用FLDAS-PCR和PCR-RFLP检测汉族人群GPT的多态性

目的 建立片段长度差异等位基因特异性PCR(FLDAS-PCR)检测GPT基因型的新方法,并调查武汉地区汉族人群GPT多态性分布。方法 应用FLDAS-PCR、PCR-RFLP分别对武汉地区248例汉族个体进行GPT基因型分型。结果 FLDAS-PCR与PCR-RFLP分型结果完全一致,GPT的3种基因型分型明确,基因频率GPT*1=0.5423,GPT*2=0.4577,基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡。结论 FLDAS-PCR和PCR-RFSP分型GPT在法医学鉴定中有实用价值。     

用新设计引物调查武汉汉族Penta D和Penta E基因座遗传多态性

目的　研究PentaD和PentaE基因座分型引物设计 ,调查PentaD和PentaE基因座在武汉汉族人群中的遗传多态性。方法　用重新设计的PentaD和PentaE基因座分型引物 ,采用热启动PCR和PAGE技术对 2 81名武汉地区汉族无关个体进行分型调查 ,并将其分型结果与Promega公司的PowerPlexTM16系统荧光标记复合扩增试剂盒分型结果进行比较。结果　新设计引物扩增产物的片段大小范围分别为 15 3～ 198bp和 10 7～ 2 12bp ,其分型结果与PowerPlexTM16系统的分型结果完全一致 ,且用银染法检测的灵敏度显著提高 (由 0 5ng提高到 0 2ng)。PentaD和PentaE基因座在武汉汉族群体分别检出 10个和 2 1个等位基因 ,其基因型频率分布均符合Hardy Weinberg平衡。家系调查证实了其等位基因的传递符合孟德尔遗传规律。两基因座的个体识别能力 (DP)分别为 0 92 62、 0 9860 ,非父排除率 (PE)分别为 0 665 1、 0 83 2 5。结论　新设计引物用于PentaD和PentaE基因座的分型检测准确可靠 ,两基因座多态性程度高 ,在法医学个人识别和亲子鉴定中具有使用价值。     

FAM羧基荧光素修饰引物检测D1S80基因座遗传多态性

目的建立用FAM羧基荧光素修饰引物检测DIS80基因座的方法。方法采用5-FAM修饰引物,通过PCR扩增,DNA全自动遗传分析仪进行片段长度分析,检测129名黑龙江汉族无关个体DIS80基因座遗传多态性。结果在所调查的129名黑龙江汉族无关个体样本中,DIS80基因座有21个等位基因,56个基因型,基因频率在0.0039-0.1667之间。杂合度(H)为0.9097,个人识别机率(PD)为0.9691,非父排除概率(PE)为0.8113,多态性信息总量(PIC)为0.8988。群体内基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡。结论FAM羧基荧光素修饰引物检测DIS80基因座的方法,简便、灵敏、稳定性好,DIS80基因座用于个体识别及亲权鉴定具有很高的实用价值。     

STR-typer 10G/F试剂在单亲鉴定中的应用

目的观察和分析STR-typer 10G/F试剂盒在单亲鉴定中的作用。方法随机抽样湖北地区汉族个体206人静脉血样,Chelex-100法提取基因组DNA。采用STR-typer 10G/F试剂盒进行复合扩增,分型并计数基因型并计算基因频率、基因座杂合度(H)、标准三联体非父排除率(PE3)和二联体非父排除率(PE2)。结果 9个STR基因座等位基因数9～14个,基因型分布观察值与Hardy-Weinberg平衡理论值的差异均无显著性(P>0.05),杂合度在0.75以上,平均非父排除率0.57～0.75;STR-typer 10G/F试剂盒累积非父排除率(PE3)0.999 973,合并使用Identifiler Plus系统,累积非父排除率可达0.999 999 967 6。结论 STR-typer 10G/F系统多态性程度基本接近Identifiler Plus系统,在单亲鉴定时,可作为Identifiler试剂盒的有效补充。     

新疆维吾尔族15个STR基因座的遗传多态性

目的　建立新疆维吾尔族 1 5个STR基因座的等位基因分布基础遗传数据库 ,并比较其与天津汉族群体调查结果的差异。方法　应用荧光标记复合扩增、ABI 31 0 0 (Avant)型基因分析仪检测新疆 2 6 5名无关个体AmpFeSTR○RIdentifilerTM系统 ,统计 1 5个STR基因座的群体遗传参数。结果　 2 6 5名无关个体 1 5个STR基因座中共检出 1 5 7个等位基因及 5 2 3种基因型 ,累计个体识别力 (TDP)为 0 999999999999999998,累积非父排除能力 (PE)为 0 .99999984 (三联体 )。结论　新疆维族 1 5个STR基因座的等位基因呈高度多态性分布 ,与天津汉族群体调查数据无显著差异 ,适用于个体识别和亲权鉴定     

甘肃地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性

本文对甘肃地区汉族无关个体15个STR和Amel基因座遗传多态性进行调查,现报道如下。1材料与方法从甘肃地区2005年检案受害人及嫌疑人中筛选的215份无关汉族个体血样,经Chelex-100法提取DNA,采用Identifiler 16荧光检测试剂盒(按其说明书方法),用9700扩增仪进行复合扩增,3100遗传分析仪Data collection2.0检测收集数据,genemapper3.2软件分析,得到STR分型结果。经统计学分析基因频率、基因型频率、杂合度等基础数据。2结果与讨论甘肃汉族人群体215例15个STR基因座等位基因频率,结果见表1。杂合度(H)及个体识别率(DP)等统计结果见表2。…     

贵州黔南地区汉族人群18个STR基因座的遗传多态性

目的调查贵州黔南地区汉族人群D5S818等18个基因座的遗传多态性。方法采用国产DNATyperTM19荧光标记试剂盒,获得1104名黔南地区汉族无关个体18个STR基因座的DNA分型,并应用统计软件计算等位基因的分布频率等群体遗传学数据。结果 18个STR基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),杂合度(H)在0.622~0.915之间,匹配概率(Pm)在0.017~0.220之间,个体识别概率(DP)在0.780~0.983之间,多态信息含量(PIC)在0.540~0.900之间,非父排除概率(PE)值在0.318~0.826之间。结论 18个STR基因座具有遗传多态性,在该地区汉族人群的多态性研究中具有较高的应用价值。     

FUT2/01基因座在中国北方汉族人群中的多态性

目的调查STR基因座FUT2/01在中国人群中的基因结构特征及其在中国人群中的多态性分布特点,并对其法医学应用前景进行探讨。方法应用PCR方法扩增FUT2/01基因,DNA测序确定所有等位基因的序列;常规聚丙烯酰胺凝胶电泳调查中国人群中FUT2/01基因座的多态性分布,同时应用荧光标记引物进行自动化检测分析和基因型鉴定。结果DNA测序结果仅显示核心序列的重复数目变化所导致的长度差异;在所调查的中国汉族人群162例个体中共发现9种等位基因和28种基因型,系统的个体识别率为0.9639,父权排除率为0.6266。此外,荧光标记引物经自动化检测可对该基因座进行良好的分型。结论FUT2/01基因座在中国汉族人群中表现出高度的杂合性和个体特异性,在法医学鉴定中具有较高的应用价值。     

海南汉族人群19个STR基因座遗传多态性及其应用

目的建立海南地区汉族人群19个常染色体STR基因座的遗传多态性数据资料,并探讨此19-STR基因座系统在亲子鉴定中的应用。方法对海南汉族462例无血缘关系个体,采用Goldeneye~(TM) 20A系统复合扩增并检测,得到19个STR基因座的遗传数据信息;在283例亲子鉴定案例中,评价19-STR基因座系统的应用。结果 19个STR基因座的基因频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P0.05),杂合度在0.603~0.914之间,累积个体识别率大于0.999 999 999 999 999,累积三联体非父排除率为0.999 999 994。283例亲子鉴定中,三联体170例,二联体113例;认定案例247例(87.3%),排除案例36例(12.7%);发生等位基因突变案例14例(4.9%),均为一步突变。结论 19个STR基因座中的14个基因座具有高度遗传多态性,19-STR基因座复合扩增分型系统具有较高的非父排除效能,可满足海南地区亲子鉴定的需要,同时应注意亲子鉴定中的基因突变现象。     

台湾汉族群体15个STR基因座的遗传多态性

目的为获得15个基因座在台湾汉族群体中的遗传学数据,探究其在法医学检验中的应用价值. 方法用ProwerPlex(r)16 System荧光标记试剂盒 (Promega公司)检测15个STR基因座的多态性. 结果在189例台湾汉族随机个体中,15个STR基因座分别检出6、7、15、15、19、10、8、8、7、8、10、8、9、6、19 个等位基因,各等位基因频率为0.002 6～0.452 4.观察杂合度(HO)为 0.608 2～0.926 1 ,期望杂合度(HE)为0.6103～0.916 2, 多态信息含量(PIC)为0.5491～0.9073,亲权排除率(PE)为0.353 2～0.826 4,个体识别率为0.609 1～0.914 3.累积亲权排除率(PE)为 0.999 999, 累积个体识别率为0.999 999 999. 结论该15个STR基因座具有很高的多态性,已可以满足大多数的亲权鉴定和法医学个人识别的需要.     

SNaPshot技术检测Y-SNP位点O3-M122单倍群的应用

目的采用SNaPshot技术检测案例检材O3-M122位点6个亚群的分型,并调查其在云南3个民族无关男性人群中的频率分布。方法建立5-plex Y-SNPs复合扩增体系,采用SNaPshot Multiplex试剂盒,检测案例检材O3-M122单倍群下O3*-M122、O3a*-M324、O3a3*-P201、O3a3b*-M7、O3a3c*-M134、O3a3c1*-M117共6个Y-SNPs分型,并对上述6个Y-SNPs在云南佤族、白族、傣族共174名无关男性个体中的分布进行调查。结果 17份案例检材均得到良好的分型结果。上述3个民族分别在3个、5个、5个位点上发现多态性,其中佤族O3a3*-P201分布频率最高(0.430 0);白族O3a*-M324频率最高(0.212 3);傣族O3a3c1*-M117频率最高(0.158 2)。结论多重PCR反应及SNaPshot技术的联合应用适用于法医案件检材DNA检测,3个民族多态性数据可为相关应用所参考。     

A comparison of the sensitivity of typing group-specific component (Gc) and the phosphoglucomutase (PGM1) locus in control and casework bloodstains by three isoelectric focusing methods

The performance of typing group-specific component (Gc) in bloodstains by two isoelectric focusing methods followed by its detection with silver staining has been compared with an established forensic system of typing phosphoglucomutase (PGM1) locus phenotypes by isoelectric focusing (IEF) in 1 mm gels. For Gc typing ultra-thin isoelectric focusing (UTIEF) gels and immobilized pH gradient (IPG) gels were used. Both laboratory prepared stains and casework stains were examined. The Gc UTIEF method is approximately eight times more sensitive than the existing PGM1 1 mm IEF method for control and casework stains. However, on average, a larger amount of stain was taken from casework stains than control stains for each typing system. A total of 53 casework stains were examined. Comparable success rates of 62% and 64% were obtained for typing Gc on UTIEF gels and PGM1 by 1 mm IEF, respectively. A success rate of 55% was obtained for typing Gc on IPGs. Bloodstains that were over 200 days old were successfully grouped by all three methods.     

成都地区汉族Gc亚型的分布及血痕中Gc亚型的检测

作者用免疫固定薄层聚丙烯酰胺凝胶等电聚焦(PAGIF)技术,调查了成都地区无关的125名健康汉族人血清Gc亚型分布。其6种亚型频率(%)分别为:Ge1F=20.8,Ge1S=8.0,Gc1F-1S=18.4,Gc2-1F=30.4,Gc2-1S=16.0和Gc2=6.4。Gc的基因频率为:Cc~(1F)=0.452,Gc~(1S)=0.252和Gc~2=0.296。对保存于室温条件下20周的陈旧血痕进行了Gc亚型定型,获得满意结果。     

犬17A STR 5色荧光检测试剂盒在警犬DNA鉴定中的应用研究

目的建立犬DNA检测方法。方法采用自主研发的多重PCR扩增体系和五色荧光（FAM、HEX、TAMRA、ROX和SIZ）自动化检测技术调查了犬DAmel和VWFX等16个STR基因座和1个性别决定基因座多态性,并计算该16个STR基因座的等位基因频率（P）、杂合度（H）、多态信息含量（PIC）和非父排除率（PE）。实验犬为11个品种231头犬。结果结果显示该16个STR位点的非父排除率（PE）和个体识别力（DP）分别为0.995026和0.999999992。结论显示研发的犬STR-DNA荧光检测试剂盒可作为犬DNA鉴定常规应用。     

改良磺基水杨酸法显示GC谱带及两个新的GC变异型的发现

本文采用改良了Kühnl报告的磺基水杨酸沉淀法显示GC谱带的技术,显示了六种常见的GC亚型和GC变异型。并且采用该法发现了两个新的GC变异型基因Gc~(1c3)和Gc~(2c7),其基因频率分別为0.0008和0.0004。本法经济、快速,谱带清晰,可取代需抗GC血清的常规免疫固定技术。     

Study on the application of parent-of-origin specific DNA methylation markers to forensic genetics

In paternity test, especially in motherless cases, the allele inherited from father (obligatory gene, OG) often cannot be determined. The paternity exclusion probability (PE) of a genetic marker is reduced considerably. Therefore, it is necessary to develop a new technique, by which the parental origin of alleles can be determined without genealogical analysis. In this paper, we explored the possibility of using parent-of-origin specific DNA methylation markers to determine the parental origin of alleles, choosing the imprinted single nucleotide polymorphism (SNP) locus rs220028 (A/G) as a model system. We typed the SNP by mutagenically separated PCR (MS-PCR). The frequencies of alleles were A = 0.5085, G = 0.4915; the unbiased heterozygosity was 0.5020. In order to discriminate between the maternal allele and paternal allele, post-digestion MS-PCR, a novel PCR based methylation analysis and SNP typing technique was developed and performed on 18 heterozygous children, and the methylated maternal allele was detected specifically. As a pilot study on the use of epigenetic markers in forensic genetics, our results demonstrated the feasibility of using parent-of-origin specific DNA methylation markers to determine the parental origin of alleles.     

用快速高效液相色谱系统分离纯化Gc蛋白

报告Gc蛋白的一种分离方法，为免疫制备抗Gc血清制备抗原。硫酸该分级沉淀出含Gc的人血清组份，BlueSepharoseCL－6B亲和色谱除去含Gc硫酸铸分级沉淀的人血清组份中的白蛋白，快速高效液相色谱系统过Alkyl-SuperoseTMHR5／5疏水色谱柱和MonoQHR5／5离子交换柱。聚丙烯酸胺凝胶解离、非解离电泳证明，Gc蛋白得到了彻底纯化。免疫固定显示：纯化出的蛋白确实是Gc蛋白．为1-1型。快速高效液相色谱为蛋白质的纯化提供了新的技术及仪器手段。     

The detection of group specific component (Gc) in the general population of West Virginia

An isoelectric focusing method is described for the detection of group specific component (Gc) in forensic casework. Gc can be subtyped in one day using this reliable and reproducible method. The gene frequency data collected indicate that the occurrence of Gc phenotypes in the population of West Virginia is consistent with established frequencies for the system.     

Genetic polymorphism of human C1R subcomponent of the first complement component in the Japanese population

Genetic polymorphism of the C1R subcomponent of human complement component C1 has been investigated in neuraminidase treated EDTA plasma samples of 440 healthy Japanese individuals living in Tokyo by means of thin-layer polyacrylamide gel isoelectric focusing (PAGIEF) at pH 3.5-9.5 in the presence of 8.0 M urea followed by an electroblotting with enzyme immunoassay. Three common and three rare alleles were detected in the Japanese population. Of these, two common alleles were identical to C1R*1 and C1R*2 and other new alleles were tentatively designated C1R*3, C1R*4, C1R*5 and C1R*6, respectively. The results of the family studies suggested that the genetic model for C1R polymorphism assumed autosomal codominant Mendelian inheritance. The allele frequencies were estimated as C1R*1 = 0.4216, C1R*2 = 0.3602, C1R*3 = 0.2068, C1R*4 = 0.0091 and C1R*R(C1R*5 and C1R*6) = 0.0023, respectively. The distribution of allotypes fitted the Hardy-Weinberg equilibrium. The C1R system provides a useful genetic marker for human genetics, anthropologic studies and forensic science.