X染色体DXS101、HumDXS6807基因座初步研究

本文对200名浙江汉族无关女性个体分别进行DXS101和HumDXS6807基因座检测,为X染色体在法医学中的应用提供基础数据。1材料与方法1.1实验材料200名无关汉族女性个体的血样均来自浙江全省各地,系本实验室日常检案积累。1.2实验方法采用Chelex-100快速法[1]提取DNA。DXS101和HumDXS6807基因座引物,由上海生工生物工程公司合成[3,4];PCR扩增按参考文献[2],其中DXS101和HumDXS6807引物浓度分别为0.5mmol/L和0.3mmol/L。构,并按国际法医血液遗传学会DNA委员会推荐的命名原则进行命名[5]。产物检测方法参照文献[2],在ABI3100型基因…     

河南汉族群体D4Satt、D5Saat miniSTR基因座遗传多态性

在法医学实践中,严重降解或者微量的生物检材采用STR分型,结果常不理想,而miniSTR技术是有效的一种检测方法[1]。本文从人类基因组DNA序列中查找并对D4Satt、D5Saat2个miniSTR基因座进行分型检测,希望可在日常法医学鉴定中作为核心STR基因座的补充[2]。1材料与方法1.1样本和DNA的提取134例河南汉族健康无关个体枸橼酸钠抗凝血样取自郑州市中心血站。采用酚-氯仿法提取DNA。1.2引物设计从GeneBank上下载4、5号染色体DNA序列,用Tandem repeats finder软件在距常用STR基因座较远的区域(50Mb以外)查找重复单位为3bp,连续重复12次以上的STR基因座。用Primer3软件设计引物,使扩增片段在150bp以内。引物由上海生工生物工程技术服务公司合成(表1)。1.3 PCR扩增及产物检测PCR扩增体系总体积20μL,包括1ng模板DNA,10×Buffer(含Mg2+1.5mmol/L)2μL,10mmol/LdNTPs 0.4μL,100μmol/L正反向引物各0.1μL,Taq表1 2个MiniSTR基因座一般信息基因座引物序列(5′-3′)重复区结...     

DXS8378和DXS6808基因座在山西汉族的遗传多态性

X染色体短串联重复序列（STR）作为遗传标记在法医学应用领域有一定的特殊性。为了获得更多的X—STR基因座的群体资料．从人类基因组学数据库中选择了DXS8378和DXS6808基因座，参照数据库中的引物序列，应用PCR技术建立合适的扩增条件，对山西汉族无关人群的等位基因及基因型的分布进行了调查，为法医遗传学研究提供基础数据。     

荧光复合扩增DXS6804、DXS6799和DXS7132基因座

应用分子克隆技术制备出DXS6804、DXS6799和DXS7132基因座的等位基因分型标准物,通过研究复合扩增技术,构建3个基因座X—STR复合扩增的荧光检测体系。     

河南汉族群体4个X-STR基因座遗传多态性

本文报道河南汉族群体DXS6804、DXS6799、DXS7130、DXS67894个X—STR基因座基因频率调查。1材料与方法 1．1样本来源及DNA提取在知情同意情况下采集河南地区汉族135名无关男性和142名无关女性个体血样本,共计277份。用苯酚／氯仿方法提取基因组DNA。     

山西汉族人群DXS7423、DXS6799基因座遗传多态性

X染色体短串联重复序列（X chromosome short tandem repeat,X—STR）由于其独特的遗传方式,具有常染色体和Y染色体STR无法比拟的优点,为了获得更多的X-STR群体资料,我们调查了DXS7423、DXS6799两个基因座在中国山西汉族人群中的等位基因及基因频率,为法医学和人类学提供参考数据。     

3个X—STR基因座复合扩增

X染色体由于其特殊的遗传方式,已受到了法医DNA工作者的重视,研究X-STR的多态性和分型已成法医学上研究内容之一。为了发掘和利用X-STR的多态性,本研究用复合扩增和银染法对3个X-STR基因座的多态性进行了研究并调查了广东汉族群体遗传学数据。1材料和方法血液标本来自本室日常检案样本和附属一院妇产科样本,用Chelex-100法提取DNA。DXS7132,DXS6789和GATA172D053个基因座引物序列参照文献[1],均由上海生物工程有限公司合成。PCR扩增总体积12.5μL,内含dNTP200μmol/L,MgCl21.5mmol/L,KCl50mmol/L,10mmol/L Tris-HCl(pH=…     

中国汉族人群2个高变MVR基因座遗传多态性

常染色体小卫星基因座D16S309(MS205)位于16p13.3(AE006466)[1],核心序列为45~54bp,重复次数8~87次[2]。D2S44(YNH24)基因座位于2q21.3-q22(AJ001534)[3],核心序列为31bp。本文采用MVR-PCR技术,选择重复单位3′侧翼区引物(公共引物)和MVR特异性引物匹配进行PCR扩增,对中国河北汉族人群2个基因座遗传多态性进行了调查。1材料与方法1.1样本及DNA提取116份枸橼酸钠抗凝血样由河北省血液中心提供,采自无血缘关系汉族健康个体。常规饱和酚-氯仿法提取DNA。1.2MVR-PCRD16S309引物序列参见文献[2,4]。反应体系为25μl,分别加入5μl…     

5个Y-STR基因座复合扩增及其单倍型

多个Y STR基因座复合扩增在国内外已得到应用[1、2 ] 。本文作者报道用银染法复合扩增DYS389II、DYS389I、DYS390、GATA A7 2和DYS393等 5个Y STR基因座 ,并对广东汉族 4 15名无关男性个体进行基因分型调查。1　材料和方法1 1　材料4 15份广东汉族无关男性个体血样来自本室日常检案标本 ,用Chelex 10 0法提取DNA。1 2　引物序列DYS389Ⅱ、DYS389Ⅰ、DYS390、GATA A7 2和DYS393等 5个基因座引物序列见文献 [3、 4 ],由上海生物工程有限公司合成。1 3　PCR扩增条件总体积 2 5 μl,内含dNTP 4 2 0 μmol/L ,MgCl23 0mm…     

河北汉族人群X染色体3个STR基因座遗传多态性

本文调查了X染色体3个STR基因座在河北汉族人群中的遗传多态性,现报道如下。1材料与方法1.1材料血液样本来自河北汉族无关个体,男114名,女118名。1.2方法血液样本用酚-氯仿法提取DNA。3个基因座的引物序列参照基因组数据库(www.gdb.org),由北京赛百盛生物工程有限公司合成。扩增采用20μl反应体系,其中包括:10×buffer 2.0μl,DXS6801、DXS7424、DXS9902引物浓度分别为1pmol/μl、0.5pmol/μl、1pmol/μl,模板20ng,25mmol/L MgC l21.2μl~1.6μl,TaqDNA聚合酶1U,10mmmol/L dNTP 0.2~0.4μl。热循环参数参考Edelmann等[1,2]人的…     

武汉汉族人群D14S608、D16S3253、D21S1437基因座多态性

利用ＰＣＲ和ＰＡＧＥ技术 ,对武地区汉族人群Ｄ14Ｓ60 8、Ｄ16Ｓ3 2 5 3、Ｄ2 1Ｓ14 3 73个ＳＴＲ基因座进行调查。2 80例武汉地区汉族无关个体抗凝血样取自同济医院血库。ＤＮＡ提取、ＰＣＲ扩增产物检测 ,基因型命名及群体数据参照杨庆恩方法[1] ,3个ＳＴＲ基本特征和其引物参数文献[2 ] 。武汉汉族人群Ｄ 14Ｓ60 8、Ｄ 16Ｓ3 2 5 3和Ｄ2 1Ｓ14 3 7等位基因频率分布见表 1。Ｄ14Ｓ60 8、Ｄ16Ｓ3 2 5 3和Ｄ2 1Ｓ14 3 7基因座Ｈ、ＤＰ、Ｐｍ和ＰＩＣ值见表 2。　　为了从众多的ＳＴＲ位点中筛选出频率更好、分型稳定的ＳＴＲ基因座。选取了…     

广西壮族人群2个Y-STR基因座多态性研究

1999年Ｗｈｉｔｅ等[1] 报道了 7个Ｙ ＳＴＲ基因座 ,其核心重复序列均为ＧＡＴＡ。本文作者对其中Ａ10、Ａ7 1两个基因座在中国壮族人群中的分布频率进行了调查 ,报告如下。1　材料及方法1 1　样品及其ＤＮＡ提取来源于广西壮族无关男性个体血斑 10 0份 ,4℃低温保存。采用Ｃｈｅｌｅｘ 10 0快速提取法[2 ] 。离心后4℃低温保存。1 2　引物合成与标记根据文献 [1]。由上海生物工程公司合成如下引物序列。Ａ10和Ａ7 1引物的 5′端用ＦＡＭ标记。1 3　ＰＣＲ扩增及其产物检测10 μｌ反应体系 ,包括 10×ＰＥＢｕｆｆｅｒⅡ (Ｐｅｒｋｉｎ Ｅ…     

江苏地区汉族人群15个STR基因座频率调查

采用五色荧光标记引物复合扩增技术 ,对江苏地区 12 0名汉族无关个体进行了 15个STR基因座的基因分型 ,旨在为法医学应用提供基础资料。1　材料和方法12 0例无关汉族个体的血样均系本实验室日常检案积累 ;所有样本的DNA均用硅珠法[2 ] 或Chelex[1]法提取后 ,参照AmpF1STRIdentifiler试剂盒 (PE公司 )及ABI310型遗传分析仪的使用说明书进行扩增和检测 ,并分别计算 15个基因座的基因频率、杂合度(H)、个体识别率 (Dp)及多态信息量 (PIC)。2　结果和讨论12 0例无关个体的 15个STR基因座的等位基因频率见表 1。对每个基因座进行 χ2 …     

中国鄂温克族DXS7423，DXS7424，DXS7132，DXS7133，DXS6804位点多态性的研究

目的以无关个体为研究对象,研究鄂温克族人群X染色体5个STR位点的遗传多态性,建立群体遗传数据库。方法用聚合酶链反应(PCR)、变性聚丙烯凝胶电泳和银染的方法,检测98名中国鄂温克族DXS7423,DXS7424,DXS7132,DXS7133,DXS6804位点的重复序列长度的变化。结果5个STR位点在鄂温克族群体均具有遗传多态性,χ2检验表明多态性分布符合Hardy-Weinberg平衡定律。结论中国鄂温克族X染色体5个STR基因座群体遗传数据资料,可用于法庭科学个体识别、亲子鉴定及其他人类学研究。     

舟山群岛汉族人群15个STR基因座遗传多态性

本文用荧光标记复合扩增系统对中国舟山群岛汉族人群15个STR基因座进行遗传多态性调查,得到基因频率及法医学参数,为相关法医学工作提供基础数据. 1材料与方法 1.1 样本及DNA提取 220份40岁以上三代皆居住于舟山群岛的汉族无关健康个体血样,其中男性147例、女性73例,取自本实验室前科人员血样本积累.采用常规Chelex-100法[1]提取DNA.     

Y染色体DYS622和DYS630基因座遗传多态性调查

Y染色体遗传标记具有男性特有、父系遗传及单倍型遗传的三大特征[1-3],Y染色体的独特性与STR位点分型检测的优越性相结合成为法医学个体识别和父权鉴定中的新工具。本研究选取了2个新的Y染色体STR基因座DYS622和DYS630,调查其在华东地区汉族群体中的遗传多态性,并对其在法医学中的应用作初步探讨。1材料与方法1.1样本87例无关男性个体EDTA抗凝血或颊粘膜试子采自江苏、浙江、上海等地。Chelex-100法[4]提取样本DNA。1.2引物在GDB查得两个基因座的引物序列,见表1。表1 DYS622和DYS630基因座信息特征基因座GenBank登录号重复序…     

闽南地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性调查

本文通过对中国闽南地区汉族15个STR基因座遗传多态性的研究,旨在获得该地区人群的基因频率等遗传学数据,为完善我国STR基因数据库,广泛开展人类群体遗传学及法医个体识别等研究提供基础资料。1材料和方法1.1样本122份无关个体EDTA抗凝血样本采自调查证实三代以上居住于福建省安溪县与南安市的汉族群体,其中男性90例、女性32例。血样本用EP管分装,-30℃冰冻保存。1.2DNA提取及定量取血样3.5μl,常规Chelex-100法[1]提取DNA,溴化乙锭荧光法[2]测DNA含量。1.3PCR复合扩增采用AmpFLSTRIdentifilerPCR扩增试剂盒(美国ABI公司),…     

武汉汉族人群D15S659、D6S2418、D5S1457遗传多态性

利用PCR和PAGE技术,对武汉地区汉族人群D15S659、D6S2418、D5S1457三个STR基因座进行群体调查。1材料与方法1.1样本221例武汉地区汉族无关个体抗凝血样,取自同济医院血库。1.2 DNA提取采用Chelex-100提取法提取血样DNA。1.3 3个STR基本特征和引物参数见文献。1.4 PCR扩增及电泳采用常规DNA-STR银染分型技术,参照文献。     

福建汉族人群12个Y-STR基因座遗传多态性

本文应用PCR技术对福建汉族群体189名无关男性个体12个Y-STR基因座遗传多态性进行调查,现报道如下。1材料与方法1.1实验方法福建省各地189名汉族男性无关个体的血样,系本实验室日常检案积累。Chelex-100法[1]提取DNA。采用12.5μl扩增反应体系,其中包括:引物、PCR缓冲液各1.25μl;Taq Gold DNA聚合酶0.3μl;模板DNA 1μl;无菌去离子水补足体系。热循环参数参照PowerPlex Y System试剂盒推荐方法。1.2统计学分析[2]用直接计数法计算各基因座等位基因和单倍型频率。基因差异性(gene d iversity,GD)的计算公式:GD=n(1-∑X i2)/(n-…     

12个mini-X-STR和Amel基因座荧光标记复合扩增体系的初步研究

目的研究建立12个mini-X-STR和Amel基因座复合扩增体系。方法选择DXS101、DXS10159、DXS10162、DXS10164、DXS6789、DXS7133、DXS7423、DXS7424、DXS8378、DXS981、GATA165B12和GA-TA31E08共12个X-STR与Amelogenin基因座,自行设计引物,分别采用FAM、HEX、Tamra、ROX四色荧光标记5′端,并进行必要的修饰,按照合适的引物浓度进行混合。对97个血痕样本进行复合扩增,并用ABI3130XL进行电泳和分型。结果所建立的荧光标记复合扩增体系能够得到清晰、明确的分型图谱,灵敏度达50pg,稳定性、重复性与平衡性较佳。结论本研究建立的12个mini-X-STR和Amel基因座荧光标记复合扩增体系统检验方法简单,灵敏度高,适合实际办案的需要。