安徽地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性

应用荧光标记引物复合扩增技术,对安徽地区263名汉族无关个体的D3S1358、TH01、D21S11、D18S51、Penta E、D5S818、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、Penta D、vWA、D8S1179、TPOX、FGA等15个STR基因座的多态性调查,现报道如下。1材料与方法1.1样本及DNA提取263例汉族无关个体血样由本实验室日常检案积累,采用常规Chelex法提取样本DNA[1]。1.2复合扩增及分型按PowerPlexTM(Promega公司)16 System试剂盒说明书进行复合扩增及分型。PCR反应总体系10μl,其中Buffer 1μl,primer 1μl,Taq Gold酶0.3μl,DNA模板适量,…     

PowerPlex~(TM) 16体系在中国人群中罕见等位基因及其类型

目的 分析PowerPlexTM 16体系基因座在中国人群中的罕见等位基因及其类型。方法 应用PCR-STR和DNA序列分析技术,对4650个无关个体在15个STR基因座中的罕见等位基因进行检测。结果 在PowerPlexTM16体系中的D7S820、D16S539、Penta E基因座,检测到2种类型的罕见等位基因,而TH01、D21S11、D5S818、D13S317、Penta D、D8S1179、TPOX、FGA基因座检测出1种类型。其等位基因频率均较低(0.215‰-7.097‰)。结论 超出ladder范围的罕见等位基因序列比相邻等位基因增加(或减少)1个或数个重复单位,因碱基的插入或缺失的罕见等位基因出现在两等位基因之间。     

北京地区汉族人群Penta B、E、C基因座遗传多态性

微卫星(STR)基因座常根据串联重复单元的核苷酸数进行分类。其中五核苷酸重复序列(Pentanucleotide)是指串联重复单元为五核苷酸的STR基因座,其结构比四核苷酸重复序列更加稳定[1]。四核苷酸序列基因座是法医DNA分析最常用的基因座,而五核苷酸序列基因座在当前法医学所采用的商品化的试剂盒中仅有Penta E、Penta D(Promega,USA),所以存在很大的研究空间。本文选取Penta B、Penta E和Penta C(基因座信息见表1)三个STR基因座,在北京地区汉族人群中,随机抽取203名无关个体进行多态性调查。表1 Penta B、E、C基因座信息基因座基因…     

湖南汉族人群21个STR基因座的遗传多态性(英文)

目的调查湖南地区汉族人群21个STR基因座(D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、Penta E、D2S441、TPOX、TH01、D2S1338、CSF1PO、Penta D、D10S1248、D19S433、v WA、D21S11、D18S51、D6S1043、D8S1179、D5S818、D12S391和FGA)的遗传多态性。方法共采集560例湖南汉族健康无关个体血液样本,使用Chelex-100法提取DNA,应用AGCU EX22试剂盒及9700 PCR扩增仪进行复合扩增,扩增产物使用310遗传分析仪进行分离分析。结果共发现248个等位基因,等位基因频率分布在0.001~0.518。除Penta E(P=0.023)外,其余基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡。21个基因座的累积个人识别率、累积非父排除率、累积匹配率分别为0.999 999 999 999 999 999 999 999 8、0.999 999 998和1.36×10-25。结论 21个STR基因座在湖南汉族人群中呈高度多态性。本研究可为法医学个人识别及亲子鉴定提供有价值的数据及理论基础。     

怒族STR基因频率分布及在法医学中的应用研究

<正> STR是由2～7bp重复单位构成的微卫星DNA,其多态片段长度范围大多在100～500bp之间。STR基因座具有扩增效率高和判型准确,并且适用于微量甚至降解生物检材的DNA分型技术等优点,被广泛应用于法医学领域。 本文作者用基因扫描技术对我国云南怒族人群84名无关个体和10个家系进行TH01、TPOX、CSF1PO、D5S818、D13S317、D7S820、D3S1358、VWA、FGA等9个STR基因座基因频率分布调查及STR分型方法标准化的探讨,从群体水平上阐明该民族STR遗传结构及其变化规律。     

一种新型6色荧光25个STR基因座复合扩增体系研究（英文）

To develop and validate a novel 6-dye STR(short tandem repeat) 25-plex DNA typing system for forensic DNA profiling and databases. In this study, a novel STR 25-plex DNA typing system that includes 24 autosomal STRs(D1 S1656, D2 S1338, D2 S441, D3 S1358, D5 S818, D6 S1043, D7 S820, D8 S1179, D10 S1248, D12 S391, D13 S317, D16 S539, D18 S51, D19 S433, D21 S11, D22 S1045, CSF1 PO, FGA, Penta D, Penta E, TH01, TPOX, v WA, D11 S4463) and Amelogenin was developed. Validation studies demonstrated the sensitivity, accuracy, and reproducibility of our novel STR 25-plex DNA typing system. The sensitivity of the STR 25-plex DNA typing system was demonstrated by the ability to obtain complete profiles from as little as 0.125 ng of human DNA. Specificity testing was demonstrated by the lack of cross-reactivity to a variety of commonly encountered animal species and microbial pool. For stability testing, full profiles were obtained with humic acid concentration ≤60 ng/μL and hematin ≤600μM. For forensic evaluation, the selected 24 autosomal STRs followed the Hardy–Weinberg equilibrium. Since 24 autosomal STRs were independent from one another, PM(Probability matching) was 3.5434×10~(-28), TDP(Total Probability of Discrimination Power) was 0.999 999 999 999 999 999 9999999 69863, and CEP(Cumulative probability of exclusion) was 0.999 99999 375. The new STR 25-plex typing system is sensitive, reproducible, and stable, therefore it is highly applicable for use in national DNA database and can help to facilitate international data sharing.     

中国汉族人群15个STR基因座的等位基因频率调查

目的 调查10071名中国汉族无关个体15个STR基因座的等位基因的类型及其频率，并与以往相关文献报道的汉族群体资料进行统计比较。方法 应用PowerPlex~(TM)16荧光标记复合扩增系统，对10071份中国汉族无关个体的血样DNA进行15个STR基因座的复合扩增；用ABI 377或3100遗传分析仪对扩增产物进行分型，统计15个STR基因座的基因频率。结果 15个STR基因座共发现226个等位基因，频率在0.0001～0.5512；除D8S1179基因座外，其它基因座均发现稀有等位基因，数目1～7个不等，共34个。在中国汉族人群，稀有D21S11基因座的等位基因32.1和36.2，D18S51基因座的等位基因15.2和17.2，Penta E基因座的等位基因15.2、17.4、18.4、19.4、26和27，D7S820基因座的等位基因9.2、10.1、11.1和15，Penta D基因座的等位基因18、19和20，TPOX基因座的等位基因14，FGA基因座的等位基因13，以及较常见但欧洲稀有的D21S11基因座的等位基因30.3和D7S820基因座的等位基因9.1和9.2等均为首次报道。结论 大样本基因频率调查有利于观察STR基因座的稀有等位基因；本研究结果与以往相关文献报道的结果有不同程度的差异。     

福尔马林固定组织SNP与STR检测的比较

目的检测经长期福尔马林固定的组织降解情况,并比较组织中SNP与STR的检出率。方法本文对24例经福尔马林固定、-20℃保存5年的组织样本,采用Quantifiler?Trio DNA定量试剂盒检测样本DNA的降解系数及浓度,运用55-SNPs SNa Pshot复合分型体系和Power Plex?21试剂盒分别进行SNP与STR检测。结果大部分样本降解系数在1~8,发生不同程度的降解。与未降解样本相比,SNP分型完全一致,检出率为100%;其中8例样本STR分型存在33个等位基因丢失,降解系数均大于2.6,且75.8%的等位基因片段长度大于300bp。当样本检测出16个STR基因座时,似然率与54个SNP相当。当样本检出大于17个STR时,似然率大于54个SNP。STR基因座片段长度与等位基因检出率之间呈负相关。除2例样本降解系数较小却发生等位基因丢失外,其余样本降解系数与等位基因检出率之间呈负相关。结论经福尔马林长期固定的组织DNA易降解,检测SNP明显优于STR,但需要更多的SNP以提高个体识别能力。     

中国“罪犯DNA数据库”STR基因座研究

选择合适的 STR基因座 ,建立中国“罪犯 DNA数据库”模式库。以 2 2 11名汉族、15 0名维吾尔族、10 4名回族群体为分析对象 ,提取罪犯血样 DNA,用复合 PCR和四色荧光技术检测了 D3S135 8、v WA、FGA、D8S1179、D2 1S11、D18S5 1、D5 S818、D13S317、D16 S5 39、TH0 1、TPOX、CSF1PO、D7S82 0等 13个 STR基因座及性别 Amelogenin基因座。在 13个 STR基因座中 ,除 TH0 1、TPOX基因座外 ,其余各基因座的个体鉴别能力 (DP)值均接近 0 .9,杂合度(H)均大于 0 .7,排除概率 (PE)大都在 0 .5以上 ,其中 FGA、D8S1179、D2 1S11和 D18S5 1基因座 DP≥ 0 .95 ,H≥ 0 .85 ,PE≥ 0 .6 5 ,表明它们在法医学上极有应用价值。TH0 1和 TPOX在多态性方面较差 (H分别为 0 .6 430和 0 .6 2 96 ,PE分别为0 .40 46和 0 .370 1) ,但也符合应用于法医学的要求。13个基因座的平均偶合率为 5× 10 - 1 5 ～ 1.2× l0 - 1 4 ,适合作为中国人群的遗传学标志 ,用于建立中国“罪犯 DNA数据库”     

中国布里亚特蒙古族人群15个STR基因座的遗传多态性

应用PowerPlexTM16系统 (Promega)荧光标记复合扩增试剂盒 ,调查 15个STR基因座在中国布里亚特蒙古族人群中的基因频率分布 ,现报道如下。1　材料与方法布里亚特蒙古族人群无关个体血样 10 2份 (内蒙古包头医学院提供 ) ,按DNAIQTM试剂盒说明书的方法提取DNA ,提取DNA浓度为 1μg/ μl。用Power PlexTM16系统荧光标记试剂盒 (Promega) ,按说明书方法扩增D3S135 8、TH0 1、D2 1S11、D18S5 1、PentaE、D5S818、D13S317、D7S82 0、D16S5 39、CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、FGA共 15个STR基因座 ,310 0型全自…     

不同前处理方法提取牙齿DNA的比较

目的对三种不同前处理方法提取的牙齿DNA浓度进行比较,建立一种操作简便、经济适用、浓度较高的牙齿DNA提取的前处理方法。方法选择源自7具尸体的共21颗磨牙,每具尸体的3颗磨牙随机按牙屑法、球磨法、液氮研磨法进行前处理,并分别称取50 mg,采用Auto Mate Express~(TM)法医DNA提取系统提取DNA,对三种方法提取的DNA浓度和STR分型结果进行比较。结果牙屑法、球磨法和液氮研磨法提取的DNA质量浓度分别为0.055 6~1.989 1、0.036 6~1.175 6和0.037 8~1.249 0 ng/μL,牙屑法提取的DNA质量浓度较高(P0.05),且STR分型成功率高。结论牙屑法结合Auto Mate Express~(TM)法医DNA提取系统是提取牙齿DNA的一种切实可行的方法,可应用于法医学鉴定实践中。     

不同高度钝力打击致大鼠皮肤与骨骼肌挫伤的对比

目的探讨不同高度钝力打击下,皮肤与骨骼肌挫伤后的修复过程差异。方法采用自主设计的自由落体打击装置,以打击高度为主要损伤程度考量因素,将自由落体从15、30、50 cm高度打击造成SD大鼠下肢三种不同程度的挫伤。采用组织形态学方法观察损伤后6 h、24 h、3 d、7 d、13 d皮肤及肌肉的修复过程。结果三个打击高度引起实验大鼠下肢挫伤,基本都可形成皮下组织和(或)肌肉内的出血,在伤后24h内修复的过程基本类似,但表现程度随打击高度增加而明显;15 cm挫伤组在3 d时出血区红细胞已基本融解消散,而30 cm挫伤组则延迟至7 d;伤后13 d时,15 cm和30 cm挫伤组表现基本类似,但50 cm挫伤组则仍处于增生旺盛期。结论随着打击高度的增加,皮肤及肌肉同时出血的比例明显增加,挫伤后组织修复的炎症反应、增生反应表现逐渐加重,修复的过程也出现相应的延长。综合法医学实践应用以及本研究结果,推荐以50 cm高度所致挫伤(2.58 J/cm~2)作为今后挫伤损伤时间研究的实验动物参考模型。     

头发中氯硝西泮的分段分析在药物辅助犯罪案件中的作用

目的通过分段分析头发中的氯硝西泮,对药物辅助犯罪案件中受害人的摄药频度及摄药史进行推断。方法采用液氮冷冻研磨技术联合超声浴技术,以液相色谱-串联质谱法,对6名不同案件中受害人的头发分段分析,并测定各头发段中的氯硝西泮及7-氨基氯硝西泮的含量。结果 6名受害人的部分头发段中均检出氯硝西泮及其代谢物7-氨基氯硝西泮,且头发中药物峰值浓度的出现时间与受害人自述摄药时间相一致。结论头发分段分析可提供摄药频度与摄药时间信息,在药物辅助犯罪案件中具有独特的证据价值。     

Allele frequencies of 13 short tandem repeat (STR) loci in the Romanian population

A population study on 13 tetra- and pentameric STR loci (D3S1358, VWA, D8S1179, D21S11, D18S51, D16S539, D2S1338, D19S433, THO1, FGA, ACTBP2 (SE33), Penta D and Penta E) was performed with Romanians from the Bucharest area.     

血液中乙醇检验全自动体系的建立

目的建立血液中乙醇含量检验的自动化体系。方法采用自动化工作站提取-顶空气相色谱检验。在自动化工作站提取中,对负压采血、顶空瓶密封时间、取样针进行考察优化,并对自动取样和手工取样进行比较。结果乙醇的自动化工作站提取-顶空气相色谱检验的定量分析数据稳定,两份平行样品相对相差小于5%,优于手工提取。乙醇含量在0.1~3.0 mg/m L范围内线性关系良好(r≥0.999),重现性好。结论该方法具有操作简单快捷、实验流程更加规范、实验数据更加准确、消除人工操作误差、重现性好等特点,可广泛应用于血液中乙醇定性定量的检验鉴定。     

基于HPLC-TOF-MS代谢组学方法的溴鼠灵毒性作用评价

目的分析溴鼠灵中毒大鼠尿液的代谢特征,揭示溴鼠灵干预对大鼠毒性作用的分子机制。方法通过构建大鼠溴鼠灵中毒模型,采用高效液相色谱-飞行时间质谱(high performance liquid chromatographytime of flight mass spectrometry,HPLC-TOF-MS)获取大鼠尿液代谢轮廓,并用正交偏最小二乘法-判别分析(orthogonal partial least squares-discrimination analysis,OPLS-DA)进行多变量统计分析,找出与溴鼠灵毒性作用密切相关的差异代谢物。结果 OPLS-DA得分图显示给药前后不同时间的大鼠尿液样本代谢物轨迹在各时间段内相似度较好,呈现各自聚类现象。比较溴鼠灵给药前后大鼠尿液样本,筛选出22个与溴鼠灵毒性相关的差异代谢物。结论溴鼠灵主要通过干扰大鼠体内的三羧酸循环、糖酵解、鞘脂代谢和色氨酸代谢等代谢通路发挥毒性作用,且溴鼠灵毒性作用具有累积效应。基于尿液HPLC-TOF-MS代谢组学方法可为溴鼠灵毒性作用的分子机制研究提供新思路。     

Population data for 11 STR loci in northeast China Han

Allele frequencies for the nine tetrameric short tandem repeats (STR) loci D3S1358, vWA, FGA, D8S1179, D21S11, D18S51, D5S818, D13S317, and D7S820 (AmpFlSTR Profiler Plus PCR amplification kit, PE Applied Biosystems) and two pentameric STR loci Penta D and Penta E (PowerPlex 16 system, Promega Corporation) were determined in a population sample of unrelated China Han.     

Distribution of alleles of 15 STR loci of the Powerplex 16 Multiplex system in four predominant population groups of South India

Allele distribution of the 15 STR loci of Powerplex 16 Multiplex System were studied in four predominant population groups of South India for evaluating their significance in human identification and population study: Iyengar Brahmin (65), Gowda (59), Lingayat (98) and Muslim (45) from the state of Karnataka. The loci analyzed are--D3S1358, THOI, D2ISI I, D18S51, D5S818, Penta E, D13S317, D7S820, D16S539, CSFIPO, Penta D, vWA, D8S179, TPOX and FGA. Out of 15 STR loci Penta D and D18S51 were found highly polymorphic in the studied populations.     

大鼠脑损伤后EPO及其受体表达与损伤时间的关系

目的研究大鼠脑损伤后脑组织中促红细胞生成素(erythropoietin,EPO)及其受体(erythropoietin receptor,EPOR)的表达与损伤时间的关系。方法 72只SD大鼠随机分为对照组(36只)、脑损伤组(36只),在建模后1、2、4、8、12、24 h每组各取6只大鼠处死,取挫伤部位脑组织,应用实时荧光定量PCR和Western印迹法检测不同时间点EPO以及EPOR的mRNA表达和蛋白表达情况。结果伤后24h内,EPO及EPOR的表达随损伤时间的增加而呈上升趋势。EPO的mRNA及蛋白表达与损伤时间之间存在相关性,其相关系数分别为0.875、0.911(P0.05);EPOR的mRNA及蛋白表达与损伤时间之间存在相关性,其相关系数分别为0.936、0.905(P0.05)。结论大鼠颅脑损伤早期EPO及EPOR的表达呈逐步上升趋势,与损伤时间具有相关性,可以作为脑损伤时间推断的参考。     

单亲鉴定案例STR选择探讨和PI值计算方法评价

作者对STR位点的个体识别能力(DP)、杂合度(H)、非父排除率(PE)、多态信息含量(PIC)等进行统计学分析,探寻了适合中国人群单亲子鉴定、且有利于国内外DNA实验室数据交流的STR位点,并对现行的PI值计算方法进行了评价。