Amelogenin等位基因丢失的研究现状

Amelogenin基因座作为性别标记包含于常用的商品化STR分型试剂盒中,被应用于法医亲子鉴定、个体识别和DNA数据库等。大量报道显示Amelogenin基因可发生变异,导致X染色体或Y染色体特异性产物扩增失败,即AMELX或AMELY丢失。AMELY丢失可导致性别判断错误,性别错判可误导侦查方向。下面对近年来国内外Amelogenin基因座等位基因丢失现象的研究现状进行综述,探讨Amelogenin基因座的变异频率、变异类型、变异机制及其对性别鉴定的影响和应对方法,为准确地进行法医物证性别鉴定提供帮助。     

Amelogenin基因遗传变异及其法医学应用研究进展

人类牙釉质蛋白基因(Amelogenin, AMEL)为X、Y染色体同源基因,分别称为AMEL-X和AMEL-Y。根据二者在扩增序列大小的不同可以确定性别,在法医学实践和临床医学等应用中具有重要意义。但是,AMEL基因在不同个体和人群中的遗传变异而导致性别决定并不是100%准确;通常由于特异性产物扩增异常,有可能导致性别错判。本文重点从AMEL基因的遗传变异、分型技术、以及引起性别误判的应对策略方面进行综述。     

Y染色体Amelogenin基因变异1例

性别鉴定是法医物证学的一项重要检验,准确的性别鉴定能给案件侦破提供非常有价值的侦查线索。目前应用DNA检验技术进行性别鉴定最常用的是用一对X-Y同源引物,扩增Amelogenin片段,男性个体获得X染色体和Y染色体特异的2种产物片段,而女性仅有X染色体特异的1种产物片段,从而可以区分性别[1]。对于现场检材,一旦确定性别即为个体识别提供了50%的否定率[2]。但这种检验方法有时会因Amelogenin基因变异而出现误判,现报道1例。1案例资料某民宅内发生一宗入室抢劫杀人案,死者王某,男,68岁,孤寡老人。现场有明显搏斗痕迹,经法医鉴定王某系被人用…     

DYS391、DYS393基因座X染色体扩增对法医鉴定影响的探讨

目的探讨提高DYS391和DYS393基因座特异性扩增方法及两基因座的X染色体扩增产物对法医学鉴定结论的影响。方法DYS391和DYS393基因座采用PCR扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳结合银染进行分析。结果稀释模板DNA浓度和提高退火温度对提高此两Y染色体基因座特异性扩增并不明显。DYS391和DYS393的X染色体扩增产物对法医学鉴定结论有误导可能性。结论在法医学鉴定尤其是性别鉴定中应谨慎应用DYS391和DYS393基因座。     

焦磷酸测序分析短片段牙釉质蛋白基因进行性别鉴定

目的采用焦磷酸测序技术分析短片段牙釉质蛋白基因进行性别鉴定并用于骨骼及腐败生物检材的检测。方法应用blast软件,确定牙釉质蛋白基因(Amel)上1段含有3个SNP位点及1个插入/缺失(indel)位点的序列作为待测靶序列,设计引物,扩增该段序列,应用焦磷酸测序技术分析扩增序列,进行性别鉴定。对方法进行准确性、灵敏度、种属特异性的测试,并用于对骨骼和高度降解DNA的检测。结果 PCR产物分别为44bp(Amel X)和45bp(Amel Y),女性测序结果为:G/G,T/T,…/…,C/C,男性测序结果为:G/T,T/A,…/C,C/A,分型图谱清晰。应用本文方法检测100份已知性别的DNA样本,结果均正确无误,方法最低DNA模板量为0.5ng,具有较好的人类种属特异性。用于高度降解DNA分析,较IdentifilerTM试剂盒具有更高的成功率且骨骼样本也得到清晰的分型结果。结论本文采用焦磷酸测序技术分析Amel的方法在法医学性别鉴定中有较好的应用价值。     

PCR扩增ZFY/ZFX基因鉴定人类干血痕性别

应用 PCR 技术同时扩增人 ZFY 和 ZFX 基因特异的 DNA 序列,在男性血痕中可检测到两种扩增产物,即340bp 长的 ZFY 基因及488bp 长的 ZFX 基因特异 DNA 片段;在女性血痕中仅可检测到488bp 长的 ZFX 基因特异 DNA 片段,据此判定干血痕性别。干血痕的最小检出需要量为0.125μl 血液量的血痕。室温保存10年的血痕可以准确判定性别。ZFY 基因位于 Y 染色体短臂。本方法同时检测两条性染色体,可以避免由于扩增失败或 Y 染色体长臂变异出现的假阴性或假阳性。扩增产物经琼脂糖凝胶电泳即可区分。     

考古样品中Amelogenin同源基因的提取和检测

目的利用人类性染色体Amelogenin同源基因在X、Y染色体上序列长度的差异,选择设计引物,对考古样本进行古DNA性别信息研究。方法采用苯酚/氯仿-二氧化硅-超滤离心方法提取东岭墓葬群殉人骨骼、牙齿古DNA,PCR扩增,非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)分离和检测古DNA扩增片段。结果8个墓葬16个样品中有7个样品出现阳性扩增检测,目标基因片段清楚,男性为二条带(X、Y),女性为一条带(X),牙齿样品检测成功率优于骨骼样品。结论改进的苯酚/氯仿—二氧化硅—超滤分离法是较好的古DNA提取方法,具有降低PCR抑制剂、消耗成本低和提取成功率高等特点。基于人类X、Y染色体Amelogenin同源基因的古DNA性别分析方法可成为分子考古重要的技术方法。     

中国3个群体的DYS385基因座的遗传多态性

<正> DYS385基因座是Y染色体上以GAAA为重复单位的四核苷酸重复序列,目前已发现16种等位基因,重复单位数目为9～24,片段长度大小为360～420 bp,DYS385基因座的一对引物同Y染色体上的两个基因座结合,扩增出片段大小有交叉的两组产物,两组产物连锁组成单倍型。DYS385被认为是Y染色体多态性最好的STR基因座之一,在法医学个人识别和亲子鉴定中具有重要的应用价值[1、2]。本文作者调查了DYS385基因座在中国北方汉族、维吾尔族和哈萨族群体的多态性,现报告如下。     

扩增X—Y同源Amelogenin基因内含子在性别鉴定中的应用研究

本文用一对针对X－Y同源的Amelogenin基因第一内含子的引物，于同一试管中分别扩增出针对于x和Y染色体的特异性DNA片段：106bp及112bp的PCR产物，经聚丙烯酰胺凝胶电泳后用银染法观察扩增结果，取得了满意的效果．对50pgDNA模板室温放置16年的血痕及单根毛发、烟头等检材均可得到明确的性别鉴定结果．本实验证明该方法简便、灵敏、可靠、特别适用于腐败降解检材的法医学性别鉴定．     

抗污染扩增试剂在法医物证检验中的应用

客观、准确的法医遗传检验结果是作出准确鉴定意见的基础。随着检验设备、扩增检测试剂检验灵敏度日益增加,防控实验室污染、样品污染的压力与日俱增,其中PCR扩增产物对检测结果的污染最难防控。本文测试一款抗污染扩增试剂盒NH-18A,该试剂盒包含16个常染色体STR基因座,1个性别识别基因座（Amel）和一个Y染色体插入缺失基因座（Indel）,NH-18A通过STR复合扩增可得到含有尿嘧啶碱基的DNA片段,该类型的DNA片段在50℃时可被尿嘧啶DNA糖基化酶（UDG）高效水解,每次新一轮PCR扩增前增加一步50℃保温孵育可以彻底消除既往扩增产物对结果的污染威胁。经实验验证,NH-18A具有优异的抗扩增产物污染能力,且替换碱基扩增不改变DNA分型结果,检测灵敏度和DNA产物片段稳定性不降低,后续电泳分析不受影响。利用此试剂盒可以有效消除扩增产物对鉴定结果的污染。     

EX16+10Y试剂盒检测新疆维吾尔族人群的效能

目的检验EX16+10Y试剂盒在新疆维吾尔族人群中的法医学检测效能。方法采集4 620个新疆地区维吾尔族男性个体血样,用EX16+10Y试剂盒进行扩增,用3130xl基因分析仪对扩增产物进行分型。结果获得4 620个新疆维吾尔族男性个体的15个常染色体STR基因座和10个Y染色体STR基因座的完整分型图谱。15个常染色体STR基因座分布均符合Hardy-Weinberg平衡,STR基因座的杂合度为0.637~0.838,多态信息含量为0.580~0.860,个体识别率为0.811~0.978。10个Y染色体STR基因座有766种单倍型。结论 EX16+10Y试剂盒检测结果准确可靠,可用于实际工作中同时完成个体识别和男性家系排查。     

联合Y-STR库及ITO法破获13年命案积案1例

正Y-STR基因座位于Y染色体的非重组区,是连锁遗传,可进行未知个体识别、父系鉴定、从混合斑中检验未知男性以及验证无Amel(amelogenin)基因座的男性等,所以Y-STR在法医学领域的应用具有重大意义[1,2]。本案利用Y-STR数据库,锁定了男性家系,结合亲缘关系计算,最终确定了犯罪嫌疑人,为案件的顺利侦破发挥了关键作用。     

一种用于降解DNA样本的性别鉴定方法

目的 建立一种采用PCR技术对降解DNA样本进行性别鉴定的新方法。方法 采用针对amelogenin基因X染色体外显子3bp缺失设计的引物AMELU1及AMELD1,对在室温环境下放置5－15年的男、女血痕标本各50例、毛发各20例、骨骼各20例以及现场提取5－－20天的男、女腐败肌肉各10例标本中提取的降解DNA样本进行扩增。用PGA（9％T,3％C）电泳、银染显带检测扩增产物。结果 所有样本均得到正确结果,男性检材表现为83bp的Y特异性及80bp的X特异性2条谱带,而女性检材仅有1条80bp的X特异性谱带。结论 用针对amelogenin基因X染色体外显子3bp缺失设计的引物AMELU1及AMELD1鉴定性别的方法灵敏、可靠、方便,是降解DNA检材性别鉴定十分理想的方法。     

一种用于降解DNA样本的性别鉴定方法

目的　建立一种采用PCR技术对降解DNA样本进行性别鉴定的新方法。　方法　采用针对amelogenin基因X染色体外显子 3bp缺失设计的引物AMELU1及AMELD1,对在室温环境下放置 5～ 15年的男、女血痕标本各 5 0例、毛发各 2 0例、骨骼各 2 0例以及现场提取 5 - - 2 0天的男、女腐败肌肉各 10例标本中提取的降解DNA样本进行扩增。用PAG( 9%T ,3 %C)电泳、银染显带检测扩增产物。　结果　所有样本均得到正确结果 ,男性检材表现为 83bp的Y特异性及 80bp的X特异性 2条谱带 ,而女性检材仅有 1条 80bp的X特异性谱带。　结论　用针对amelogenin基因X染色体外显子 3bp缺失设计的引物AMELU1及AMELD1鉴定性别的方法灵敏、可靠、方便 ,是降解DNA检材性别鉴定十分理想的方法。     

性别鉴定中amelogenin基因座变异的研究进展

Amelogenin基因座变异,分为amelogenin引物结合区突变和包含amelogenin基因座的Y染色体微缺失两种类型,以后者最为常见。Amelogenin引物结合区突变的发生机制是核苷酸点突变,包含amelogenin的Y染色体微缺失的发生机制可能是非等位同源重组或者非同源末端连接。在全世界人群中,位于印度次大陆地区的印度人群、斯里兰卡人群和尼泊尔人群amelogenin变异率非常高。Amelogenin变异对生育能力和表型影响非常小,但在性别鉴定中会导致错误的性别鉴定结果。采用包含常染色体STR基因座、amelogenin基因座和多个Y-STR基因座的复合扩增试剂盒进行检测可有效避免因amelogenin变异导致的性别误判。     

陈旧骨骼及牙齿的性别检验

为分析陈旧骨骼及牙齿的性别，建立了从陈旧人骨骼和牙齿中提出DNA的方法。通过PCR技术扩增，得到X－Y染色体上的单拷贝同源基因片断（AmelogeninGene）。结果显示，从死亡后2年、4年、7年和10年的4个骨骼和牙齿样品中，均成功地获得了特异的PCR扩增片段。女性为单一的106bp条带，男性为106bp和112bp两条谱带。其快速、简单、可靠，为陈旧骨骼和牙齿的性别鉴定提供了方法。     

男性个体Amelogenin基因座Y片段缺失1例

在法医学实践中．扩增Amelogenin基因是进行生物样本的性别鉴定的主要方法，并为大多数的商品化法医鉴定试剂盒如AmpFlSTR IdentifierTM（ABI）、PowerPlex（Promega）等所采用。但个体的Amelogenin基因如果发生突变，致X或Y特异片段扩增失败，则可能导致错误的性别判定。     

15个常染色体和10个Y-STR基因座复合扩增试剂盒的研发

目的建立法医物证学常染色体和Y染色体综合检测的方法。方法选择常用的常染色体STR基因座和Y染色体STR基因座,设计复合扩增引物,形成五色荧光标记复合扩增试剂盒。结果开发出一个五色荧光标记复合扩增试剂盒,可同时对15个常染色体STR基因座、1个性别基因座和10个Y染色体STR基因座进行分型检测。结论 15个常染色体STR加10个Y染色体STR检测试剂盒结合毛细管电泳凝胶进行STR分型,结果准确可靠,在法医学案件检验及数据库建设等方面有良好的应用前景。     

扩增X—Y染色体同源性基因鉴定骨性别

对于完整或较完整的人体骨骼，根据骨的形态特点或采用仪器测量、X线检查等进行骨性别判定，其准确性较高。而在碎尸、白骨化、生物考古、灾难性事故等情况残存的遗骸就难以用形态学方法确定性别。本文采用PCR方法，特异性扩增骨组织X－Y染色体DNA同源性基因序列，鉴定骨组织的性别，现报告如下。材料和方法一、实验材料骨组织取自本系户检肋骨或附属医院骨科手术截肢骨，约4cm2大小，共46例骨样本，同时取相对应个体的血样作对照。二、实验方法1．引物合成根据NakahoriY设计[1]，X－Y染色体同源性引物序列由美国Researchgenetics合成…     

用引物Y_3、Y_4和PCR方法鉴定性别的法医学应用

用Y3、Y4和Alu9．1、Alug．2两对引物和PCR方法检测陈旧血痕和毛根的性别获得成功。引物Y3、Y4扩增的靶序列位于Y染色体特异3．4Kb重复序列中，扩增产物为460bp；引物Alu9．1、Alu9.2用以扩增男女共有的Alu重复序列，扩增产物为130bP。室温保存13年之久的19例脐带血血痕（男性9冽，女性10例）和室温保存10～11个月的10例已知性别自然脱落毛根（男性6例，女性4例）的性别测定结果均正确；对一起凶杀案的血痕性别测定为定案提供了重要证据。本方法简化了样品的前处理过程。