具有HCM病理学特征的猝死病例样本,利用Illumina~Hi Seq 2500平台进行全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)。测序数据分析以hg19为参照序列,筛选可疑的单核苷酸变异位点,通过PhyloP、PolyPhen-2、SIFT等软件进行突变的保守性和功能分析。结果经过筛选,发现该病例的MYBPC3基因发生C719R杂合突变。结论利用二代测序技术进行全外显子组水平的分子解剖(基因突变检测和分析),有助于明确HCM的分子机制,并为死因分析提供新的方法和思路。     

采用Identifiler系统判定消化系统肿瘤组织身源准则探讨

目的 探讨采用Identifiler系统进行消化系统肿瘤组织身源判定时共有等位基因数(IAn)和全相同基因座数(A2)的标准.方法 在对l05对消化系统肿瘤组织-身源正常组织对进行Identifiler系统分型的基础上,依据IAn和A2的有限分布原则,将IAn的16种取值代入已建立的相应判别函数,通过Fisher判别准...     

30个中低突变Y-STR基因座复合扩增体系的建立

目的建立30个中低突变Y-STR基因座的复合扩增体系,并对其性能进行评估。方法采用六色荧光标记技术,选择30个中低突变率、中高多态性的Y-STR基因座自行设计引物,进行复合扩增和毛细管电泳检测。检测该体系的准确性、特异性、灵敏度和耐受性,并观察其在混合检材的分型情况。结果采用本体系,分型结果准确稳定、特异性好、耐受性强,灵敏度达0.0625ng,混合检材在1:4的比例下,可获准确分型。结论本研究建立的30个Y-STR基因座的复合扩增体系分型结果良好,对于中国人群的法医Y-STR数据库建设和群体遗传学研究具有重要意义。     

常染色体STR突变基因座父权指数计算

目的概括归纳常染色体STR突变基因座的父权指数计算方法,以在实际检案中应用推广。方法根据目前对常染色体STR基因座突变的认识,用经验递减模型从基因座突变率计算等位基因突变率,分别推导在标准三联体和二联体亲子鉴定中STR突变基因座的父权指数计算式,并举例进行演算。结果总结了在标准三联体鉴定中,只允许假设父突变和既允许假设父也允许母发生突变时,以及二联体鉴定时X和Y的计算式。结论STR基因座发生突变时计算得的父权指数明显低于未发生突变时,提示要检测更多的遗传标记才能使累积父权指数达到认定亲权关系的标准。