武汉汉族人群D15S659、D6S2418、D5S1457遗传多态性

利用PCR和PAGE技术,对武汉地区汉族人群D15S659、D6S2418、D5S1457三个STR基因座进行群体调查。1材料与方法1.1样本221例武汉地区汉族无关个体抗凝血样,取自同济医院血库。1.2 DNA提取采用Chelex-100提取法提取血样DNA。1.3 3个STR基本特征和引物参数见文献。1.4 PCR扩增及电泳采用常规DNA-STR银染分型技术,参照文献。     

微量DNA:容易忽略的生物物证

PCR技术的出现,大大提高了法医DNA分析技术的灵敏度,尤其是STR复合扩增技术的应用,不仅如同DNA指纹技术一样能够进行同一认定,而且使其灵敏度达到了纳克级以下的水平,大大提高了其解决微量、降解DNA的分析能力.Findlay等[1]成功地分析了低至单个细胞水平的模板DNA;Van Hoofstat等[2]利用DNA技术分析现场遗留指纹进行检验;Barbaro等[3]利用DNA技术对毛干进行检验;Schmerer等[4]和Burger等[5]分别用60和50个循环分析古代骨骼DNA;Van Oorschot和Jones[6]利用PCR检验,从电话话筒、钢笔、手提箱把手等提取的检材样品中得到DNA分型;Wickenheiser[7]从被盗汽车的方向盘上提取DNA进行STR分型,从而认定罪犯.以上研究报道的结果表明,现有的DNA技术能够对微量DNA进行检验.     

法医 STR 的快速检验方法

以 STR 复合扩增检测为代表的法医 DNA 分型技术以其灵敏度高、核心序列小、可复合扩增、方法易于标准化等优势,已经成为当前法庭科学 DNA 检验的主要手段,在各国刑事案件侦破和民事案件解决中发挥了重要的作用。本研究在国内外实验室法医 STR快速检验方法[1]的基础上,从生物物证 DNA 免提取扩增检验、生物物证 DNA 快速提取检验、生物物证 DNA快速扩增、利用新型检测设备快速检测及使用 Gen-eMapper ID－X 软件快速分析5个方面进行归纳。     

癌组织的基因突变对PCR反应及结果分析的影响

在实际检案中,办案人员有时送检石蜡包埋人体病理组织(癌)或切片。这类检材由于存在基因突变的可能,往往影响正确的结果分析,使给出鉴定结论造成困难。某地发生一起保险欺诈案件中,送检子宫癌病理组织蜡块,要求与当事人的血液进行同一认定,笔者通过该案例检验探讨癌组织的基因突变对PCR反应及结果分析的影响。1材料与方法采用Chelex-100法提取当事人的血液样本DNA,经PCR扩增,获得STR分型(图1)。采用文献[1]的方法提取DNA,经PCR扩增,获得STR分型(图2)。2讨论(1)本例检验结果表明,癌组织的基因突变会影响PCR扩增,使STR分型结果发…     

陈旧骨骼的核DNA检验

在发达国家，对无名尸骨进行个人识别时，通常的方法是比较骨骼与死者生前的身体特征或医疗记录[1]，但在发展中国家，由于。医疗记录往往不甚完备，这种方法较难以实施。此外，如果对已埋葬数十年的尸骨进行鉴定，则更需要依靠其他技术方法。运用PCR技术进行DNA检验是解决这种难题的途径之一。陈旧骨骼的DNA降解严重，从中提取的核DNA一般小于1000bp[2]，为此，进行PCR分析时宜选择扩增片段较短的基因位点。在本文中，作者报道了一种可靠的用于陈旧骨胳DNA提取、扩增和基因分型的方法。材料和方法一、样本取长骨、椎骨作为实验检材…     

河南汉族群体D4Satt、D5Saat miniSTR基因座遗传多态性

在法医学实践中,严重降解或者微量的生物检材采用STR分型,结果常不理想,而miniSTR技术是有效的一种检测方法[1]。本文从人类基因组DNA序列中查找并对D4Satt、D5Saat2个miniSTR基因座进行分型检测,希望可在日常法医学鉴定中作为核心STR基因座的补充[2]。1材料与方法1.1样本和DNA的提取134例河南汉族健康无关个体枸橼酸钠抗凝血样取自郑州市中心血站。采用酚-氯仿法提取DNA。1.2引物设计从GeneBank上下载4、5号染色体DNA序列,用Tandem repeats finder软件在距常用STR基因座较远的区域(50Mb以外)查找重复单位为3bp,连续重复12次以上的STR基因座。用Primer3软件设计引物,使扩增片段在150bp以内。引物由上海生工生物工程技术服务公司合成(表1)。1.3 PCR扩增及产物检测PCR扩增体系总体积20μL,包括1ng模板DNA,10×Buffer(含Mg2+1.5mmol/L)2μL,10mmol/LdNTPs 0.4μL,100μmol/L正反向引物各0.1μL,Taq表1 2个MiniSTR基因座一般信息基因座引物序列(5′-3′)重复区结...     

D3S1358基因座重复序列分析1例

1案例资料1.1简要案情作者在对1例非正常死亡案件死者的血样进行DNA检验中,发现D3S1358基因座呈三带型。1.2检验方法STR分型按照硅珠法[1]提取血样模板DNA,用Identifiler Plus荧光检测试剂盒进行PCR扩增,产物在ABI 3130XL遗传分析仪进行分型检测,使用GeneMapper ID-X软件进行数据分析。筛选阳性克隆设计的引物序列见表1。     

利用STR分型方法进行同胞关系鉴定

本文运用人类短串联重复序列(shorttandemrepeats,STR)分型方法对1案例进行了同胞血缘关系鉴定,通过这一案例的分析得出了一些数据,供同行们参考。1案情2004年,应委托人王某之要求,对5位已知同胞兄弟姐妹与另一位可疑个体之间是否存在同父同母之同胞关系进行鉴定。2材料和方法2.1DNA抽提取5名同胞兄妹的血样(1,2,3,5,6号)和可疑个体血样(4号),用Chelex-100快速提取法[1]提取DNA。2.2PCR反应用ABI公司荧光标记扩增试剂盒(AmpFlSTRTCofilerPCRAmplificationKit、AmpFlSTRTMProfilerPluPCRAmplificationKit)对DNA进行PCR扩…     

陈旧性骨骼DNA提取方法的探索

目的探索陈旧性骨骼DNA的提取方法。方法收集4~15年陈旧骨骼样本,去除表面污染物,经脱钙、裂解提取各样本DNA,使用QIAquickPCR Purification试剂盒进行纯化,检测DNA纯度和浓度,应用Power PlexFusion荧光标记复合扩增系统进行扩增,AB-3500型遗传分析仪检测STR分型。结果 15例陈旧性骨骼经提取、纯化,提取的DNA模板浓度较高,在42.9~176.4ng/μL之间,A260/A280值较稳定,在1.06~1.40之间;所有样本均获得完整STR分型。结论该方法简便快速,提取效果好,能够适用于法医学实际检案。     

激光显微捕获技术用于尿液脱落细胞DNA检测

目的采用激光显微捕获技术（LCM）捕获尿液脱落细胞,并进行STR分型。方法收集10份健康成人尿液样本,根据储存时间分组,其中新鲜尿液组（≤24h）分别采用Chelex-100及LCM联合DNA IQTM提取法提取DNA,储存尿液组（〉24h）再分为4℃组和室温组,分别在4～30d内不同时间点采用LCM联合DNA IQTM提取法提取DNA;各组提取的模板DNA进行扩增及SRT分型检验。结果新鲜尿液组采用LCM联合DNA IQTM提取法提取DNA,所有样本均可检出全部基因座（16个）,采用Chelex-100法则在部分基因座上出现等位基因丢失、非特异性扩增、峰值低等现象;4℃储存10d和室温储存4d以内的尿液经检验可明确判读12个以上基因座,4℃20～30d及室温7d,可检出7个以上基因座。结论 LCM技术可用于尿液检材的DNA分型检验,且检材应尽可能4℃保存并尽快检验。     

安徽地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性

应用荧光标记引物复合扩增技术,对安徽地区263名汉族无关个体的D3S1358、TH01、D21S11、D18S51、Penta E、D5S818、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、Penta D、vWA、D8S1179、TPOX、FGA等15个STR基因座的多态性调查,现报道如下。1材料与方法1.1样本及DNA提取263例汉族无关个体血样由本实验室日常检案积累,采用常规Chelex法提取样本DNA[1]。1.2复合扩增及分型按PowerPlexTM(Promega公司)16 System试剂盒说明书进行复合扩增及分型。PCR反应总体系10μl,其中Buffer 1μl,primer 1μl,Taq Gold酶0.3μl,DNA模板适量,…     

Triton X-100快速提取甲醛固定、石蜡包埋组织内DNA的方法

目的建立一种快速提取甲醛固定、石蜡包埋组织内DNA的方法。方法利用TritonX-100一步提取甲醛固定、石蜡包埋组织内DNA,并具体研究了不同浓度TritonX-100对提取后DNA-STR分型效果的影响。结果成功地一步提取出甲醛固定、石蜡包埋组织内DNA,浓度为1%的TritonX-100提取效果较好。结论利用TritonX-100提取甲醛固定、石蜡包埋组织内的DNA,为快速提取DNA提供了有效的途径,是法科学领域中一种值得推荐的方法。     

云南怒族人群HPRTB、DXS7423、DXS101基因座遗传多态性

HPRTB、DXS7423、DXS101是X染色体上常见的3个STR基因座,定位于Xq22.1-Xq28,其核心序列分别为AGTA、TCCA和CTT-ATT,本文对3个X-STR基因座的等位基因频率和基因型频率数据进行调查,为法医学检案提供基础遗传频率数据。1材料与方法1.1样本采集100份无血缘关系的怒族健康个体静脉血在云南随机采集,每份3m l,EDTA抗凝,-70℃保存[1]。1.2方法1.2.1 DNA提取及扩增Chelex-100法提取基因组DNA[2]。3个基因座引物序列及扩增条件见表1。表1 3个基因座的引物信息及扩增条件基因座PCR引物序列(5’to3’)变性退火延伸循环数HPRTBA…     

利用AutoMate Express~(TM)系统提取陈旧性骨骼DNA

目的建立利用AutoMate Express~(TM)系统提取陈旧性骨骼DNA的方法。方法将骨骼用冷冻研磨机研磨成骨粉,经AutoMate Express~(TM)系统提取后,用Identifiler~Plus、MiniFiler~(TM)试剂盒扩增分型。结果10例保存在不同环境中、死亡时间在10~20年的骨骼样本利用AutoMate Express~(TM)系统3 h内完成DNA提取,有8例获得完整STR分型。结论 AutoMate Express~(TM)系统能快速、高效地提取陈旧性骨骼DNA,可应用于法医实际案件检验。     

车辆上脱落细胞STR检验

目的对汽车方向盘及变速杆把手上的皮肤脱落细胞进行STR检验研究。方法用EZ-tape采集车辆方向盘及变速杆上的脱落细胞,Chelex-100法与磁珠法结合提取DNA,延长保温时间。定量后调整PCR反应体系,适当增加PCR循环数,增加PCR产物量及延长进样时间进行电泳检测,使用GeneMapperIDV3.2软件进行STR分型。同时,对比使用多重置换扩增技术对提取的DNA进行全基因组扩增。结果对33份车辆方向盘和变速杆上脱落细胞的检测,其中19份检出全部基因座的基因分型结果,9份检出部分基因型,5份未检出DNA分型结果。而利用多重置换扩增技术未获得满意图谱。结论本研究建立的脱落细胞收集、DNA提取、PCR扩增及检测方法适合于车辆上脱落细胞的检验,其结果优于使用多重置换扩增技术获得的分型。     

车辆上脱落细胞STR检验

目的对汽车方向盘及变速杆把手上的皮肤脱落细胞进行STR检验研究。方法用EZ-tape采集车辆方向盘及变速杆上的脱落细胞,Chelex-100法与磁珠法结合提取DNA,延长保温时间。定量后调整PCR反应体系,适当增加PCR循环数,增加PCR产物量及延长进样时间进行电泳检测,使用GeneMapperIDV3.2软件进行STR分型。同时,对比使用多重置换扩增技术对提取的DNA进行全基因组扩增。结果对33份车辆方向盘和变速杆上脱落细胞的检测,其中19份检出全部基因座的基因分型结果,9份检出部分基因型,5份未检出DNA分型结果。而利用多重置换扩增技术未获得满意图谱。结论本研究建立的脱落细胞收集、DNA提取、PCR扩增及检测方法适合于车辆上脱落细胞的检验,其结果优于使用多重置换扩增技术获得的分型。     

口腔拭子DNA检验的实时定量研究

目的寻求提高口腔拭子的DNA检验效率的方法。方法对来源于不同个体或同一个体不同擦拭次数的口腔拭子用Chelex-100或磁珠法提取的DNA用实时定量PCR技术进行定量,同时用Identifiler复合扩增系统在ABI3100遗传分析仪上对这些DNA样品进行STR分型。结果在建立的Identifiler系统8μl扩增体系中,3个月内的口腔拭子用Chelex-100法提取的DNA模板1μl量较3μl量扩增效果好,磁珠法提取的DNA模板用量大小对复合扩增检测影响较小。结论用棉签擦拭颊粘膜5次制备口腔拭子,取其头部的约1/4用200μlChelex-100法提取DNA,然后用1μl模板进行复合扩增,是提高口腔拭子的DNA检验效率的简便可行的方法,但陈旧口腔拭子用磁珠法提取更能保证复合扩增分型成功。     

应用DNA工作站进行批量血斑STR分型的研究

目的建立对大批量血斑样品PCR-STR基因分型检测的自动化新方法。方法应用自动化DNA工作站改良优化Chelex-100法和DNAIQ磁珠法的实验条件,建立两种批量血斑的自动化DNA提取方法;筛选确定PCR-STR反应体系的构建和PCR-STR产物测序电泳分析前处理程序。结果1104份血斑样品经Chelex-100法批量提取、Profiler Plus试剂盒扩增均一次检出9个STR基因座,定量PCR测定模板浓度均值为0.43ng/ml,荧光检测信号在200~800RFU之间;对其中114份血斑样品用DNAIQ磁珠法批量提取、同试剂盒扩增均一次检出9个STR基因座,定量PCR测定模板浓度均值为0.7ng/ml,荧光检测信号在1000~2000RFU之间;对其中50份血斑进行自动和手动Chel-ex-100检验法比较,成功率分别为100%和98%,且前者等位基因峰高信号更均衡。结论本文建立的自动化DNA工作站批量检测方法,在成功率、稳定性、均一性等方面具有优势。     

5个Y-STR基因座复合扩增及其单倍型

多个Y STR基因座复合扩增在国内外已得到应用[1、2 ] 。本文作者报道用银染法复合扩增DYS389II、DYS389I、DYS390、GATA A7 2和DYS393等 5个Y STR基因座 ,并对广东汉族 4 15名无关男性个体进行基因分型调查。1　材料和方法1 1　材料4 15份广东汉族无关男性个体血样来自本室日常检案标本 ,用Chelex 10 0法提取DNA。1 2　引物序列DYS389Ⅱ、DYS389Ⅰ、DYS390、GATA A7 2和DYS393等 5个基因座引物序列见文献 [3、 4 ],由上海生物工程有限公司合成。1 3　PCR扩增条件总体积 2 5 μl,内含dNTP 4 2 0 μmol/L ,MgCl23 0mm…     

改良IPEP法用于痕量DNA检测的实验研究

目的探讨改良扩增前引物延伸(IPEP)法对痕量DNA样本STR检测分型的效果。方法用改良IPEP法对痕量样品DNA进行全基因组扩增(WGA),扩增产物用实时荧光定量PCR技术定量、用AmpFLSTR~ Indentifiler~试剂盒作基因型检测。结果该方法可增加模板DNA约200~1100倍。基因组DNA不低于0.025ng时,可获得15个STR基因座和Amelogenin性别基因座的分型结果。基因组DNA0.01~0.025ng时,可获得9个以上基因座的分型结果。结论改良IPEP法可有效提高痕量DNA样本STR分型检验的灵敏度,有较好的实用价值。